P37268  FDFT_HUMAN

Gene name: FDFT1   Description: Squalene synthase

Length: 417    GTS: 3.831e-06   GTS percentile: 0.971     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 411      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEFVKCLGHPEEFYNLVRFRIGGKRKVMPKMDQDSLSSSLKTCYKYLNQTSRSFAAVIQALDGEMRNAVCIFYLVLRALDTLEDDMTISVEKKVPLLHNF 100
BenignSAV:                                                 R                                                       
gnomAD_SAV:     QL E VS #A LCS#   QSR RQ G LQI#*#LFN # QS# ECFS S   CS  T#  GEK  ##  V   FF*  E V  E#SV#MGR F#  NH 
Conservation:  2111002002000121000220220022212241324025226614634445443244214423255658668979897986999568334183459129
SS_PSIPRED:       HHHH  HHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH HHH      HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHH   HHHHHHHHHHHH             H  HHHHHHHHHHHH    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHE       HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHH  HHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                          R                        R                       
METAL:                                                                                        D  ED                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HSFLYQPDWRFMESKEKDRQVLEDFPTISLEFRNLAEKYQTVIADICRRMGIGMAEFLDKHVTSEQEWDKYCHYVAGLVGIGLSRLFSASEFEDPLVGED 200
gnomAD_SAV:    DCC   #H#Q R GQ N ##AV N AS TV L  VSD * IE SE##QT#DTE VD F ## IC #D EE* #C S   RV  TSILLS #   R IDD#
Conservation:  6358432294723823757389599368628855731277276155524680776566341516125552994664664449542552362554224526
SS_PSIPRED:    HHHH           HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH 
SS_SPIDER3:    HHHH          HHHHHHHHH    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       H H 
SS_PSSPRED:    HHHHH          HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TERANSMGLFLQKTNIIRDYLEDQQGGREFWPQEVWSRYVKKLGDFAKPENIDLAVQCLNELITNALHHIPDVITYLSRLRNQSVFNFCAIPQVMAIATL 300
gnomAD_SAV:      H D LD L *      EFM  #LE #D    DFCGTC E # #S#ERQSTHFSLL   #VV#S# PRMSAI IHV#  KD# L   RG   MI M#  
Conservation:  2145465556369659979656921269297934454453024277324431106619563565465383846335963644635756584564365658
STMI:                                                                                             MMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH       HHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E  HHHHHH    HHHH   H HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH   HHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                        R                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AACYNNQQVFKGAVKIRKGQAVTLMMDATNMPAVKAIIYQYMEEIYHRIPDSDPSSSKTRQIISTIRTQNLPNCQLISRSHYSPIYLSFVMLLAALSWQY 400
BenignSAV:                                                                                                P        
gnomAD_SAV:    PG CSK#HAL WPLR Q   V   I E ##ISSA# VMH C GQM R  RHPYS CRRASET#F#FWMRY  SYHR FG Q CLV  WL#V  DVV L  
Conservation:  4356662334372666567654364526335045224206523462253302442103720341032001210102023222342344223443424435
STMI:          MMMM                                                                               MMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHH  HHHH       HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH   HHHH    E  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH HHH        HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                              D                                        
BINDING:                     K R                                                                                   

                       10       
AA:            LTTLSQVTEDYVQTGEH 417
gnomAD_SAV:     ISV## I ECIH   Q
Conservation:  32212112141121121
STMI:          MMMM             
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHH  H HHHHHH    
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDD
DO_SPOTD:                DDDDDDD
DO_IUPRED2A: