P35712  SOX6_HUMAN

Gene name: SOX6   Description: Transcription factor SOX-6

Length: 828    GTS: 6.392e-07   GTS percentile: 0.083     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 348      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSSKQATSPFACAADGEDAMTQDLTSREKEEGSDQHVASHLPLHPIMHNKPHSEELPTLVSTIQQDADWDSVLSSQQRMESENNKLCSLYSFRNTSTSPH 100
gnomAD_SAV:       E TI  S       ETVN Y N   EK  R# P    V   R RQ  RQF       NS     N# RI     K D      R QF LQ I A   
Conservation:  5321222363121264321222322232033102110112453321011221142221012112110022321111202304436312224134365790
SS_PSIPRED:                             HHHHH              HHH                          HHHHHHHH                   
SS_SPIDER3:                     E                          HH                                                      
SS_PSSPRED:                              HHH                                                                       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD  DDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KPDEGSRDREIMTSVTFGTPERRKGSLADVVDTLKQKKLEEMTRTEQEDSSCMEKLLSKDWKEKMERLNTSELLGEIKGTPESLAEKERQLSTMITQLIS 200
gnomAD_SAV:    NLN#  W H TT G       H RW   E   A      GA  # D D F# #AT    G  G  QK    D P    V#A   E   Q     VA   I
Conservation:  5045217336022311386579857777777767657665656546454336342646559776443555442445557646664546246323413533
SS_PSIPRED:              HH               HHHHHHHHHHHHHHHHHH HH HHHHHHHH HHHHHHHHH  HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:               H                  HHHHHHHHHHHHHHH H  HHHHHHH  H HHHHH    HHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                     HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                          DD DDD                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          
MODRES_P:                        T                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LREQLLAAHDEQKKLAASQIEKQRQQMDLARQQQEQIARQQQQLLQQQHKINLLQQQIQVQGHMPPLMIPIFPHDQRTLAAAAAAQQGFLFPPGITYKPG 300
gnomAD_SAV:     W       G E Q S#      WH    TH      V              I          #      M    RQ  ETV #   R  L#T K     
Conservation:  5443443435455525355544755334655344345244544354334443565544422323353445355354534453533564652444312436
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHH              
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHH              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:               DDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                  DDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             D        DDDDD DD          D                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DNYPVQFIPSTMAAAAASGLSPLQLQKGHVSHPQINQRLKGLSDRFGRNLDTFEHGGGHSYNHKQIEQLYAAQLASMQVSPGAKMPSTPQPPNTAGTVSP 400
gnomAD_SAV:     H AIH   T      P  F L     D  F      #    N H#  IW    P V   ##Y K#D F TTL   T L S E V  I  A DA  MI  
Conservation:  2234343445343321225315525322222222222222222222222222222222222222222544554453555645472211353142222248
SS_PSIPRED:             HHHHHHHH                 HHHHH            HH          HHHHHHHHHHHH                         
SS_SPIDER3:               HHHHHH                                             HHHHHHHHHHHHHH                        
SS_PSSPRED:              HHHHHHHH                                             HHHHHHHHHHHH                         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    D     DD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                                        S 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TGIKNEKRGTSPVTQVKDEAAAQPLNLSSRPKTAEPVKSPTSPTQNLFPASKTSPVNLPNKSSIPSPIGGSLGRGSSLDILSSLNSPALFGDQDTVMKAI 500
gnomAD_SAV:    I MES #G#   A   TEK V    S   Q  RV   E QK       Q NN   I   D   L   T  RR  EY        S  D        T   
Conservation:  4213246122342131545222656676456431512435265332223226132121212312533322212523543556443333555767563696
SS_PSIPRED:                                                                                  HHH           HHHHHHHH
SS_SPIDER3:                    H HHH                                                                         HHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                                                 HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDD
MODRES_P:      T                                     S  S                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEARKMREQIQREQQQQQPHGVDGKLSSINNMGLNSCRNEKERTRFENLGPQLTGKSNEDGKLGPGVIDLTRPEDAEGSKAMNGSAAKLQQYYCWPTGGA 600
gnomAD_SAV:      V# #Q    W RH  RTRD H#   YMH  # K        AH   VE H MRET DY    LC N  AW      N     F TEQ  C    AAV 
Conservation:  4796367754587223322223658222344334435312536124424356533622462834534345324652342222222222222222222212
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH           HHHHHHHH                         HHH          HHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH                       HHHHH                                         HHHH           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH                          HHH                                        HHHHHHH         
DO_DISOPRED3:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVAEARVYRDARGRASSEPHIKRPMNAFMVWAKDERRKILQAFPDMHNSNISKILGSRWKSMSNQEKQPYYEEQARLSKIHLEKYPNYKYKPRPKRTCIV 700
gnomAD_SAV:    N T  Q N  T S##  Q           I           S  N            H      R  K       #          D        C    
Conservation:  2227695796496732269777799999999999799999979797797657545745545454544444555754775377777967795777577955
SS_PSIPRED:     HHH              HHH   HHHHHHH HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH  HHH    HHHHHHHHHHHHHH             EEE
SS_SPIDER3:     H HHHHH H          H   HHHHHHH HHHHHHHHHH   HH HHHHHHHHHHHH   HHH  H HHHHHHHHHHHHHH            E E 
SS_PSSPRED:                      HHH     EEEEE HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                      D      DDDDD D                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:        DDDDDDDDDDDDDDD                     DD          DDDDDD     DDDDDDD DD                          
DNA_BIND:                          IKRPMNAFMVWAKDERRKILQAFPDMHNSNISKILGSRWKSMSNQEKQPYYEEQARLSKIHLEKYPNYK           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DGKKLRIGEYKQLMRSRRQEMRQFFTVGQQPQIPITTGTGVVYPGAITMATTTPSPQMTSDCSSTSASPEPSLPVIQSTYGMKTDGGSLAGNEMINGEDE 800
gnomAD_SAV:          T       K Q   I  L  A   A  RV   A IMC S T   S   L    T    S #      L  R  C #R  DR      T S GN 
Conservation:  6644765695764775797757767455452355422345236542414322235655564444133454521302131320503201213121231345
SS_PSIPRED:             HHHHHH   HHHHHH                                                                           H
SS_SPIDER3:       E     HHHHHHHHHHHH                                                                               
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHHH                                                                             
DO_DISOPRED3:  DD    D        D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    D       DDDD       DDDDDDDDDDD   DDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        
AA:            MEMYDDYEDDPKSDYSSENEAPEAVSAN 828
gnomAD_SAV:    V  F  C       CG   G L      
Conservation:  3428764556352663753522222225
SS_PSIPRED:    HHH                         
SS_SPIDER3:                                
SS_PSSPRED:                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD