P40424  PBX1_HUMAN

Gene name: PBX1   Description: Pre-B-cell leukemia transcription factor 1

Length: 430    GTS: 1.169e-07   GTS percentile: 0.002     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 6      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 82      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEGEGGRKQDIGDILQQIMTITDQSLDEAQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEP 100
BenignSAV:                                   S                                                                     
gnomAD_SAV:      DH            VR#RS         VEP A  E      A                 S               Y             G       
Conservation:  6111000100001000000101100011000000001000010111100100120011000010222211211121111112111111141423124223
SS_PSIPRED:       HHHHH                                  HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH              
SS_SPIDER3:        HHHHH                                 HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH  H EE  E       
SS_PSSPRED:       HHHHHHH                                HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:  BBDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDB                                                      DDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD   D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D   DDDDDD DDDDDDD D                     DDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TDPQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERM 200
gnomAD_SAV:     A      N        S   R   L V #VVVV    TR            R     H                    I     H       S    Q 
Conservation:  3335435743573646434433131313222121111413131323333341363555235357765528681588286458658866468544294554
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHH HHHH              HHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD  DD DD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                 DDDDDDDDDDDDDD    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQE 300
PathogenicSAV:                           P      ##                                     Y                           
gnomAD_SAV:         L                                                                                              
Conservation:  5246445834752668465676343665556545534546442444458468658545988555465495746345367624465565559979346466
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH   HHH        EEEE    HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH HH  HHHHHHHH  HHHHHHHHHH   HH     HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH   HHHEE     EEEEE   HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH    EE         EE     HHHHH
DO_DISOPRED3:                         DD DDD                                                                       
DO_SPOTD:                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                  D                                    
DNA_BIND:                                      ARRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNI     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMSVQSLNGDSYQGAQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGIS 400
gnomAD_SAV:          T     TAS            I       T    LD   F I M     VA   S   D MP      H  V     C  V TT HKC LRS #
Conservation:  9632922434213112122222113312521250122202122231322322222111111102000121211322111212121102010101111110
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH                                                        HHHHHHHH                            
SS_SPIDER3:    HHHHHHH                                                           H                                 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH                                                                                           
DO_DISOPRED3:     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  DDDDDDDDDD DDDDDDDDDD   D     DDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30
AA:            ANGGWQDATTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN 430
gnomAD_SAV:     H DC     H  M       D        
Conservation:  343121010021101121102130011101
SS_PSIPRED:                                  
SS_SPIDER3:                                  
SS_PSSPRED:                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD