P48066  S6A11_HUMAN

Gene name: SLC6A11   Description: Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3

Length: 632    GTS: 1.135e-06   GTS percentile: 0.283     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 229      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTAEKALPLGNGKAAEEARESEAPGGGCSSGGAAPARHPRVKRDKAVHERGHWNNKVEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVVFFICCG 100
gnomAD_SAV:                          T        D V  L   FE NR  Y      K   LM   T#          I   S  K*R      SMM      
Conservation:  1000000100002222222222222222220100222202001111102432414423333533634365433422543323354467658835653266
STMI:                                                                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                   HH                                     HHHHHHHHHHHHH    HHH    HHHH      HHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:                  HHH                                   H  HHHEEHHEHHHE    HEEE  HEE         HHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:                                                           EEEEEEHHH HH     EEE   EEE      EEHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                   
DO_IUPRED2A:              D DD DD DDDD DDD DD        DDDD  D                                                       
MODRES_P:                          S                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IPVFFLETALGQFTSEGGITCWRKVCPLFEGIGYATQVIEAHLNVYYIIILAWAIFYLSNCFTTELPWATCGHEWNTENCVEFQKLNVSNYSHVSLQNAT 200
gnomAD_SAV:     #I           G S VM      S L    C       Y     V   T    F  S   #   # I E        MA *  K  D NRE      
Conservation:  4533356444675455755658333353527353533442144436865676774775236741257634715177530822311222110100001223
STMI:          MMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                 
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      HH               
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH H    HHHHHH  HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    H                  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                            N  N       N  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SPVMEFWEHRVLAISDGIEHIGNLRWELALCLLAAWTICYFCIWKGTKSTGKVVYVTATFPYIMLLILLIRGVTLPGASEGIKFYLYPDLSRLSDPQVWV 300
BenignSAV:                                                                             I                           
gnomAD_SAV:    Y  V     Q# DV  R  RVR  #     Y   S* # S  V         I  L   S  V M    L# IM* RT             Q  N#H  L
Conservation:  3644466345573452954248253658436744694465996999584576879787879635625975763367761166156435531571644775
STMI:                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMM                              
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH   HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH    HHHH   HHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHH  HHH            HHHHHHHHHHHHHHHH           EEEEE    HHHHHHHHHH         EEEEEEE  HHHH  HHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE HHHHHHHHHHHH      HHHHHEEEE   HHH      EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DAGTQIFFSYAICLGCLTALGSYNNYNNNCYRDCIMLCCLNSGTSFVAGFAIFSVLGFMAYEQGVPIAEVAESGPGLAFIAYPKAVTMMPLSPLWATLFF 400
gnomAD_SAV:    E EM  I FC        T    SS         VT W V  S  VM   S        V   R  V       LS T  V   V   T   L  #  L 
Conservation:  6778765686565473465465651525665553324527463775256556865888862552454336634677848665735635482543543657
STMI:               MMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                MMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH   EEEEE HHHHH    HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH     EEEEE HHHHH     HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    E HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH   EEEEE  HHHHH    HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MMLIFLGLDSQFVCVESLVTAVVDMYPKVFRRGYRRELLILALSVISYFLGLVMLTEGGMYIFQLFDSYAASGMCLLFVAIFECICIGWVYGSNRFYDNI 500
gnomAD_SAV:    #I            L     TA# RC RF QK  WQ  FS  S I  C    M    S T V     FCS    Y   M TS SF L    # #Q C   
Conservation:  3554548654788659535653384481265433386265423432353386343678856558575354379465754524643465635953487265
STMI:          MMMMMMMM                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH   E EEEEEEEEH   H HHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH      HHHHHHHHHHHH  HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDMIGYRPPSLIKWCWMIMTPGICAGIFIFFLIKYKPLKYNNIYTYPAWGYGIGWLMALSSMLCIPLWICITVWKTEGTLPEKLQKLTTPSTDLKMRGKL 600
BenignSAV:                       T                                                                                 
gnomAD_SAV:    K  TS#Q LLVV LF I I#    V  L    T CN V#   # I                   LT   GVIA NM  I  K    FMNT      WD F
Conservation:  5798965911346359134794483348375535428636730626917731486266345426363222213112263315221031131123100110
STMI:                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                             
SS_PSIPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH             
SS_SPIDER3:    HHHH     HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH      EE  EE   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHH             
SS_PSSPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:                                                                                                    DD
DO_SPOTD:                                                                                                  DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30  
AA:            GVSPRMVTVNDCDAKLKSDGTIAAITEKETHF 632
gnomAD_SAV:     LR W  IG  Y       R  T      M  
Conservation:  11002212222222222222222220112202
SS_PSIPRED:                                    
SS_SPIDER3:         EEE             E          
SS_PSSPRED:                                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: