P43304  GPDM_HUMAN

Gene name: GPD2   Description: Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial

Length: 727    GTS: 2.554e-06   GTS percentile: 0.819     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 365      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAFQKAVKGTILVGGGALATVLGLSQFAHYRRKQMNLAYVKAADCISEPVNREPPSREAQLLTLQNTSEFDILVIGGGATGSGCALDAVTRGLKTALVER 100
gnomAD_SAV:       P     M  #  D   AAS  P*  Y  K  ##P FIE    V   A    S   G  R S      H   FV E  # D V E#I  R    R  G
Conservation:  8422131422223332323422333231313322123314253301111002157343253126211056755657797673797967579695797697
STMI:          TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT                                                          
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH              HHHHHHHHH     EEEEE   HHHHHHHHHHHH    EEEEE 
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH             HHHHHHHHH      EEEE   HHHHHHHHHHHH    EEEEE 
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH              HHHHHHHHHH    EEEEE   HHHHHHHHHHHH    EEEEE 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                
DO_IUPRED2A:                                                    DD    DDDD D                                       
NP_BIND:                                                                             DILVIGGGATGSGCALDAVTRGLKTALVE 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DDFSSGTSSRSTKLIHGGVRYLQKAIMKLDIEQYRMVKEALHERANLLEIAPHLSAPLPIMLPVYKWWQLPYYWVGIKLYDLVAGSNCLKSSYVLSKSRA 200
gnomAD_SAV:    G    R# R   #V        #N VV  G  K  T  ##F#GH        R        H   R    L S A     #SA   SF  R  I C  K 
Conservation:  3996997796979979999999769543793679469979927977994699665345676676769796997949994974679229744776657469
SS_PSIPRED:                      HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH      EEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEE HHHH
SS_SPIDER3:               HHHH HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH    E EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHH         EEE HHHH
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH     EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHH
DO_DISOPRED3:      DDDD   D                                                                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEHFPMLQKDKLVGAIVYYDGQHNDARMNLAIALTAARYGAATANYMEVVSLLKKTDPQTGKVRVSGARCKDVLTGQEFDVRAKCVINATGPFTDSVRKM 300
BenignSAV:                                                                    H                                    
gnomAD_SAV:    # L LIPR  R      C E  YKNV# S T   A    E    K    M   ER#E E    HLRSTW   I    K  M      S M   M   HT 
Conservation:  9759979567376576979676766776664736566647653469266327951132036101637355572377269664967667767977755958
SS_PSIPRED:    HHH         EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEEEEEEE        EEEEEEEEEE     EEEEEE EEEE     HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH         EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEEEEEEEEE     EEEEEEEEEEE     EEEEEE EEEE     HHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHH        EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE        EEEEEEEEEE     EEEEEEEEEEE      HHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DDKDAAAICQPSAGVHIVMPGYYSPESMGLLDPATSDGRVIFFLPWQKMTIAGTTDTPTDVTHHPIPSEEDINFILNEVRNYLSCDVEVRRGDVLAAWSG 400
BenignSAV:            V                                                                                            
gnomAD_SAV:    GY GTS V H G   L  TSV CGA       TVAT R         N M T   H    #AQR V     V     G H   R G    ## I  V   
Conservation:  8311212899688999986997779659999996999977997979766667765766725634749155657999396959742654997997766979
SS_PSIPRED:            EE    EEEE          EEEE       EEEEEE    EEEE               HHHHHHHHHHHHHH        HHHH EEE  
SS_SPIDER3:           EE E   EEEE          EEEE      EEEEEEE   EEEEEE              HHHHHHHHHHHHHHH      EHHHHHEHHEE
SS_PSSPRED:                  EEEE           EE        EEEEE     EEEE               HHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                        DDDDDDDDDDDD                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IRPLVTDPKSADTQSISRNHVVDISESGLITIAGGKWTTYRSMAEDTINAAVKTHNLKAGPSRTVGLFLQGGKDWSPTLYIRLVQDYGLESEVAQHLAAT 500
BenignSAV:                                                         Q                                               
gnomAD_SAV:     CT    TR  N ECV LSR  VV  R    VV   *   Q V    V S  QA      ST  A H P AR E*### CV      RH  K    P T 
Conservation:  7777956937479777797967255246767999999999959947667357116270524657356195962396894795768588862897699546
SS_PSIPRED:                        EEEE     EEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH             EE        HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EE                 EEEEE     EEEE  H HHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE  EEEE     HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                       EEEEE     EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH            EEE        HHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:           DD  D  DDD                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YGDKAFEVAKMASVTGKRWPIVGVRLVSEFPYIEAEVKYGIKEYACTAVDMISRRTRLAFLNVQAAEEALPRIVELMGRELNWDDYKKQEQLETARKFLY 600
BenignSAV:                             H                                                                           
gnomAD_SAV:      G   #  QIS     T RVD  C  L   S  SDL      CVRA ENI  HH HV#        GV SGT  V     K     NED V I# ##  
Conservation:  7946775997472999599977949997997999697196437976766955769999696979996779967647973392935054237621542695
SS_PSIPRED:    H   HHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H   HHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH HH H HHHHHH HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H  HHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YEMGYKSRSEQLTDRSEISLLPSDIDRYKKRFHKFDADQKGFITIVDVQRVLESINVQMDENTLHEILNEVDLNKNGQVELNEFLQLMSAIQKGRVSGSR 700
PathogenicSAV:                                   S                                                                 
gnomAD_SAV:     D  C A*T   I#CF     #   GSCE  V M # #      V   KH    VS       FYG           EIK S S # RRS# T    A W
Conservation:  3999673636853315863902165278369946993317999956998489346333535238677839996999967964995454243132045345
SS_PSIPRED:    HHH            HHHH  HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH       H
SS_SPIDER3:    HHH        H    H    HHHHHHHHHHHHHH     E   HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH        E HHHHHHHHHHHHH      H
SS_PSSPRED:    HHH          HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH  EEE   H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:            DDDDDDDDDD                                                                                    
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:      Y                                                                                                   
CA_BIND:                                                                              DLNKNGQVELNE                 

                       10        20       
AA:            LAILMKTAEENLDRRVPIPVDRSCGGL 727
gnomAD_SAV:      V TN   KSRNSGIS S  HT    
Conservation:  553454354324206126443645653
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH HH              
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH                 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:              D     DD      D
DO_SPOTD:                            DDDD 
DO_IUPRED2A: