P48065  S6A12_HUMAN

Gene name: SLC6A12   Description: Sodium- and chloride-dependent betaine transporter

Length: 614    GTS: 2.039e-06   GTS percentile: 0.667     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 265      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDGKVAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYT 100
BenignSAV:              R                                                                                          
gnomAD_SAV:    V #    **FV  E     KD  N  R VKN    G    K I  M    RDST     C#        R  G   S   #L  *S L L    V     
Conservation:  1000001100120000200110022200111110244241452343453363436443342254332335446765883565326645333564446754
STMI:                                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        
SS_PSIPRED:                                 HHHHHH     HHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       EEE                    H HH H           EEEEEEEEEEE         HHH         HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH H
SS_PSSPRED:                                                EEHHHHHHHH    EE             EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBBBBBBBBBD                                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                 
DO_IUPRED2A:                       DD   DDDDDDD                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SQGSVTAWRKICPLFQGIGLASVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTPFENFTSPVMEFWERRVLGIT 200
gnomAD_SAV:     *   K# K   SV#         MK     FC VTPGCGV    G        MS SK     # M    P  SS M A              Q     
Conservation:  5575565833335352745354445214443686567677477523674125763471517753082232111101000021223364446644556345
STMI:                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                               
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHH                 HHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:       HHHHHHH  HH  H HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHH                 HHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                          HHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                              C        C                                  
CARBOHYD:                                                                            N           N                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAICQG 300
gnomAD_SAV:    L V    CQC    M    # IV   R *NAI F V MI    M LHP        D  V RV    V #    F HF    #   V I    F  V   
Conservation:  2864238253658436744694465996999584576879787879635625975763367761166156435531571644775677876558656547
STMI:                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMM                                   MMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH   HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:              HHHHHHHHHHHHHHHH           EEEEE     HHHHHHHH           EEEEE   HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHEEE                HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAESGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCV 400
gnomAD_SAV:    W    S N RC         T      D   M RC   PF   #     #   QM K  LE   VT L    V H    *F      PLI E    Y Y 
Conservation:  3465465651525665553324527463775256556865888862552454336634677848665735635482543543657355454865478865
STMI:          MMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    HHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH HH   EEEEE HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH   EEEEEE HHHHH     HHHH    HHHHH     HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH   EEEEE  HHHHH    HHHHHHHHHHHHHH      HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ECLVTASIDMFPRQLRKSGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYGADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKIS 500
gnomAD_SAV:    *YMM  F      R W  RW#K   R MTIV   #E     KSR# L    V*C   SV       C AI   CGC VNCSC D     S Q SS M   
Conservation:  9535653384481265433386265423432353386343668856558575354379465754524643465635953487265579896591134635
STMI:                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  E EEEEEEEHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHH     HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH      HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYSIGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFGPSP 600
gnomAD_SAV:        N       S    N HSLI   DICG LT    V   V#   #   L  II  F   Q T S H C            E #      S WHS S  
Conservation:  9134794483348375535428636730626917731486266345426363222213112263315221031131123100112222222222222011
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                            
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH                            
SS_SPIDER3:    HH  HHHHHHHHHHHHH     EEE  EEE  HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH     HHHHHHHH                            
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH                            
DO_DISOPRED3:                                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                      DD    DDDDD      

                       10    
AA:            TREGLIAGEKETHL 614
gnomAD_SAV:    A  R T RG Q   
Conservation:  21011000112202
SS_PSIPRED:                  
SS_SPIDER3:                  
SS_PSSPRED:                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:     D   DD