P43007  SATT_HUMAN

Gene name: SLC1A4   Description: Neutral amino acid transporter A

Length: 532    GTS: 1.81e-06   GTS percentile: 0.583     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 5      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 223      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEKSNETNGYLDSAQAGPAAGPGAPGTAAGRARRCAGFLRRQALVLLTVSGVLAGAGLGAALRGLSLSRTQVTYLAFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVS 100
PathogenicSAV:                                                                                           P         
BenignSAV:                                         R                                                               
gnomAD_SAV:         Q       T      ELE         W   RS W        AY    C       H F V CM  IC     D        F PQ   F    
Conservation:  2222220122221000222111101102222221211242252555576356437434842440223311111343777758595956687645347653
STMI:                                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                         MMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                HH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                  HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      H HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH H  
SS_PSSPRED:                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDD  DD           DDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDD     
DO_IUPRED2A:     D    D   DD D      DDD                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GAASLDASCLGRLGGIAVAYFGLTTLSASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLEDSGPPPVPKETVDSFLDLARNLFPSNLVVAAFRTYATDYKVVTQ 200
gnomAD_SAV:      ST     F  #     VH  FII   LVF L#  S V  E SV  F  CN A      L #HI M           L C I  T  HM   N EAM  
Conservation:  5445353235654843553674455435534552435333872421010100101222100112533346564525545735853644244240610000
STMI:          MMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                             
SS_PSIPRED:    HHH   HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HH                 HHHHH HHHHHHHH  HHHHHHHHHHEEEEEEEE  
SS_SPIDER3:     HH     H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                               HHHHHHHH     HHHHHH EEEEEEEEE  
SS_PSSPRED:    HHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                           HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHEEEEEEE  
DO_DISOPRED3:                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDD                                  
DO_SPOTD:                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  
DO_IUPRED2A:                                                    DDD DDDDDDD                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NSSSGNVTHEKIPIGTEIEGMNILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRFFNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKIVEMKDIIVLVTSLGKYIFA 300
PathogenicSAV:                                                        K                                            
gnomAD_SAV:    K     I      TSIG VR   SR   YS M  M    PDAK K F C  S FDK M APMAC T  I    T  A G  M I N  M      #   T
Conservation:  1010101202424020414558888964975379666546624962943686479567654857657749486489773674634451177338989525
STMI:                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMM
SS_PSIPRED:           EEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          EEEEE E E       HHHHHHHHHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:            EEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:      N    N                                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATAFATCSSSATLPSMMKCIEENNGVDKRISRFILPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVE 400
PathogenicSAV:                                                                                 R                   
BenignSAV:                                                                                                       I 
gnomAD_SAV:      M  I     F   #   S P K  T#R    T SV    A             T   DRA  K G   V###S A  V   V    #T LTT  SIIQ
Conservation:  6469926892449945963364499629949724676759584965489645644464465624356565897996697985659854956765626202
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH        EEEE         HHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH HHHHHHHHH    HHHHHHH HHHHHHHH HH  H HHHHHHHHHHHH        EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        EEEE   EEE   HHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNAGQIFTILVTATASSVGAAGVPAGGVLTIAIILEAIGLPTHDLPLILAVDWIVDRTTTVVNVEGDALGAGILHHLNQKATKKGEQELAEVKVEAIPNC 500
PathogenicSAV:                                                     R   W                                           
BenignSAV:                                          T                                             E                
gnomAD_SAV:    FTTRRM  V MS  V   E   M S    I V M   TE        F     T  Q AM           S PD     P  E K K     A    S 
Conservation:  9424255554555485659697795975655566885768741355445648845864465688989946765842333210001104402311221210
STMI:                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                              
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHH HHHHHHH HH     
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH     HHHHEEHHHHHHHHH   EE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                       D         DDDD  

                       10        20        30  
AA:            KSEEETSPLVTHQNPAGPVASAPELESKESVL 532
gnomAD_SAV:     YQKGA*    Y   #  MD   G  CR  FM
Conservation:  10026138631001100011000100202414
SS_PSIPRED:                            HH      
SS_SPIDER3:                                    
SS_PSSPRED:                                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D   D 
MODRES_P:            S                   S  S