P43003  EAA1_HUMAN

Gene name: SLC1A3   Description: Excitatory amino acid transporter 1

Length: 542    GTS: 1.519e-06   GTS percentile: 0.456     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 10      gnomAD_SAV: 221      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTKSNGEEPKMGGRMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLI 100
BenignSAV:                           H   F                                                Q                        
gnomAD_SAV:     I# KR   EIED  DGL R FH H F   E    V          Q    P    V TL PVI  I L HK N W  RH       V  #F T A    
Conservation:  1110110120000212241111211210211110122111311421463644534254348325653572034404351443955447656957459696
STMI:                                                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                   HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                    H  H   HHHHHHHHH     HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHEE HHHHHHHHHHHH  HHHH
SS_PSSPRED:                  HHHHHH HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHEE   HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDBBBBBBBDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                 
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFKTNYEKRSFK 200
PathogenicSAV:                                                                                      S              
gnomAD_SAV:     C V   VVV G N      #Q  A       V      T#I       V  D K  Q   IQ     GL      #   SM  G       S      #
Conservation:  7795655453651433556822542583266546444982364355874513111011211315354586658577559566646663554716122211
STMI:          MMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE      HHH       EEEEHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH EEEEEEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEEE       HHH     EEEE HHHHHHHHHHH     HHHHHH   EEEEEEEE  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE                EEEHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH   EEE  
DO_DISOPRED3:                                                          DDDDDDDD D                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNGVNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGK 300
PathogenicSAV:                                                                                          R          
BenignSAV:                     A D      G                                                                          
gnomAD_SAV:     SM V KMV    T  A DT#Q  IGN  K I                 CT  S A E#V KRAKT KDL E   D VT P T  I  # M  P    A#
Conservation:  1000021312112001140322130211362582363438494899758744695555474147446545846664667377444588594955995585
STMI:                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   
SS_PSIPRED:           EEE  EE     HHHHH     EEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:           E E  EE    HHHHH   EEEEEE    E     HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                               EEEE           EHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMD 400
BenignSAV:           I                     T                           V                           H               
gnomAD_SAV:          IRMTR  IV  AM I       T VI  F      Q KAR LF       V T                  DK  M TCI  LM  IE  #   
Conservation:  7478473314844646845685398258523399366434645993184274669938949999655566665587924425654656654949955798
STMI:                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII         MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH         EEE         
SS_SPIDER3:    HH H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH        EEEEE        
SS_PSSPRED:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH        EEEE   EEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                                                      SSS                                   
METAL:                                                                                                      G T N  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLGDSLGAGIVEHLSRH 500
gnomAD_SAV:    R    G      M   K  GV      IV             V  V    V      IS  A N M  VT      HI    SI     V    K   Q 
Conservation:  9658965665666854423244444443355454456465445845546443466354766454634443354465546634555684364554346521
STMI:          MMMMMMMMMMMM             IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH    HHHHHEEHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH  H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH       EEEEEHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:        T                                                                         D      N                 
REGION:                                                  IPQAG                                                     
METAL:                                                                                           N   D             

                       10        20        30        40  
AA:            ELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM 542
gnomAD_SAV:       S NA K  PL G       H  T * S N    NC   T
Conservation:  862017131111111210046121131211200110124410
SS_PSIPRED:    HHHH  HHH                                 
SS_SPIDER3:    HHHH HHHH      HHH                      E 
SS_PSSPRED:    HHHH                                      
DO_DISOPRED3:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:          DDD DDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                 S