P43246  MSH2_HUMAN

Gene name: MSH2   Description: DNA mismatch repair protein Msh2

Length: 934    GTS: 3.341e-06   GTS percentile: 0.941     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 114      BenignSAV: 50      gnomAD_SAV: 641      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAVQPKETLQLESAAEVGFVRFFQGMPEKPTTTVRLFDRGDFYTAHGEDALLAAREVFKTQGVIKYMGPAGAKNLQSVVLSKMNFESFVKDLLLVRQYRV 100
PathogenicSAV:                                 P                                     R                     F       
BenignSAV:       LHQ  M                                  C V         #                T                  H    H    
gnomAD_SAV:    VVLLQE M H  NTG G L # L*  SK LISAM# LEPSELC##QR #V PSSG  LE #   E I  TE EH EII  I    QC A  H  LC CS 
Conservation:  4433522143233220011110102110120222211231222102213402332333232212102312322265483657355635353888434854
SS_PSIPRED:                HHHHH HHHHHH        EEEEEE    EEEEHHHHHHHHHHHHHHH  HH           EEE  HHHHHHHHHHHHHH   EE
SS_SPIDER3:         HH     HHHH  HHHHHH        EEEEEEE  EEEEE HHHHHHHHHH HHH EEEE       EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHH   EE
SS_PSSPRED:                HHHHH HHHHHH        EEEEEE    EEEHHHHHHHHHHHHHHHHH              EEE  HHHHHHHHHHHHHHH  EE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD                                                                                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD                                                                                      
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EVYKNRAGNKASKENDWYLAYKASPGNLSQFEDILFGNNDMSASIGVVGVKMSAVDGQRQVGVGYVDSIQRKLGLCEFPDNDQFSNLEALLIQIGPKECV 200
PathogenicSAV:          T                            S                     D###D       # P           #           #D
BenignSAV:          K                                                              V                               
gnomAD_SAV:     IHN KP #Q C  K  C  C # SSSV# V   F RS YT S TVG     ##A A   I G   E VEK VE     V YR CSV GV F T #Q   
Conservation:  5554633536226635814356788988497977986533242358467771222696625856458323635446693867468688686664468895
SS_PSIPRED:    EEEE            EEEEEEE        HHH       EEEEEEEEEEEE      EEEEEEEE    EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHH   EEE
SS_SPIDER3:    EEEE            EEEEEEEE       HH       EEEEEEEEEEEEEEE    EEEEEEEE    EEEEEEE    HHHHHHHHHHH    EEE
SS_PSSPRED:    EEEE            EEEEEEE        HHHH     EEEEEEEEEEEEE      EEEEEEEE              HHHHHHHHHHHHH   EEE
DO_DISOPRED3:                                  DDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPGGETAGDMGKLRQIIQRGGILITERKKADFSTKDIYQDLNRLLKGKKGEQMNSAVLPEMENQVAVSSLSAVIKFLELLSDDSNFGQFELTTFDFSQYM 300
PathogenicSAV:                                                                                   Y                 
BenignSAV:         Q                                                                  V                            
gnomAD_SAV:     #RRQ # YIR    VV    F    GE    CSEG  RNVKQ    E  K#  GG FS TDK    L V VIV    V P##Y  AR Q S  E RH I
Conservation:  4426521451143444545583536344424812462256845984246451245338755644655455355566866849565945726225373476
SS_PSIPRED:    E     HHHHHHHHHHHHH  EEEEE  HHH  HHHHHHHHHHHH             HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH           EEE HHH E
SS_SPIDER3:    EE    HHHHHHHHHHHHH   EEEE  HHH  HHHHHHHHHHHH              H   HHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEE   HHEE
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHH EEEE        HHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEEE     H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                          D                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KLDIAAVRALNLFQGSVEDTTGSQSLAALLNKCKTPQGQRLVNQWIKQPLMDKNRIEERLNLVEAFVEDAELRQTLQEDLLRRFPDLNRLAKKFQRQAAN 400
PathogenicSAV:     T    P   H               PD #  S E  P       #      R  S                                 M       
BenignSAV:                   V      D     P                                      I                      F          
gnomAD_SAV:        T   #VKV  DFI GP D# F  #  #   #A    V  H   RAF#Y   TAD    L   A  TGV RSS# Y  CQ #GF QF M LRTE  K
Conservation:  4993696266889636244123566735697764646656533586677747646764486685364183869517867598869855745558574464
SS_PSIPRED:    EE HHHHHHHHH           EEHHHHHH    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    E  HHHHHHH             EEHHHHHHH    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH             HHHHHH     HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQDCYRLYQGINQLPNVIQALEKHEGKHQKLLLAVFVTPLTDLRSDFSKFQEMIETTLDMDQVENHEFLVKPSFDPNLSELREIMNDLEKKMQSTLISAA 500
PathogenicSAV:                          R             P           VK                E                     V        
BenignSAV:                       K                                                                   E             
gnomAD_SAV:     #  CQ F  L P #  #E#V RY   #     V  L # P  L ELCN  K # AA  VA  G R  VAN L V HF#    TVDEVK NLLLI V P 
Conservation:  9656532443617562551753321914218516583277165037635554676688864564499797968688395488428606732643291189
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH     E     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                       D               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RDLGLDPGKQIKLDSSAQFGYYFRVTCKEEKVLRNNKNFSTVDIQKNGVKFTNSKLTSLNEEYTKNKTEYEEAQDAIVKEIVNISSGYVEPMQTLNDVLA 600
PathogenicSAV:      Y                 P                           P # W     V                    S   #       R    V
BenignSAV:                                      P                             A            T                       
gnomAD_SAV:    KGHD     H    CTVL#    H I M   A # ST   A  T  S I   Y   S I KV A  ER#C AT # T  DV IVF    DLI A SNMS#
Conservation:  4487776663579636332746777765478399662472447467777673643753356572636177557756676675455468378462566749
SS_PSIPRED:    HHH      EEEEEE    EEEEEEE   HHH       EEEEHHH EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH       EEEEE    EEEEEE HHHHHH      EEEEEE E  EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH       EEEE      EEEEEE  HHHH        EEEEE   EE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                DDDDDD  D                              
MODRES_A:                                                            K           K                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLDAVVSFAHVSNGAPVPYVRPAILEKGQGRIILKASRHACVEVQDEIAFIPNDVYFEKDKQMFHIITGPNMGGKSTYIRQTGVIVLMAQIGCFVPCESA 700
PathogenicSAV:   #      NE          #             P G#     E K    H   H   G        # K  #    T   R    #   # SML#   
BenignSAV:                     A           R           G                            L                            P 
gnomAD_SAV:    RV  L G S   H#VR# C Q G    RR #VV  P   SYIK EAQN      IC GRE  #   V  L V       *# V    I  #   L   T 
Conservation:  6795359771673499467799056114163517346997949373654999996082322526596698899999979996977597796979999326
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH          EE      EEEEEE     EEE          EEEE    EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH    E   EE      EEEE      EEEE     E    EEEE    EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH    EE    E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH         EE      EEEEEEE EEEEEE         EEEE     EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHH        E
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                                           GPNMGGKS                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EVSIVDCILARVGAGDSQLKGVSTFMAEMLETASILRSATKDSLIIIDELGRGTSTYDGFGLAWAISEYIATKIGAFCMFATHFHELTALANQIPTVNNL 800
PathogenicSAV:                       F     V  I               YK R                      V                          
BenignSAV:                          I                                    E          V  E     I                     
gnomAD_SAV:    K  T EYV GQ E # # WE I M I     ST V      N    T      A AS     TGVM   T RNF    I     PD P  TKH  S K V
Conservation:  3464395666997989775977979979959777996465337765688979999979889656757566733412823575676666596062337277
SS_PSIPRED:    EEEE EEE                 HHHHHHHHHHHHH     EEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE  HHHHHHHHHH    EEE
SS_SPIDER3:    EEE E EEEEE    H       HHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE    H HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   E EH H HHHHHHHHH   EEEE
SS_PSSPRED:    EEEE  E        HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEHHHHHHHHHHHHHH    EEE
DO_DISOPRED3:                     DDDDDDDDD                                                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HVTALTTEETLTMLYQVKKGVCDQSFGIHVAELANFPKHVIECAKQKALELEEFQYIGESQGYDIMEPAAKKCYLEREQGEKIIQEFLSKVKQMPFTEMS 900
PathogenicSAV:             V                         #     E                                                       
BenignSAV:           S     I                     H                        L                                 R      
gnomAD_SAV:        FSI K   I HR  E  S     SL VD TS   Q#TGYP#R SVKIDAC #MR LLE  T  SEVNR C   #K  TM  QL   G   S  A  
Conservation:  7757775223555583652939887887778665167247431643662666587122010101215713962215433771562278124424620165
SS_PSIPRED:    EEEEEEE  EEEEEEEEE         HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH HH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    EEEEEEE  EEEEEEEE         HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    EEEEEE   EEEEEEEEE       HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBB                     
DO_SPOTD:                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDD                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30    
AA:            EENITIKLKQLKAEVIAKNNSFVNEIISRIKVTT 934
PathogenicSAV:                               T   
BenignSAV:         R   I R                       
gnomAD_SAV:      YVR   RER    L#     LS M  *#EIIK
Conservation:  5225114623561262134625633642511012
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                  DD
DO_SPOTD:                                      DD
DO_IUPRED2A:                                     
MODRES_P:                          S