P38571  LICH_HUMAN

Gene name: LIPA   Description: Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase

Length: 399    GTS: 1.673e-06   GTS percentile: 0.525     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 39      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 209      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKMRFLGLVVCLVLWTLHSEGSGGKLTAVDPETNMNVSEIISYWGFPSEEYLVETEDGYILCLNRIPHGRKNHSDKGPKPVVFLQHGLLADSSNWVTNLA 100
PathogenicSAV:                                                  G  G   #                           # V             
BenignSAV:                    P      R     L                                                                       
gnomAD_SAV:    LQIW  A  I  I RP      R N    VR   I        L  HI G V#  DG  T G  *  RW   #PG # R LI  KYVF   CI R  K  
Conservation:  1102000111021111000000000000022310322253604235214351625164646142265123000001103244563644123321851512
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                         
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHH     EEEEE     EEEEEE               EEEEE  EE           
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHH     EEEEEE     EEEEEE               EEEEE         HH    
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHH     EEEEEEE    EEEEE                EEEEE          E    
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBBDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                          DDDDD                         
DO_IUPRED2A:                            D DD                                                                       
PROPEP:                                   AVDPETNMNVSEIISYWGFPSEEYLVETEDGYILCLNRIPHGRKNHSDK                        
CARBOHYD:                                         N                                   N                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NSSLGFILADAGFDVWMGNSRGNTWSRKHKTLSVSQDEFWAFSYDEMAKYDLPASINFILNKTGQEQVYYVGHSQGTTIGFIAFSQIPELAKRIKMFFAL 200
PathogenicSAV:      I            S G D  F  #         L     E      P                       S                       P
gnomAD_SAV:    S RP    T  D  M       DIL Q R  V#  RY#  DL  N T  C #     C            L      A   TS  #  #R      L  P
Conservation:  2244664536244778757457424623611421022375155345541486542625642253432646376586323433546125164267433235
SS_PSIPRED:       HHHHHHH    EEE        HH         HHHHH  HHHHHHH HHHHHHHHHHHH    EEEEEE HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHH    EEE                      H   HHHHHH HHHHHHHHHHHHH    EEEEEE HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:      HHHHHHHH    EEE                   HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH    EEEEEEE HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                              D                                                                        
ACT_SITE:                                                                               S                          
CARBOHYD:      N                                                           N                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GPVASVAFCTSPMAKLGRLPDHLIKDLFGDKEFLPQSAFLKWLGTHVCTHVILKELCGNLCFLLCGFNERNLNMSRVDVYTTHSPAGTSVQNMLHWSQAV 300
PathogenicSAV:  L                                                                                     IC E  SY  H  
BenignSAV:                                S                                                                        
gnomAD_SAV:    CHMV I#L       F #ISGQF    S G    #  VSF C C RD I# M M  YR      G*LSD    I    I*   C VAI  # VS CGH  
Conservation:  6532321221442112103210123124504242111000201110262001110281133212271201445123332523204225523332651921
SS_PSIPRED:    H  HHHH    HHHHH    HHHHHHHH         HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH   HHH    HHHHHH      HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH    HHHHH    HHHHHHHH         HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      EEEEE    HHHHHH   HHHHHHHH         HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH   HHH     HHHHH      HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                              N                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KFQKFQAFDWGSSAKNYFHYNQSYPPTYNVKDMLVPTAVWSGGHDWLADVYDVNILLTQITNLVFHESIPEWEHLDFIWGLDAPWRLYNKIINLMRKYQ 399
PathogenicSAV:       DV  R             L                #  N              N        T    Y           S C           
gnomAD_SAV:    NV    DV     TR # Y  H  L IHS E#V  LA   GRDQ  IVGI  I V PP T     YDNTA   YP  T  R SS#S CT   S      
Conservation:  111163255331013401341210520614313042233427327133211641051114233221204204132543351231003302531241111
SS_PSIPRED:    H             HHHHHH         HHH    EEEEEE       HHHHHHHHHH   EEE EE       HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    H    E      HHHHHHHH        EHHH    EEEEEE       HHHHHHHHHH   EEEEEE     EEEEEEE  H HHH HHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HH          HHHHHHHH                EEEEE    EE  HHHHHHHHHH HHH          HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                     
DO_SPOTD:                                                                                                         
DO_IUPRED2A:                                                                                                      
ACT_SITE:                                                                               H                         
CARBOHYD:                          N