P36406  TRI23_HUMAN

Gene name: TRIM23   Description: E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23

Length: 574    GTS: 1.582e-06   GTS percentile: 0.483     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 193      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MATLVVNKLGAGVDSGRQGSRGTAVVKVLECGVCEDVFSLQGDKVPRLLLCGHTVCHDCLTRLPLHGRAIRCPFDRQVTDLGDSGVWGLKKNFALLELLE 100
gnomAD_SAV:    T IVL KR EV     W  IQ RV   M              N I       R I      H L #  VV#G   ##    A  VF*R  N         
Conservation:  4000111200000111110001000337766562321315233454665565563543342335646442764633556559999779767675555957
SS_PSIPRED:      EEEE                   EEEEE      EE        EEE      HHHHHHH      EEE                 HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       EEE                  EEEEEE      EEE     EEEEEE    HHHHHHHH      EEE                HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      EEEE                  EEEEEEE    EEEE       EEEE   HHHHHHHHH      EEE                 HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ZN_FING:                                     CGVCEDVFSLQGDKVPRLLLCGHTVCHDCLTRLPLHGRAIRCPFDR                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLQNGPIGQYGAAEESIGISGESIIRCDEDEAHLASVYCTVCATHLCSECSQVTHSTKTLAKHRRVPLADKPHEKTMCSQHQVHAIEFVCLEEGCQTSPL 200
gnomAD_SAV:    *MR  LT  C T    T MP  N VC   E        RI       C   H            *  V         RCE  M TV    S DV    S 
Conservation:  6997722552512774332577456997764252654777796999933796267664694666679977997977594799797997596752743347
SS_PSIPRED:    HHH                    EEE    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHH     HHHHHH                 HHH  EEEEEE          
SS_SPIDER3:    HH          H  EE      EEE      HEEEEEEEEEH H  HHHHHH  HHHHHH                      EEEEEEEEE        
SS_PSSPRED:    HHHH                  E           EEEEEEHHHH          HHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:          DDDDDDDDDDDDDD                                                                              
DO_SPOTD:             DDDDDDDDD                                                      D                             
DO_IUPRED2A:                                                                  DDDD    D                            
ZN_FING:                            ESIIRCDEDEAHLASVYCTVCATHLCSECSQVTHSTKTLAKHRRVPL                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MCCVCKEYGKHQGHKHSVLEPEANQIRASILDMAHCIRTFTEEISDYSRKLVGIVQHIEGGEQIVEDGIGMAHTEHVPGTAENARSCIRAYFYDLHETLC 300
gnomAD_SAV:    V  L R #R Q      I D      *G V   SD  W    K        DEV     R   MMA   E  N      S   TW  MQ    E R  VY
Conservation:  6766777777999966369949957997999999999979979766977692477949999965666434559777579577799997997955777577
SS_PSIPRED:    EEEEEHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE      EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEE     EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     EEEHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                  DD D                                                 DD DD DD                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RQEEMALSVVDAHVREKLIWLRQQQEDMTILLSEVSAACLHCEKTLQQDDCRVVLAKQEITRLLETLQKQQQQFTEVADHIQLDASIPVTFTKDNRVHIG 400
gnomAD_SAV:    H* D  V  I  Y   E    S   Q TS  S   C V FR   I    G K       L #         *    A   L      S S     #I   
Conservation:  5777797797777777475975555765545754775577979779999999976776794649967999969976449777777779977669777977
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH       EEEE   HHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE HHHHHHHHHH HHHHHHHHH            HHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        EEEE  HHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKMEIRVVTLGLDGAGKTTILFKLKQDEFMQPIPTIGFNVETVEYKNLKFTIWDVGGKHKLRPLWKHYYLNTQAVVFVVDSSHRDRISEAHSELAKLLTE 500
BenignSAV:                                                                                    N                    
gnomAD_SAV:    T      IM    D    AV      #      S #  D        V  #         F         S       I G Y*  MT  NR  GN  M 
Conservation:  7777977757777459975759777557977999779999999599999999999997979999999975797676797997567753977679799769
SS_PSIPRED:       EEEEEEEE     HHHHHHHHH             EEEEEEEE EEEEEEE       HHHHHHH     EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:        EEEEEE      HHHHHHHHH   E         EEEEEEE  EEEEEEE        HHHH H     EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:       EEEEEEE      HHHHHHHHH             EEEEEEEE EEEEEEE      HHHHHHHH     EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                 GLDGAGKT                                   DVGGK                                          

                       10        20        30        40        50        60        70    
AA:            KELRDALLLIFANKQDVAGALSVEEITELLSLHKLCCGRSWYIQGCDARSGMGLYEGLDWLSRQLVAAGVLDVA 574
gnomAD_SAV:     G *    VV    R   A  T   S   F      YS      C  GQ  #A *#      Q    T#A  I 
Conservation:  99979999979799974374446674774969999967779467559667626444676664644664477666
SS_PSIPRED:    HHH   EEEEEE          HHHHHHHH   HH     EEEEE        HHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HHH   EEEEEEE         HHHHHHH   HHH     EEEEE        HHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH HHH      HHHHHHHH  HHH     EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH   E  
DO_DISOPRED3:                                                                          DD
DO_SPOTD:                                                                           DDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                             
NP_BIND:                   NKQD