P41252  SYIC_HUMAN

Gene name: IARS1   Description: Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic

Length: 1262    GTS: 2.577e-06   GTS percentile: 0.824     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 6      BenignSAV: 13      gnomAD_SAV: 601      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLQQVPENINFPAEEEKILEFWTEFNCFQECLKQSKHKPKFTFYDGPPFATGLPHYGHILAGTIKDIVTRYAHQSGFHVDRRFGWDCHGLPVEYEIDKTL 100
gnomAD_SAV:      HK  K V  L  K  V A G    F   S   P      #  G  R      Y   # VS L HT   *  RNR Y   T R*    FL   *T RAV
Conservation:  7332544451771565356246111375345433542444747779677776676676667775676777769667439667667777779777767636
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH       EE            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:               HHHHHHHHHHHHH  HHHHHH        EEE            HHHHHHHHHHHHHHHHH     EE           HHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BBBB                                                                                                
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                        PFATGLPHYGH                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GIRGPEDVAKMGITEYNNQCRAIVMRYSAEWKSTVSRLGRWIDFDNDYKTLYPQFMESVWWVFKQLYDKGLVYRGVKVMPFSTACNTPLSNFESHQNYKD 200
gnomAD_SAV:       A K L EV F   DDH Q V V#CA     AIN  DQ#    S C   C   V  L  A  P C     H  M  I   A   # F D V  RS# H
Conservation:  4547967634566346833763686676166412627896945734676666637465438575566557567675797766559679797777677766
SS_PSIPRED:        HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEE          HHHHHHHHHHHHHHHH   EE EEEE           HHHHH      
SS_SPIDER3:        HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE         HHHHHHHHHHHHHHHH       EEE E           HHH    EE
SS_PSSPRED:        HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EE           HHHHHHHHHHHHHHHH   EE EEE                      
DO_DISOPRED3:                                                                                                DDDD  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VQDPSVFVTFPLEEDETVSLVAWTTTPWTLPSNLAVCVNPEMQYVKIKDVARGRLLILMEARLSALYKLESDYEILERFPGAYLKGKKYRPLFDYFLKCK 300
gnomAD_SAV:    I  T   A  #  D  I    V    A    G         V           Q    T  G P  CI    C  R   LD S QDE      E    # 
Conservation:  9699874739994652345668999999999999879766632864655022332466596992546927379255558592195984949691992413
SS_PSIPRED:        EEEEEEEE      EEEEEE         EEEEE     EEEEEE    EEEEEE HHHHHH       EEEEEEE HHH   EEE   HHHHH  
SS_SPIDER3:        EEEEEEEE     EEEEEEE       HHEEEEE   E EEEEEE     EEEEEHHHHHHH        EEEEEE H H    E   HHHHHH  
SS_PSSPRED:        EEEEEEE       EEEEEE         EEEE    EEEEEEE      EEEEHHHHHHHHHH     EEEEE              HHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ENGAFTVLVDNYVKEEEGTGVVHQAPYFGAEDYRVCMDFNIIRKDSLPVCPVDASGCFTTEVTDFAGQYVKDADKSIIRTLKEQGRLLVATTFTHSYPFC 400
PathogenicSAV:                                                                      G                              
BenignSAV:      Y              #                                                          G                        
gnomAD_SAV:    #Y T      IC    # IEA   T   SSG CG YT#  V #  TF            M    LT  C  Y NRG  K      *    I C  N    
Conservation:  2148858738368437588876668899868968793532665785287999958938826936939486888984867187625866124543659999
SS_PSIPRED:        EEEEE           EEEE     HHHHHHHHH                  EE          EE    HHHHHHHHH   EEEE EEEE     
SS_SPIDER3:        EEEEE          EEEEE     HHHHHHHHH             E    EE E        E EH  HHHHHHHHH   E EE  EE      
SS_PSSPRED:        EEEEE           EEE      HHHHHHHHHH                             EEEE  HHHHHHHHHH  EEEE EEEEE    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WRSDTPLIYKAVPSWFVRVENMVDQLLRNNDLCYWVPELVREKRFGNWLKDARDWTISRNRYWGTPIPLWVSDDFEEVVCIGSVAELEELSGAKISDLHR 500
PathogenicSAV:                                     L                                                               
gnomAD_SAV:    #   #TP  E LS   MQ  KVMG     SN  CCF    Q EQLRS   Y HNR   GS    ARL  *  H    #L TRL V     *AG T GVY 
Conservation:  9997999999799999557725533741572387857657456976667546477654666676585946362844566769933675566724537676
SS_PSIPRED:           EEEE   EEEEHHHHHHHHHHHHH      HHH     HHHH                   EEE     EEEEE  HHHHHHHH         
SS_SPIDER3:          E EE     EE HHHHHHHHHHH        HHHH    HHHH       E        EE EEE      EEEEE HHHHHHHH     H  H
SS_PSSPRED:             EEE  EEEEEHHHHHHHHHHH             HH HHHH                           EEEE HHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ESVDHLTIPSRCGKGSLHRISEVFDCWFESGSMPYAQVHYPFENKREFEDAFPADFIAEGIDQTRGWFYTLLVLATALFGQPPFKNVIVNGLVLASDGQK 600
PathogenicSAV:                                                        S                                            
gnomAD_SAV:    G   R  VS C  N   R#N GL H *  N    C  I HL  K    K      L SK  N S           M     L  ##I EY        PN
Conservation:  9457362779548640748637777997796677777497976566476436975975777766766677677756577546566776667767757666
SS_PSIPRED:                    EEE    EE          HH       HHHHHHH  HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH       EEE  EEE      
SS_SPIDER3:    HHHH            EEE   EEE EE      HHHH      HHHHHHH  HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH    HHHEEEE EE       
SS_PSSPRED:          E          E   EEEEE                  HHHHHH     EEEEEE     HHHHHHHHHHHH       EEEEE  E       
DO_DISOPRED3:                                                                                                  DDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                                                            K

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSKRKKNYPDPVSIIQKYGADALRLYLINSPVVRAENLRFKEEGVRDVLKDVLLPWYNAYRFLIQNVLRLQKEEEIEFLYNENTVRESPNITDRWILSFM 700
BenignSAV:                                                                                   I    M                
gnomAD_SAV:    I  P*    N A V R F S       M  L  K K PC  KQS Q IFQGI  S*S  CHIVT SIP   EQ  #  I SGSMIKQ  STANG      
Conservation:  7996979897920661359796796777777697979999997997769999779979779774976247356522294565222305294793764755
SS_PSIPRED:              HHHHHHHH HHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    E         HHHHHHHH HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDD                                                                                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:         K                                                                                                 
MOTIF:         MSKR                                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QSLIGFFETEMAAYRLYTVVPRLVKFVDILTNWYVRMNRRRLKGENGMEDCVMALETLFSVLLSLCRLMAPYTPFLTELMYQNLKVLIDPVSVQDKDTLS 800
PathogenicSAV:                                       C                                                             
BenignSAV:                                                                         I                           N   
gnomAD_SAV:     F   #  #KI  C   #   H IR  AT  D C   SCK   D KEL      P I    P   RK T #* # P   I P    VT S     EN   
Conservation:  6774297337715979969997977969396667775766769773913883288869857965796889966886995599785184562542665209
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH  HHHH   HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            E
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH             E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IHYLMLPRVREELIDKKTESAVSQMQSVIELGRVIRDRKTIPIKYPLKEIVVIHQDPEALKDIKSLEKYIIEELNVRKVTLSTDKNKYGIRLRAEPDHMV 900
gnomAD_SAV:     Q P# RL #  W GE  G#     HC      MT  Q  VS N      M #         # Y   CTT   S Q A V  YE     Q #TD H L 
Conservation:  9998768245424454356255436686869878776878485866879656954843681363666565369988636949469268554978996956
SS_PSIPRED:    EEEE      HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE   HHHH EEEEEE     
SS_SPIDER3:    EEEEE     HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE    HH EEEEEEEE HHH
SS_PSSPRED:    EE        HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE   HHH   EEEEE   HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGKRLKGAFKAVMTSIKQLSSEELEQFQKTGTIVVEGHELHDEDIRLMYTFDQATGGTAQFEAHSDAQALVLLDVTPDQSMVDEGMAREVINRIQKLRKK 1000
PathogenicSAV:                                                                                            D        
BenignSAV:                  M                                                                                      
gnomAD_SAV:       H  RD   A M V *         R       K  D R A  H V*S   S#  NV    RP  RP    HI       G  I W  SSHMR FC M
Conservation:  9978896586254356529243398086238253846749726566546564522122356799662647577756677554667667966775776666
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH  EEE  EEE    EEEEEEEE        EEEE    EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH   EEE  EEE    EEEEEEE       EEEEEE   EEEEEEE    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH  EEEEEEEEE    EEEEEEEE       EEEEE    EEEEE     HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                        D              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CNLVPTDEITVYYKAKSEGTYLNSVIESHTEFIFTTIKAPLKPYPVSPSDKVLIQEKTQLKGSELEITLTRGSSLPGPACAYVNLNICANGSEQGGVLLL 1100
gnomAD_SAV:     S I #    M CN   G I   G  K  AQ L   #R #VI  AI  PG I   G  R    K   K     F S  V    S  S S VGK S L # 
Conservation:  4574958452756141434289227741927864564854643585411115552814455544844554340211454836544141243244295578
SS_PSIPRED:            EEEEEEE      HHHHHHH HHHHHHHH              EEEEEEEEE  EEEEEEEEE         EEEEEEEEE     EEEEEE
SS_SPIDER3:            EEEEEEE     HHHHHHHH HHHHHHH     EEE       EEEEEEEEE  EEEEEEEEE        EEEEEEEEEE      EEEEE
SS_PSSPRED:    H      EEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHH              EEEEEEE     EEEEEEE         EEEEEEEEEE      EEEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                    S S        T                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ENPKGDNRLDLLKLKSVVTSIFGVKNTELAVFHDETEIQNQTDLLSLSGKTLCVTAGSAPSLINSSSTLLCQYINLQLLNAKPQECLMGTVGTLLLENPL 1200
PathogenicSAV:                                                                          N                          
BenignSAV:                                                                                      E     T            
gnomAD_SAV:    G    VD  Y    N  ASG     TADPP  R KI#      F   # R PR    LTS    G GNIVF CVSV    TE HDS T  # I    KR 
Conservation:  8786764043303730431368332311424525236501235634447658174343251111213333737587292621745531724759862681
SS_PSIPRED:    E         HHHHHHHHHHHH     EEEEEE   EEEE   HHH    EEEEE                 EEEEEE             EEEEEE   
SS_SPIDER3:    E         HHHHHHHHHHHH     EEEEEE  EEE     HHH    EEEEEE              E EEEEEE             EEEEE    
SS_PSSPRED:    E         HHHHHHHHHHHH     EEEEE           HHH    EEEEE             HHHHHHHHHH             EEEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                               DD DD                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60  
AA:            GQNGLTHQGLLYEAAKVFGLRSRKLKLFLNETQTQEITEDIPVKTLNMKTVYVSVLPTTADF 1262
BenignSAV:                                          I    M                   
gnomAD_SAV:     ED  P   I C*      FQ S     VID  K   I  V M I     GS  L #A   L
Conservation:  52418231273144454777757453854521332742221334384266565163463532
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHH     EEEEE                     EEEEEE       
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHH     EEEEEE               HH    EEEEEE E     
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHH     EEEEE                   EEEEEEEEE      
DO_DISOPRED3:                                    DDDDDDDDD                 DD
DO_SPOTD:                                                                    
DO_IUPRED2A:                                          D