P35711  SOX5_HUMAN

Gene name: SOX5   Description: Transcription factor SOX-5

Length: 763    GTS: 3.48e-07   GTS percentile: 0.016     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 12      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 244      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLTDPDLPQEFERMSSKRPASPYGEADGEVAMVTSRQKVEEEESDGLPAFHLPLHVSFPNKPHSEEFQPVSLLTQETCGHRTPTSQHNTMEVDGNKVMSS 100
gnomAD_SAV:     F A     *      TGAS L EK   #AVI   THQ  Q   ERFL      PG# SSRSQ K#       AKAA  R   S   S I F V   #  
Conservation:  2222222222222623131137410323421111212103224111101024634210111210412221011011000122211112022043362222
SS_PSIPRED:            HHHHHH                        HHH                       HH                                  
SS_SPIDER3:            HHHHHH               E         H                                                            
SS_PSSPRED:            HHHHHHH                                                                                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                          S                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FAPHNSSTSPQKAEEGGRQSGESLSSTALGTPERRKGSLADVVDTLKQRKMEELIKNEPEETPSIEKLLSKDWKDKLLAMGSGNFGEIKGTPESLAEKER 200
gnomAD_SAV:              E    A Q      Y        WH        GN       A     L  IA        G   E   T L K  K     KR      
Conservation:  2313325469050441173326022201377779756777776657557666656546454226242566669776343445434355676354446562
SS_PSIPRED:                                           HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH  HHHHHHHHH             HHHHHHH
SS_SPIDER3:                                               HHHHHHHHHHHHH        HHHH    HHHHHHH               HHHHHH
SS_PSSPRED:                                                 HHHHHHHHHHHH       HHHHH   HHHHHHH             HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      D DDDDDD     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                    T                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLMGMINQLTSLREQLLAAHDEQKKLAASQIEKQRQQMELAKQQQEQIARQQQQLLQQQHKINLLQQQIQVQGQLPPLMIPVFPPDQRTLAAAAQQGFLL 300
gnomAD_SAV:      V   S     Q      R#K     V  T   H  R       Q          R H   S            S     L  S    VTT     LFF
Conservation:  4443641362445434324343354232554436564456564543552434434543343334454343312123533353453445333523464542
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EE    HHH    HHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        E            HH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHH     
DO_DISOPRED3:                    D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD                DDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDD       D     D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDD                            D   DD     DDD     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPGFSYKAGCSDPYPVQLIPTTMAAAAAATPGLGPLQLQQLYAAQLAAMQVSPGGKLPGIPQGNLGAAVSPTSIHTDKSTNSPPPKSKDEVAQPLNLSAK 400
PathogenicSAV:  S                                                                                                  
BenignSAV:                                                                  P                                      
gnomAD_SAV:        T    FCELH L    A     TS A      H P  HT H  P  I      AR  P   DGS FSI V   RN  G L                
Conservation:  4343234422222443335332422452121532352534434544548545354721113324112227942142461224511305523388898866
SS_PSIPRED:                          HHHHHH       HHHHHHHHHHHHH                                                    
SS_SPIDER3:                          HHHHHH         HHHHHHHHHHH                                                    
SS_PSSPRED:                          HHHHHH        HHHHHHHHHHHH                                                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                       DD  D D DDD                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                           S T                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKTSDGKSPTSPTSPHMPALRINSGAGPLKASVPAALASPSARVSTIGYLNDHDAVTKAIQEARQMKEQLRREQQVLDGKVAVVNSLGLNNCRTEKEKTT 500
gnomAD_SAV:          N HI  I  LLTV T SCV D    A   V          T         I      Q      QWD  M N    A KN      QI      
Conservation:  7631614363763422231251322020102224232221023124435557675636964796367754477641365822233443342531273611
SS_PSIPRED:                                                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHH 
SS_SPIDER3:                                      H                   H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHH   
SS_PSSPRED:                                                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDD     DD DDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D      DDD DDDDDDDDD
MODRES_P:                S  S                        S                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LESLTQQLAVKQNEEGKFSHAMMDFNLSGDSDGSAGVSESRIYRESRGRGSNEPHIKRPMNAFMVWAKDERRKILQAFPDMHNSNISKILGSRWKAMTNL 600
PathogenicSAV:                                                          C  H         #                N        V   
gnomAD_SAV:        I    F       L   VT  S R  Y  NT   K       Q H  S TY               Q                     C  S   V
Conservation:  4324346533621442834535346324652451222275957954967222697777999999999997999999797977976474457354344445
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH          HH                              HHH    HHH    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH  HH
SS_SPIDER3:     H   HHHHH         HHHH                   H                H HHHH  HHHHHHHHHH   H  HHHHHHHHHHHHH  HH
SS_PSSPRED:                                                         HHH           HHHHHHHHHH      HHHHHHH HHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDD  DDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD              DD                      
DNA_BIND:                                                             IKRPMNAFMVWAKDERRKILQAFPDMHNSNISKILGSRWKAMTNL

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKQPYYEEQARLSKQHLEKYPDYKYKPRPKRTCLVDGKKLRIGEYKAIMRNRRQEMRQYFNVGQQAQIPIATAGVVYPGAIAMAGMPSPHLPSEHSSVSS 700
PathogenicSAV:     #     G           C        N                                                                    
gnomAD_SAV:                                S                    H      W    ## KT F  VSDD     T T  V#T T        M  
Conservation:  4444355575477537777795779577757794465447555957547747977577574554422554112422654241331234855563453033
SS_PSIPRED:    H HHHHHHHHHHHHHHHHH             EEE          HHHHH   HHHHHH                                         
SS_SPIDER3:    H  HHHHHHHHHHHHHHHH            E      E  E  HHHHHH HHHHH                      HHH                   
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHH                           HHHHHHHHHHHHH                                         
DO_DISOPRED3:  D      DDDD                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:       DDDDD DD    DDDDDDD                                 D DDD                       DDDDDDDDDDDDDDDD
DNA_BIND:      EKQPYYEEQARLSKQHLEKYPDYK                                                                            

                       10        20        30        40        50        60   
AA:            SPEPGMPVIQSTYGVKGEEPHIKEEIQAEDINGEIYDEYDEEEDDPDVDYGSDSENHIAGQAN 763
gnomAD_SAV:           IT  I SA    RR   D #PK     M V  NK   Y #   # YR  R   K  
Conservation:  454511201121320503010222222032142428764222456352663753522112112
SS_PSIPRED:                         HHHHH                           HH        
SS_SPIDER3:             E            HHHH                                     
SS_PSSPRED:                                                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD