P38435  VKGC_HUMAN

Gene name: GGCX   Description: Vitamin K-dependent gamma-carboxylase

Length: 758    GTS: 2.137e-06   GTS percentile: 0.701     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 10      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 360      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAVSAGSARTSPSSDKVQKDKAELISGPRQDSRIGKLLGFEWTDLSSWRRLVTLLNRPTDPASLAVFRFLFGFLMVLDIPQERGLSSLDRKYLDGLDVCR 100
BenignSAV:                                   N                                                                     
gnomAD_SAV:      E     Q   IL E PN  T  M*   PV LT   F   #PG CI#          M        #             QW F    #      Y  C
Conservation:  7101011221222210011011100201000313223574212431360236265346245324425423343242352533442312425557834475
STMI:                                                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   
SS_PSIPRED:                        HHH        HHHHHHH       HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH         
SS_SPIDER3:                                 HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH         
SS_PSSPRED:                                 HHHHHHHHH        HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       
DO_IUPRED2A:      DDD DDDDDDD   DDDDDD                                                                             
DISULFID:                                                                                                        C 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FPLLDALRPLPLDWMYLVYTIMFLGALGMMLGLCYRISCVLFLLPYWYVFLLDKTSWNNHSYLYGLLAFQLTFMDANHYWSVDGLLNAHRRNAHVPLWNY 200
gnomAD_SAV:    LL     H        P  A  L  P  VV D  HGT    L  L  *       #R H   P         L#  D H    S R VQGS   M     
Conservation:  4963315295667555356246348938443832473542263347665657655372347665885435625335355595994534265945786668
STMI:                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                           
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH        HHHHH  HH      HHHH
SS_SPIDER3:       E       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH         HH     H      HHHH
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH               HHH     HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVLRGQIFIVYFIAGVKKLDADWVEGYSMEYLSRHWLFSPFKLLLSEELTSLLVVHWGGLLLDLSAGFLLFFDVSRSIGLFFVSYFHCMNSQLFSIGMFS 300
PathogenicSAV:                                                       M                                           SF
gnomAD_SAV:       HD     C  V M Q   G    C   N  Q     T     P #P    AM  S     PLPA   V   LSCT  L L#  R V  *  RV  LF
Conservation:  4356264637764694667747644667923634777737672465452476377675983999677689779477425335867794666777479464
STMI:                                                                                                      MMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH      HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ACT_SITE:                       K                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YVMLASSPLFCSPEWPRKLVSYCPRRLQQLLPLKAAPQPSVSCVYKRSRGKSGQKPGLRHQLGAAFTLLYLLEQLFLPYSHFLTQGYNNWTNGLYGYSWD 400
PathogenicSAV:                                                                                              R      
BenignSAV:                             Q                                                                           
gnomAD_SAV:     I Q G   LS  D*RQ P CSR Q    P S     R C C     #GDR   EL  H #P #  #V    K     C    S#  DK K VR S    
Conservation:  7465445448524258624132270251026712113226126261111101102223352445365436426647586875563776587476667776
STMI:          MMMMMMMMMMMMM                                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH    HHHHHHHH  HHHHHH              EE           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH    HHHHHHH   HHHHH                            HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH            H  EEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH                             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  
DO_DISOPRED3:                              D  D                                                                    
DO_SPOTD:                                                     DDDDDD                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MMVHSRSHQHVKITYRDGRTGELGYLNPGVFTQSRRWKDHADMLKQYATCLSRLLPKYNVTEPQIYFDIWVSINDRFQQRIFDPRVDIVQAAWSPFQRTS 500
PathogenicSAV:                                                                            #        P       S       
BenignSAV:                                                                I                                        
gnomAD_SAV:    # LQ HAQR #E#  HN CSDKPS   L L  H QQ  YREG   P TS  TC F  C I  S T C     V  #  *GN  LC   M  SCL  PC F
Conservation:  6756794779777774642663364769776757689799699999962992228326666385779979997979989943564455836198862362
SS_PSIPRED:    EEEEEE   EEEEEEE      EEE        HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEEEEE               EE          
SS_SPIDER3:    EEEEEE   EEEEEEE      EEE    HHHH HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEEEEE  E E  E        E          
SS_PSSPRED:    EEEEE    EEEEEEE      EEE         HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEEEEE              EEE          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                       C                                                  
CARBOHYD:                                                                N                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WVQPLLMDLSPWRAKLQEIKSSLDNHTEVVFIADFPGLHLENFVSEDLGNTSIQLLQGEVTVELVAEQKNQTLREGEKMQLPAGEYHKVYTTSPSPSCYM 600
PathogenicSAV: S                                                        R                                          
BenignSAV:                               I                                                                         
gnomAD_SAV:           N #  KT       N    I M  T   AERN   S  K  S P     #   N  V V R     # A E     D    L M  RCS * V
Conservation:  8758985599688257355633997496499999977939997868998886564839272695533229169238422557384895969452169899
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHHH     EEEEE     EEEEE       EEEEEEEEEEEEEEE    EEEE    EEE      EEEEE      EEE
SS_SPIDER3:    EE EE   HHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE   EEE EE       EEEEEEE EEEEEEE     EEE    EEEE    EEEEEE     EEEE
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHH     EEEEE      EE          EEEEEEEEEEEEEE            EE       EEEEE      EEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                     DD    DDDDDDD    DDDD             
CARBOHYD:                                                       N                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YVYVNTTELALEQDLAYLQELKEKVENGSETGPLPPELQPLLEGEVKGGPEPTPLVQTFLRRQQRLQEIERRRNTPFHERFFRFLLRKLYVFRRSFLMTC 700
gnomAD_SAV:     I  K#   SPQ#G    E   D M D      P T       #Q  R T LIS  EAL  G *SF    #W*     K   H#  #  #I CC   R G
Conservation:  9487999533764665381775765589661243545733421201111112495514665664445513564223103730662146232368455962
SS_PSIPRED:    EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                  DDDDDDDDDDDDDD                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD DDDD     D   DD                             

                       10        20        30        40        50        
AA:            ISLRNLILGRPSLEQLAQEVTYANLRPFEAVGELNPSNTDSSHSNPPESNPDPVHSEF 758
gnomAD_SAV:      P*  #I H    L     I  DWI    GE   #  M     SLTGLD E#F    
Conservation:  8757583484944358338436843433211110022003011343364302012144
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH                                  
SS_SPIDER3:    HHHHHHH     HHHHHHHHHHH                                   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH                                  
DO_DISOPRED3:                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD