P39086  GRIK1_HUMAN

Gene name: GRIK1   Description: Glutamate receptor ionotropic, kainate 1

Length: 918    GTS: 2.183e-06   GTS percentile: 0.717     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 443      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKFAVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQL 100
gnomAD_SAV:      QS VF R#R    #IRCTF   F   V   V H        *  *HV   #         S     LN #S##  IC  L  K SV#    Q  FY  
Conservation:  3333333333333333000333333000000000011335977923734624259468776454996556646535878848544246454544337566
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                      
SS_PSIPRED:         HH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        EE     HHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHH        HHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHH        EEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                      
DO_SPOTD:      DDD        DD     D DDDD                                                                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                         N     N                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALGVAALFGPSHSSSVSAVQSICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDSTGLIRLQELIKAPSRYNIKI 200
gnomAD_SAV:     V L   I       IRV KF  DV K    #AH*  SLM    VVH SI#       K   N IFC SR R  #   E   V #  KF TS   H  T 
Conservation:  5685345555444653565555555546854544868433623928546569653546466755734539433865856457768689853594434554
SS_PSIPRED:    H    EEE    HHHHHHHHHHHHH    EEEEE           EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE   HHHHHHHHHH HHH   EE
SS_SPIDER3:    H   EEEE    HHHHHHHHHHHHH    EEEEE           EEEEE   HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE   HHHHHHHHHH HHH   EE
SS_PSSPRED:    HHHHEEEE     HHHHHHHHHHHH    EEEE             EEEE   HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE   HHHHHHHHHHHH     EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEILKQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME 300
gnomAD_SAV:    NVH  TP    P    NKV ER  I A   F Y SVT     F YV L  KCS     I   LV     CT   A V RLL V    TQMPF     F  
Conservation:  6556632431636898876964576357789341344154354435896987795588778545687447555978676775564553283553469437
SS_PSIPRED:    EEEE        HHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHH       EEEEEE        HHHHH   EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEE       HHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHH       EEEEEE         HH     EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEE     HHHHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE        HHHHHH  EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                 N                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRFMNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGT 400
BenignSAV:                                    V                                                                    
gnomAD_SAV:     V TL#KLKIR   #   # VVPTHNV CLLVV LRW T  NAC RH   RQSR# R #   P  #DQ     W         F E  Y G V     EI
Conservation:  4472335242653373755368636668434433263426356687696885687593575233443384857945245454855357566565558372
SS_PSIPRED:    HH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH       EEEEE      EEE EEEEEEEE    
SS_SPIDER3:    HH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHH      EEEEEE      EEE EEEEEEEEE   
SS_PSSPRED:    HH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHH        EEE          EEEEEEE     
DO_DISOPRED3:            DDDD                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:            D                                                                                          
CARBOHYD:                                                                                    N                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKAAGEVSKHLYKVWKKIGIWNSNSGLNMTDSNKDKSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVP 500
gnomAD_SAV:      TTCK   Y*# AC  VEN K  #R YVM R ENN   F E#  T I T   T    F T  R VER      C            #   IL VA   R
Conservation:  2633333333333333356374311786565203132167658749658264756858675356665392853788666588748771599918553852
SS_PSIPRED:    EE   HHHHHHH  EEEEEEEE    EEE            HHH   EEEEEE      EEEE              HHHHHHHHHHHHH   EEEEE  
SS_SPIDER3:    EEE   HHH   EE EEEEEEE     E                   EEEEEEE    EEEEE             HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE  
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHH EEEE                         EEEEEEE    EEEE               HHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                  DDD   D                                                              
CARBOHYD:                                 N          N      N                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFT 600
gnomAD_SAV:       S   T  E   R              S V #A MQG  V  P H T VRV  FHWNRS  YT I   H H   NV*I     S A #          
Conservation:  9757833562558896659856845886668777663654466868875447569855654444355777746666779467997767777679467555
STMI:                                                                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   
SS_PSIPRED:                  HHHHHHHH HH EE    EEEEE           EE  EEEEEE         HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:       E  E       HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE    EEE     EE EEEEEEE         H       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHHHH   EEEE                 EEEEEE                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                            R                                                              
REGION:                                      PLT                                                                   
CARBOHYD:                                                                  N                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PYEWYNPHPCNPDSDVVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAV 700
gnomAD_SAV:     CK CK #SFKT P M  SHL  # N#  RI S T      T          E           F M       I Q   F # L E P     M C VF
Conservation:  6576454449563544446666856757765666544654666595666657669979999777988776565865455564446597576987858945
STMI:                                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                          
SS_PSIPRED:    HHHH                  HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH        HHHHHH    EEEEE
SS_SPIDER3:    HHHH                  HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH    EEEEEE
SS_PSSPRED:                          HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHH       E 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQL 800
BenignSAV:                                                             V                                           
gnomAD_SAV:     # LII     *   IHKE RT T  K   T IG      H       #     ITV   MH         D     D R  I#  P  QN   V     
Conservation:  2586864996555545656674664553263344222375365534575454766355644344535644733344444433663655555465886845
SS_PSIPRED:       HHHHHHH    HHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH    EEEEEHHHHHHHH     EEEE          EE      HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    E  HHHHHHHH   HHHHHHHHHHH          HHHHHHHHH   EEEEEEEHHHHHHH      EEE        EEEE      HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHH   HHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH   EEEEEE   HHHHHH    EEE                    HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                           E                                               
REGION:           ST                                                                                               
MODRES_P:                              S                                   T                                       
CARBOHYD:                                                                       N                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIGEFIYKSRKNNDIEQAFCFFYGLQCKQTHPTNSTSGTTLSTDLECG 900
BenignSAV:                                                                  Q       V                              
gnomAD_SAV:      GR   K R M  C     K     V T     T    M#   R    I   V    H  WR  VVQ V SL *   S  #Q  I IP     M *KR 
Conservation:  5856359245758956358547334765778745498685585468457546635654655463432341121111121210111111311111112111
STMI:                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                             
SS_PSIPRED:    HH  HHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH                      
SS_SPIDER3:    HH  HHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HEEEEEEEE                    H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                   EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHEEEE                     
DO_DISOPRED3:                    BDDDDDDDDDDD                                     D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                        D D DD         

                       10        
AA:            KLIREERGIRKQSSVHTV 918
BenignSAV:      S                
gnomAD_SAV:     S Q D R Q     R L
Conservation:  211133332212211011
SS_PSIPRED:     HH HH            
SS_SPIDER3:    H      HH         
SS_PSSPRED:                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: