P38606  VATA_HUMAN

Gene name: ATP6V1A   Description: V-type proton ATPase catalytic subunit A

Length: 617    GTS: 1.236e-06   GTS percentile: 0.326     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 8      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 174      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDFSKLPKILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFD 100
PathogenicSAV:                           R                                            D                           Y
gnomAD_SAV:         Q   RN         #R       A    V T           KV   M    D             L F     HSS   CA     VT V # 
Conservation:  7312144320344162136363564778757317577775777798539997999997974996777979676367586596758977599995653576
SS_PSIPRED:                     EEEEEEEE  EEEEE       EEEEEE      EEEEEEE  EEEEEEEE         EEEE     EEEE   HHHH   
SS_SPIDER3:                      EEEEEEE  EEEE      E EEEEEE     E EEEEEE  EEEEEEEEE        EEEE    EEEEE   HHHHHH 
SS_PSSPRED:                      EEEEEEE  EEEEE     EEEEEEEE      EEEEEEE  EEEEEEEE                  EEEE   HHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD                                                                                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPCKNLRVGSHITGGDIYGIVSENSLIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVK 200
BenignSAV:                                                                      S                                  
gnomAD_SAV:      E   LV   H R    S    MCP   VVR    L#RI P STL S        GD WF    S  S Q   S S    S   H F I    G G I 
Conservation:  8898963883126356668884643783542486819123464756589995771808999739457598653667655645828333767766576424
SS_PSIPRED:         HHHHHHHH                    EEE         EE    EEEEEE     EEEEE      EEEEEE    EE    EEEEEEE  EE
SS_SPIDER3:      H  HHHHHHHH         E         EEE E        EE    EEEEEE    EEEEEE     E EEEEE   E EE   EEEEEEE  EE
SS_PSSPRED:    H    HHHHHHHH                    EE         EE    EEEEEEE     EEEE       EEEEEE          EEEEEEE   E
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                 D                     
MODRES_P:                                         T                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKFTMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDG 300
gnomAD_SAV:     R   M I L HE * II                    L     S         E                                 W     KV  # 
Conservation:  6443555476655456333653634556565655565557979997979796799797767797767666576677797967777777479967456445
SS_PSIPRED:    EEEEEEEE                       HHHHHH       EEEEE      HHHHHHHHHHH    EEEEEE    HHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:    EEEEEEEE        HHH           HHHHHHH  E    EEEE     HHHHHHHHHHHHH    EEEEE      HHHHHHHH    EE     
SS_PSSPRED:    EEEEEEEE                     HHHHHHHHH       EEE       HHHHHHHHHHH    EEEEE      HHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                        D                                                                              
NP_BIND:                                                        GAFGCGKT                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KVESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPER 400
PathogenicSAV:              D                       C          N                     G   T                         
gnomAD_SAV:        T    G      D       V V         LC  SC  G           S          I   #       #C      *            
Conservation:  6353465563656546665464447566965755676567645446666657666667646744966776999799997779999996697757695927
SS_PSIPRED:    EE  HHH EEEEE     HHHHHHHHHHH  HHHHHHHH    EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHH   EEE      
SS_SPIDER3:    EEEEEEEEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE     HHHHHHHHHHH H          HHHHHHHHHHHHH   EEE      
SS_PSSPRED:      HHHHHHEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH   EEE      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                                                         S                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKAS 500
gnomAD_SAV:      N  T                     VI            C         #   E  H    CCV YL      KM    V    D           S 
Conservation:  5977565556776777997675555557799999779999979979767999997674659644763363775467565767995957957797979967
SS_PSIPRED:       EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH 
SS_SPIDER3:    E EEEEEEEE           HHHHHHHHHHHH   HHHHHH        H  HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH
SS_PSSPRED:      EEEEEEEE           HHHHHHHHHHH    HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:        D                                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMIAFYDMARRAVETTAQSDNKITWSIIREHMGDILYKLSSMKFKDPLKDGEAKIKSD 600
gnomAD_SAV:                I   G  V      S       C    L CH VV   V H VL S     S    FV H  V GNPC  TCV     Q  D  T   Y
Conservation:  7774765566565455676977766656633766777645636363654754446645533435485326342434333555556734934584246321
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10       
AA:            YAQLLEDMQNAFRSLED 617
gnomAD_SAV:           #    #G D 
Conservation:  42341433323472423
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                  D
DO_SPOTD:                     DD
DO_IUPRED2A: