P43004  EAA2_HUMAN

Gene name: SLC1A2   Description: Excitatory amino acid transporter 2

Length: 574    GTS: 1.21e-06   GTS percentile: 0.315     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 219      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASTEGANNMPKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPIHPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISS 100
PathogenicSAV:                                                                                  R  P               
gnomAD_SAV:       S SV    EPGK QI N ##       QDVVPC      NK   N M #  F  T   V  H T   LT     VG   H# I       F      
Conservation:  1111111110011121110121110010000101010200002433311511121164226235701113302031434755445334544454553123
STMI:                                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       MMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH   HHHHHHHHHH HHHHHHHH
SS_SPIDER3:                   HH             H HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H     HHHHHHHH  HHHHHHHHHH  HHHHHHH
SS_PSSPRED:                 EEE             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   D                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDD                      DDD                        
DO_IUPRED2A:   DDDDD D DDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
LIPID:                                              C                                                              
MODRES_P:        S                 S   S                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVTKKVLVAPP 200
BenignSAV:                                                                                                  E      
gnomAD_SAV:                  H  MIDV   LF   V V P     S#  A S M   L  S    G      T     Q F   S     #   RRM  EDM  TL
Conservation:  3347474955237655926643764388439637753863255882420211110101223755485466646766669645464663361222201000
STMI:          MMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                          
SS_PSIPRED:    HHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH             HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH   EEE    
SS_SPIDER3:    HHHHHH     H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHEEEE  E     
SS_PSSPRED:    HHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHE  EEEE    
DO_DISOPRED3:                                                      DDDDDDDD                                        
DO_SPOTD:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDD DD DD    DDDDD
DO_IUPRED2A:                                                     DDDD D                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PDEEANATSAVVSLLNETVTEVPEETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKI 300
PathogenicSAV:                                                                                         R           
gnomAD_SAV:    L    DT NT F P SG  AK R QS    N D            M      D T   IE     TA   S     A    V L        T    E F
Conservation:  0000111110111112020100000101002304333253544846586537833544574474462569446666692581369574838624885586
STMI:                                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    
SS_PSIPRED:                               EEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             HHHH             EEEEEE EE      HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                               EEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD                                                                                           
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:           N         N                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IAIKDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDG 400
gnomAD_SAV:       R   L S  P  C     LV #   V    S    ASGI      S S          #          #    D   E H S VI    T      
Conservation:  3352564345444856546643673684243782665247646941921954585486444666465745453726336156674647579667668888
STMI:                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII         MMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH        EEEE         H
SS_SPIDER3:    H H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH    HHHHHH HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH    H   EEEEE        H
SS_PSSPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH        EEEE   EEE   H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                                                     ASS                                    
METAL:                                                                                                     G T N   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKSE 500
BenignSAV:                                         I                                                               
gnomAD_SAV:         V  T       DI  E           I   FSV      R   T    R M   A   #P  T       L            T  ACY  E  
Conservation:  4959969967978955331631635255733584444556659556455454585558563186446454865445355345456764855662264206
STMI:          MMMMMMMMMMM             IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH      EEEEEHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:       T                                                                         D      N                  
REGION:                                                 IPSAG                                                      
METAL:                                                                                          N   D              

                       10        20        30        40        50        60        70    
AA:            LDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK 574
gnomAD_SAV:     EAV  E *G  #T I# AR TSE#T          SIC G   DVA *       SR   ASNA  *   C #
Conservation:  61022211000101131212111211112121001211211323212232521111121211111121122111
SS_PSIPRED:    HHH       HHHHHHH       HHHH                 EEE HHHEE                    
SS_SPIDER3:    HHH   HH   HHH                              EEEEEEEEEE E   E              
SS_PSSPRED:    HH                                              HHHHHH                    
DO_DISOPRED3:     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               DDDDDDDDDDDDDDBBB
DO_SPOTD:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:           DD          DDDDDDD      D                              DDDDDDDD D
MODRES_P:           S              S          S S    Y    S               S   S