P45844  ABCG1_HUMAN

Gene name: ABCG1   Description: ATP-binding cassette sub-family G member 1

Length: 678    GTS: 1.805e-06   GTS percentile: 0.581     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 309      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MACLMAAFSVGTAMNASSYSAEMTEPKSVCVSVDEVVSSNMEATETDLLNGHLKKVDNNLTEAQRFSSLPRRAAVNIEFRDLSYSVPEGPWWRKKGYKTL 100
gnomAD_SAV:      Y L      I V #N F    MQ TL   A HKM  G #KV  M    RQ   EE   S   #L   LW TD    L   F#L    T #K       
Conservation:  2222222222222222222222113112213144110010112021132211234343032244353247342354416135543514622233252526
SS_PSIPRED:      HH HHH                    EE                               HHHHH         EEEEEEEEEEE          EEEE
SS_SPIDER3:      H   H                                                      HHHHH         EEEEEEEEEEEE     E    EEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH                    E                                HHHH        EEEEEEEEEEEE           EE 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                
DO_IUPRED2A:                                                   D                                                   
LIPID:                                      C                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKGISGKFNSGELVAIMGPSGAGKSTLMNILAGYRETGMKGAVLINGLPRDLRCFRKVSCYIMQDDMLLPHLTVQEAMMVSAHLKLQEKDEGRREMVKEI 200
gnomAD_SAV:            HN  F S I A   R           G # #  TI V #M WN H LW  C      GL  L       V  LV      R   IK I  DL
Conservation:  5433592821326566689886888858659496633834825356623644545655486666354865444325854455465625303243256144
SS_PSIPRED:          EEE  EEEEEE      HHHHHHHHH       EEEEEE  EE  HHHHH  EEEE           HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        EEEEE  EEEEEE      HHHHHHHH        EEEEEE  EE  HHHHHHEEEEEE          HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         EEEE   EEEEE      HHHHHHHHH       EEEEEE   E  HHHHHHHHHHE           HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                        GPSGAGKS                                                                           
LIPID:                                                              C                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LTALGLLSCANTRTGSLSGGQRKRLAIALELVNNPPVMFFDEPTSGLDSASCFQVVSLMKGLAQGGRSIICTIHQPSAKLFELFDQLYVLSQGQCVYRGK 300
gnomAD_SAV:     IV S  Y TSM# EN AS  # # T V Q M   AA   N  AGS NNT      L     T #D# V    Y   T   Q  N*  I #    L W  
Conservation:  5245553232033411357864655665669556865446446489999467477597734762698675997759664555566676657578956480
SS_PSIPRED:    HHHH              HHH HH  HHHHHHH   EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE     HHHHHH  EEEEEE  EEEEE  
SS_SPIDER3:    HHH          E  E     HHHHHHHHHHH   EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE     HHHHH  EEEEEE  EEEEEE 
SS_PSSPRED:    HHHH               HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE     HHHHHH  EEEEEE  EEEEE  
DO_DISOPRED3:                 DDD   DD                                                                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VCNLVPYLRDLGLNCPTYHNPADFVMEVASGEYGDQNSRLVRAVREGMCDSDHKRDLGGDAEVNPFLWHRPSEEVKQTKRLKGLRKDSSSMEGCHSFSAS 400
gnomAD_SAV:        #   T F QS* S        I I  SKH#    Q # V W  LG   DRGV R#E K#   F  Q#P  L R  QF #   G LT G      TG
Conservation:  7229675841458499699998757696888769734119538522223101021101111100111221013222222222222222120242437444
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH          HHHHHHHHH       HHHHHHHHHH      HH          HHH    HHHHHHHHHH                   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH          HHHHHHHHH       HHHHHHHHH                   H H    HHHHHHHHH                    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH                          HHHHHHHHH                  H
DO_DISOPRED3:                                                    D           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        
DO_SPOTD:                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_IUPRED2A:                                                                                 DD                    
LIPID:                       C                                                                              C      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CLTQFCILFKRTFLSIMRDSVLTHLRITSHIGIGLLIGLLYLGIGNEAKKVLSNSGFLFFSMLFLMFAALMPTVLTFPLEMGVFLREHLNYWYSLKAYYL 500
gnomAD_SAV:    # MR#    RSII   T  L    #C IL  R S  N       R K   IS  YS     I   T #     I I H K  G       C C      M
Conservation:  4148625753754433276357565532895256567757762676661565674767778677677677776676455653763686685888864666
STMI:                                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH HHHHHHHHHHHH      HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH HH H H HHHHHHHHHH     HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHEHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
LIPID:              C                                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKTMADVPFQIMFPVAYCSIVYWMTSQPSDAVRFVLFAALGTMTSLVAQSLGLLIGAASTSLQVATFVGPVTAIPVLLFSGFFVSFDTIPTYLQWMSYIS 600
gnomAD_SAV:      P   #    TL   #   L # M    NTMC     T             V    T M   M ASM  A   LG   L   I V    M      H  
Conservation:  7563654859536842697446847358345167355244322346456566635844544569555388454586576696653524691665735636
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHH HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H HHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        
AA:            YVRYGFEGVILSIYGLDREDLHCDIDETCHFQKSEAILRELDVENAKLYLDFIVLGIFFISLRLIAYFVLRYKIRAER 678
BenignSAV:                                                                        L          
gnomAD_SAV:    C G   K       D  W   Y  V  M     L    W V           VI #      # V   I #   W   
Conservation:  679776674464775527124242211092552511663254523535427634753773259536745956642423
STMI:                                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH              EE   HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                           D DDD
DO_SPOTD:                                                                                DDDD
DO_IUPRED2A: