P41440  S19A1_HUMAN

Gene name: SLC19A1   Description: Reduced folate transporter

Length: 591    GTS: 1.79e-06   GTS percentile: 0.574     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 355      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVPSSPAVEKQVPVEPGPDPELRSWRHLVCYLCFYGFMAQIRPGESFITPYLLGPDKNFTREQVTNEITPVLSYSYLAVLVPVFLLTDYLRYTPVLLLQG 100
BenignSAV:                               R                            H                                            
gnomAD_SAV:    VA      A E  M   # #  L *W# M         VP#Q       #CV   N*K  WK I KD A #PLF   VMMLL#   # HVCNMLM     
Conservation:  6100010010001011010000103113414684585333468754565735740134650155552428444745332758254344354648494584
STMI:                                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMM
SS_PSIPRED:                       HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHH        HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_SPIDER3:                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH         H         HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                            HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH                      EEEEHHHHHHHHHHHH    EEHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDBBD                                                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                
DO_IUPRED2A:             D DD                                                                                      
MODRES_P:          S                                                                                               
CARBOHYD:                                                               N                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LSFVSVWLLLLLGHSVAHMQLMELFYSVTMAARIAYSSYIFSLVRPARYQRVAGYSRAAVLLGVFTSSVLGQLLVTVGRVSFSTLNYISLAFLTFSVVLA 200
gnomAD_SAV:    F#LM A          E #H  Q#     T TC    F #IF MLSS#* C VSC  S    D   T       I  S*IY#PM         IY A  #
Conservation:  3644348655338124126936956766889387866777848815117855775894449586837655984534241224037515785542666286
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFLKRPKRSLFFNRDDRGRCETSASELERMNPGPGGKLGHALRVACGDSVLARMLRELGDSLRRPQLRLWSLWWVFNSAGYYLVVYYVHILWNEVDPTTN 300
gnomAD_SAV:       *C QC  L SH NW   KA V#GQD#V   QDR  E TV   FRN   #W  Q# E NMQWRHP# CF R   #LV *  MA#* YS    M    K
Conservation:  2484494687796310100011112731131111110000100002121251244044100221534368634653563687553353546930410102
STMI:          MMM                                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             
SS_PSIPRED:    HH                     HHHHHH           HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HH                     HHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H      
SS_PSSPRED:    HH                     HHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                        
DO_SPOTD:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_IUPRED2A:                         DDDDD                                                                         
MODRES_P:                              S                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SARVYNGAADAASTLLGAITSFAAGFVKIRWARWSKLLIAGVTATQAGLVFLLAHTRHPSSIWLCYAAFVLFRGSYQFLVPIATFQIASSLSKELCALVF 400
BenignSAV:                                          F                                                              
gnomAD_SAV:     V#    #V T FM    VA   V    V   H    F V F TM V  D F V        R   V  M  H FC V L # I # VT    G  S   
Conservation:  1002566434435446562564278532558235325554255325636534400301112583552243575534456576746365457445778725
STMI:                   MMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMM
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH HE  HHHHHHHHH      EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GVNTFFATIVKTIITFIVSDVRGLGLPVRKQFQLYSVYFLILSIIYFLGAMLDGLRHCQRGHHPRQPPAQGLRSAAEEKAAQALSVQDKGLGGLQPAQSP 500
gnomAD_SAV:    R SM STI I     LT LN#WD  RL H # *  AM    V TM*    T # PW GRQ   LQ A#VHVP   V A G P  RL             L
Conservation:  9355545535542533444513473414006502321342132212211311111141101100111111110110010001000001000000010001
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHH                     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHH H                  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHH                     
DO_DISOPRED3:                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDD               D  DDDDDDD
REGION:              ATIVKTIITFIVS                                                                                 
MODRES_P:                                                                               S          S             S 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90 
AA:            PLSPEDSLGAVGPASLEQRQSDPYLAQAPAPQAAEFLSPVTTPSPCTLCSAQASGPEAADETCPQLAVHPPGVSKLGLQCLPSDGVQNVNQ 591
BenignSAV:                          N                                   V                                 
gnomAD_SAV:    R  S Y  R L   C  H RRH    K LVL  V    S RILFS     TE        #    Q L  L          LGNCIP M E
Conservation:  1011111111100000111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                                       HH     HH     HH           EE           
SS_SPIDER3:                     H               H                       HH       E         EEEE           
SS_PSSPRED:                                                     HHHH                                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 DDDDDDDDDB
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDD   D DDDD        DDDDDDDDD D DDDDDDDDDDD    DD DDDDD     D DDD
MODRES_P:        S