P35269  T2FA_HUMAN

Gene name: GTF2F1   Description: General transcription factor IIF subunit 1

Length: 517    GTS: 1.962e-06   GTS percentile: 0.639     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 322      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAALGPSSQNVTEYVVRVPKNTTKKYNIMAFNAADKVNFATWNQARLERDLSNKKIYQEEEMPESGAGSEFNRKLREEARRKKYGIVLKEFRPEDQPWLL 100
BenignSAV:       V                                                                                                 
gnomAD_SAV:      SPDLR# H    I G LT    NC     S    LSL M   VP KQ#SI    H K K SKLD#     HN WKK     #  I EA W KG   VF
Conservation:  7122524321246536647763297676967967978324441974666657433453557233134666543534485564535434435223344723
SS_PSIPRED:              EEEEEEEE      EEEEEEE       HHH     EEE                       HHHHHHHHHHHH             EEE
SS_SPIDER3:              EEEEEEEE       EEEEEE     E HHH    EEH                        HHHHHHHHHH H             EEE
SS_PSSPRED:               EEEEEEE      EEEEEE                      HHH                 HHHHHHHHHHHH               E
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD                                               DDDDDDDDDDDDDDDDD                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                             DDDDDDDDDDDDDDD                                
DO_IUPRED2A:   DDD         DDDD                                    DDDDDDDD DDD  DDDDDDDDD                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RVNGKSGRKFKGIKKGGVTENTSYYIFTQCPDGAFEAFPVHNWYNFTPLARHRTLTAEEAEEEWERRNKVLNHFSIMQQRRLKDQDQDEDEEEKEKRGRR 200
gnomAD_SAV:    WI#C   K   V     IKG M DHLL    N   K   M S *   L  W HMV#DK  K  C        R T  * Q     VE##E  AE  C#C 
Conservation:  4335235263693667544645466674443453674576236454263323654625343345344545465646648565442314454230251122
SS_PSIPRED:    EE     EEEEEEEE      EEEEEEEE     EEEEE                 HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    EEE    EEEEEEEEE      EEEEEEE     EEEEEE  EEE  E        HHHHHHHHH       HHHHHHHHHH      HHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    EE      EEEEEE        EEEEEEE     EEEEE                 HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                              DDDD                  DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                DDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:             DDDD                                        DDDDDDDDD     D     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                             T                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KASELRIHDLEDDLEMSSDASDASGEEGGRVPKAKKKAPLAKGGRKKKKKKGSDDEAFEDSDDGDFEGQEVDYMSDGSSSSQEEPESKAKAPQQEEGPKG 300
gnomAD_SAV:     E#KVC RN * H  L TN G  G   RD   RD   VLPV  C     REV  #KV#K  N   L#S D  CVL C  G   KA IE ET#K#*KVLRS
Conservation:  5224455666656643563151140264211251430000133343665342340551666767615745677444255731250304242032443989
SS_PSIPRED:     HHHH       HHH                 HHH           HHH     HHHH           EE             HHHH            
SS_SPIDER3:                                    HHH                    H                            HHH             
SS_PSSPRED:                                    HHHHH        HHH                                     HHH            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                      SS  S  S                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VDEQSDSSEESEEEKPPEEDKEEEEEKKAPTPQEKKRRKDSSEESDSSEESDIDSEASSALFMAKKKTPPKRERKPSGGSSRGNSRPGTPSAEGGSTSST 400
gnomAD_SAV:    IN HRNGT D#QK QL  DNEG    R   IL D QC TEGGKGL  A*D NM IK    V  VQ TA  R #Q LLE    V  CS M  T    ICF 
Conservation:  6992545645679843354455675446232514456667574585544677652331676672444267562341533342404683261040313233
SS_PSIPRED:                        HHHHHHHH   HHHHHHH                HHHHHHHHHH                                  HH
SS_SPIDER3:                        HHHHHH       HHHHH                 HHHHHHHHH                                 HHH
SS_PSSPRED:                        HHHHHHHH   HHHHHHH                    HHHHHHH                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                    T                                             S  SS   S   T S         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRAAASKLEQGKRVSEMPAAKRLRLDTGPQSLSGKSTPQPPSGKTTPNSGDVQVTEDAVRRYLTRKPMTTKDLLKKFQTKKTGLSSEQTVNVLAQILKRL 500
gnomAD_SAV:     PV      R  Q  K  TD Q#W  M        LAA    A  # HIVNM  P N MC  M    # I        A   R   K    L # VI Q 
Conservation:  3556512843560221033334322311322014122533127522522544564335346552638595544434334433344332344254433446
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   HH   HHH                                  HHHHHHHHHH    HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH       HHHHH                                 HHHHHHHH      HHHHHHHH H       HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH                                                 HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD DDDDDDDDDD
MODRES_P:                                    S S  ST        T  S                                                   
MODRES_A:            K                                                                                             

                       10       
AA:            NPERKMINDKMHFSLKE 517
gnomAD_SAV:     LKH    N T   F#*
Conservation:  34433032543422521
SS_PSIPRED:     HHHEEE  EEEEEE  
SS_SPIDER3:         EE  EEEEEE  
SS_PSSPRED:     HHHHHH   EEEEE  
DO_DISOPRED3:                   
DO_SPOTD:                       
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD