P43005  EAA3_HUMAN

Gene name: SLC1A1   Description: Excitatory amino acid transporter 3

Length: 524    GTS: 3.422e-06   GTS percentile: 0.948     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 358      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFC 100
BenignSAV:                               G                      Y                                                  
gnomAD_SAV:       #VT E Q*N#  NS #  ##SMT MLPS  A #  P  RKV AIQ YH  S  KN RW# N  M S  #F LL RIV   AKAPRNM QHT MC  G
Conservation:  2220000222222222222222112122215422623570111330203143475544533454445455312333464749552376559266437643
STMI:                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMM
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH    HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEE HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH H     H HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDD    DDD    DD     D                                                                          
DO_SPOTD:      DDDDDDD                                                                                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                N                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TTLIAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEY 200
gnomAD_SAV:    S  # IVVDM#    L # F E    TVK # # Q NM V # EV S  S K  L#V  *E  # # D    TNQQ  V      V IPS VFR TI  N
Conservation:  8843963775386325588242021111010122375548546664676666964546466336122220100000000122221010000101304322
STMI:          MMMMMMMMMMMMMM                                                                                      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH  EE               HHHHHHH         E
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH        HHHH          HHHHHHHHHHH     HHHHHHHH  EEEE             HHHHHHHHHHHH      EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHEE                     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                             D DDD                                     D DDDDDDDDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:                               D DDDDD                                  DDDDDDDDDDDD                      
DO_IUPRED2A:                                                                       DDDDDDDDD  D                    
CARBOHYD:                                                                                   N                N     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFRKLGLYMATVLTGLAIHSIVI 300
BenignSAV:                                                                                           G             
gnomAD_SAV:     TFVTDANAK #V   AL FFL RLM    VNREM    L  FG#T    I#F I    VS F P     M A NR V H# D F VA MAV  M CT# 
Conservation:  2222233253544846586537833544574474462569446666692581369574838624885586335256435444856546643683684243
STMI:               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    EE         HHHHHHHHHHHHHHHHH HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH  HH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEE E    HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EE   E     EHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISIT 400
gnomAD_SAV:    I  T LTAI*N   PST# VTE F   FVT A   I  L  H P       #   QLM TA T N T  IV C    V           DT#    #  #
Conservation:  7826652476469419219545854864446664657454537263361566746475896676698884878858856866844321531534255623
STMI:          MMMMMMMM     IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             IIIIIII
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH         EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH        EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH        EEEE   EEE   HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                            T                              
REGION:                                      SSS                                                                   
METAL:                                                                      G T N                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTK 500
PathogenicSAV:                      M                      W                                                       
BenignSAV:                                                                                     N                   
gnomAD_SAV:    T AV  R   M     L I# MV PM  RTKY   M#  HC QNWCT TG #P#N   MD   N # *Q Q IGIA  I TL  S    RN EIK  N N
Conservation:  6534444455494563444654754496531853453446553563642454476548546621641065101311311121222212211012220222
STMI:          IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                             
SS_SPIDER3:    HHHHHH       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            
SS_PSSPRED:    HHHHHH        HHHHHHHHHHHH      EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                            
DO_DISOPRED3:                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                  D      N                                                 
REGION:                  VPQAG                                                                                     
METAL:                                                           N   D                                             

                       10        20    
AA:            KSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF 524
gnomAD_SAV:     P  S  Y  G P  N    A R 
Conservation:  222212222222122110012211
SS_PSIPRED:                   EEEEE    
SS_SPIDER3:           E        EEEE    
SS_PSSPRED:                    EEEE    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDD             DDDDD
DO_IUPRED2A:                           
MODRES_P:                      S    S