P35913  PDE6B_HUMAN

Gene name: PDE6B   Description: Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta

Length: 854    GTS: 3.524e-06   GTS percentile: 0.956     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 25      BenignSAV: 11      gnomAD_SAV: 583      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSLSEEQARSFLDQNPDFARQYFGKKLSPENVAAACEDGCPPDCDSLRDLCQVEESTALLELVQDMQESINMERVVFKVLRRLCTLLQADRCSLFMYRQR 100
PathogenicSAV: V                                                                        C                       H H
BenignSAV:             Q                        V             QY                                                   
gnomAD_SAV:    V  I  RTP L # T N VL    RQQRR K  V  K R LTYWN# WG   G D MVQQ*P HYVRDNVDT#CM  #L WCFYNVP* NS NF V*CRH
Conservation:  8132122521672163065107611131221100121000001000201211126303225440033210126113312533430340554374711927
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHH HHHHHHHH     HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE  
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHH HHHHHHH      HHHHHHHH          HHH  HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE  
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHH HHHHHHHH     HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE  
DO_DISOPRED3:  DDD                                                                                                 
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NGVAELATRLFSVQPDSVLEDCLVPPDSEIVFPLDIGVVGHVAQTKKMVNVEDVAECPHFSSFADELTDYKTKNMLATPIMNGKDVVAVIMAVNKLNGPF 200
PathogenicSAV:                                           D                                                         
BenignSAV:                   A         A                                        K                                  
gnomAD_SAV:     #M K   T   M AGNIMG #  A#N A IL P  R #S L   RNL  FK    SSY IL V KP  C    I    # #  EFMVL  TA  P SL 
Conservation:  7734855616647112403415360511746483738557145126510661540421285144812534071446418440457346834447802310
SS_PSIPRED:       EEEEEEEEE      HHH                HHHEEE     EEE            HHH       EEEEEEEE    EEEEEEEEE      
SS_SPIDER3:       EEEEEEEE       HH         EE      HHHHHHHH  EEE    H       HHHH       EEEEEEEE    EEEEEEEE       
SS_PSSPRED:       HHHHHHHH                 EEEEE     EEEEEE   EEEE          HHHHH    HHH EEE        EEEEEEE        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FTSEDEDVFLKYLNFATLYLKIYHLSYLHNCETRRGQVLLWSANKVFEELTDIERQFHKAFYTVRAYLNCERYSVGLLDMTKEKEFFDVWSVLMGESQPY 300
PathogenicSAV:                   H        H                             N                                          
BenignSAV:                H               I                                                                        
gnomAD_SAV:       *#K    TH    M H  FC    I   KMCHS   M LD   I   M TK HL RS  M Q FP #KW  L F GVSEK   S M F    # *L 
Conservation:  7410741340573143241321252257344837748563456795686689568888855966815624665555888556365655283335662545
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE     EEEEEHHHH       
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEE     E EEEHHHH       
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE      HH HHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                               DDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGPRTPDGREIVFYKVIDYVLHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICNIMNASADEMFKFQEGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVAT 400
BenignSAV:                        I                                                                                
gnomAD_SAV:    #CLCM N Q   S  M N#I  D Q  R  L H GY GS TRS S  M A SC # T    T KI R  K TQ N W*    M  IRVI  T*K    TA
Conservation:  1663686866516664465353438453644394169937255683555545367644532255261792344824862535786486655354546655
SS_PSIPRED:             EEEEEEEEEE               HHHHHHH   HHHHHHH  EEEEE                     EEEEEEEEEE     EEEEEE
SS_SPIDER3:             EEEEEEEEEEEE   EEEEE     HHHHHHH  HHHHHHHH   EEE              H       EEEEEEEEEE     EEEEEE
SS_PSSPRED:             EEEEEEEEEE               HHHHHHHH  HHHHHHH   EEE     HHH              EEEEEEE        EEEEEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDD               DDDDDDDDD                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FYNRKDGKPFDEQDEVLMESLTQFLGWSVMNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKEPADCDEDELGEILKEELPGPTTFD 500
gnomAD_SAV:    L     R    V EQ  TD VI LPDC EV INI N IK  Q C# MT*HV    MRYNGNK   T T KVH R KL#EF#D K  K    K #   IL#
Conservation:  6569374677542551536367658997266474574354443374643544444347211532169333213212303744235004701157120113
SS_PSIPRED:    EEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:    EEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  E HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH           
SS_PSSPRED:    EEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:               D                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQIPQEVLVRFLFSISKGYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGLCHDID 600
PathogenicSAV:                P         KP       N                Q    #  C               D     H                  
gnomAD_SAV:    V D Y  N ###QV#  I     #  VCM #N  NS K   W    S    W   CL  CR     *M     VSS  R CCM     TI I V     N
Conservation:  7328385831155128634863475554572764662559565446436659164455845555565554467376154154457634655567667666
SS_PSIPRED:     EEEE       HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    E EEE       HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH    HH   HHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    EEEEE        HHHHHHHHHHHHHH  EEE    HHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHH    HHHH  HHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                                                     H                                   HD  
ACT_SITE:                                                              H                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HRGTNNLYQMKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHEHVIHLMDIAIIATDLALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLS 700
PathogenicSAV:                           G                                        G                              R 
BenignSAV:                                                          D                                              
gnomAD_SAV:     CSIY   L Q   R  Q #SPLV #Q   K     ILQK#V V *# KQG* QL    L  T MT   S    NTVT * F  D NIHP RN ##Q# T
Conservation:  6698579573682346858665645886884365366144146843453428141424535549677896955768457576763320423012241543
SS_PSIPRED:         HHHHHH   HHHHH    HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHH  
SS_SPIDER3:          HHHHH   HHHHH    HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH      HHHHHHHH 
SS_PSSPRED:            HHHH  HHHHH    HHHHHHHHHHHHHH     HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LETTRKEIVMAMMMTACDLSAITKPWEVQSKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFIDFVCTFVYKEFSRFHEEILPMFDRL 800
PathogenicSAV:              L                                                             N                        
gnomAD_SAV:    V A Q*   #SVI# VYN  DL   *      T PM# K  #*V   K   YE RL IT Q EVPD        VN A   M  K  H  K    TLGQ 
Conservation:  0535688766977975775664479756544643358386946869632463428854869142369886979995999576666454560443852354
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHH    HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH         HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHH    H     HHHHHHHHHHHHHHH H   HHHHH          HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH          HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                      D                                                
METAL:                          D                                                                                  

                       10        20        30        40        50    
AA:            QNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVAAKKVGTEICNGGPAPKSSTCCIL 854
PathogenicSAV:       R                                              R
gnomAD_SAV:    * D#EQR T  VKC   A  M  E K  K E N    Q    SAEH   A    
Conservation:  118414831333143221211211102100000022222222001211021012
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H                     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  EE 
DO_DISOPRED3:                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                         
PROPEP:                                                           CIL
LIPID:                                                           C