P41225  SOX3_HUMAN

Gene name: SOX3   Description: Transcription factor SOX-3

Length: 446    GTS: 4.42e-07   GTS percentile: 0.030     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 80      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRPVRENSSGARSPRVPADLARSILISLPFPPDSLAHRPPSSAPTESQGLFTVAAPAPGAPSPPATLAHLLPAPAMYSLLETELKNPVGTPTQAAGTGGP 100
BenignSAV:         #                    T                T                                                         
gnomAD_SAV:      S Q  L*A    GA     GG  T  LI  NL  Q T T#P      F SL  #V#              V    G        S             
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121210121010111100011111
SS_PSIPRED:                     HHHHHHHHH                         EE            HHHH   HHHHHHHHHH                  
SS_SPIDER3:                     HHH                                              H H      HH HHH                   
SS_PSSPRED:                                                                             HHHHHH                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDD  D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAPGGAGKSSANAAGGANSGGGSSGGASGGGGGTDQDRVKRPMNAFMVWSRGQRRKMALENPKMHNSEISKRLGADWKLLTDAEKRPFIDEAKRLRAVHM 200
PathogenicSAV:                                                  Y                                                  
BenignSAV:       T                                                                                                 
gnomAD_SAV:     TTR     G            R     A   #                                         #     S     S  N       A  
Conservation:  0111000110101111111111111111111110101122373254443336334544344843564555446753432734235466666666765375
SS_PSIPRED:                                       HHH     HHHHH  HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                           E     EEEE HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                EE    HHHHHHHHHH     HHHHHHHH HHHHH  HHHH  HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDD            DDD DD    D
DNA_BIND:                                            VKRPMNAFMVWSRGQRRKMALENPKMHNSEISKRLGADWKLLTDAEKRPFIDEAKRLRAVHM

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KEYPDYKYRPRRKTKTLLKKDKYSLPSGLLPPGAAAAAAAAAAAAAAASSPVGVGQRLDTYTHVNGWANGAYSLVQEQLGYAQPPSMSSPPPPPALPPMH 300
gnomAD_SAV:                    Q          R P R      T       T               Q                       LG            
Conservation:  5559564536543232243333313333113211111111111422232132312242335333337333352153222323211122422123114233
SS_PSIPRED:    HH                               HHHHHHHHHHHHHH                                                     
SS_SPIDER3:    HH                                   HHHH H                                 H                       
SS_PSSPRED:    HH                               HHHHHHHHHHHHHHH                                                    
DO_DISOPRED3:             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D DDDDD DDDD D  DDDDDDD                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DNA_BIND:      KEYPDYK                                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RYDMAGLQYSPMMPPGAQSYMNVAAAAAAASGYGGMAPSATAAAAAAYGQQPATAAAAAAAAAAMSLGPMGSVVKSEPSSPPPAIASHSQRACLGDLRDM 400
BenignSAV:                                                                     L                                   
gnomAD_SAV:       V       V   S       S                               V      VSL    T       S       #       R      
Conservation:  5554234231212223213533111113232131111111111111112112111111112121222121222222441032211211211330323323
SS_PSIPRED:                          HHHHHHHH        HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH                             HHHHHH
SS_SPIDER3:                          HHHHHHH          HHHHHHHH    H   HHHHHH                                   HHH 
SS_PSSPRED:                         HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH                             HHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          

                       10        20        30        40      
AA:            ISMYLPPGGDAADAASPLPGGRLHGVHQHYQGAGTAVNGTVPLTHI 446
gnomAD_SAV:                NTP S         R Q                 
Conservation:  2213363312213111211123110322110110112130022100
SS_PSIPRED:    HH                                            
SS_SPIDER3:                                                  
SS_PSSPRED:    H                                             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:              D DDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD D