P48067  SC6A9_HUMAN

Gene name: SLC6A9   Description: Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1

Length: 706    GTS: 1.932e-06   GTS percentile: 0.629     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 333      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSGGDTRAAIARPRMAAAHGPVAPSSPEQVTLLPVQRSFFLPPFSGATPSTSLAESVLKVWHGAYNSGLLPQLMAQHSLAMAQNGAVPSEATKRDQNLKR 100
gnomAD_SAV:    VNSR MW TMT# KI TVD S  LFF K  MR  IR    M S      C C  QC  N  R T     F  F V#Q  T GR   G #    S  K  Q
Conservation:  3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333154166231141221125
SS_PSIPRED:                  HHH         HHHH                                        HHHHHHHHHHHH        HH        
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHH           HH                         H HHHH           HHHHHHHHHHH       HHHH       
SS_PSSPRED:                                      HHHH                                HHHHHHHHHHH                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD                                                             DDDDDDD D  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GNWGNQIEFVLTSVGYAVGLGNVWRFPYLCYRNGGGAFMFPYFIMLIFCGIPLFFMELSFGQFASQGCLGVWRISPMFKGVGYGMMVVSTYIGIYYNVVI 200
PathogenicSAV:                                                                      E                              
gnomAD_SAV:       D H K   M M C M   DA        L R  T I       M *R# F  #      I      E#        *  C        VSV     N
Conservation:  7493555663544465649993797496676944479773944464534448243346664644634644643229597954555356757797797776
STMI:                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                               MMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHH           HHH      HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH HHH    HHHHHH HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      H  HHHHHHHHHHHH  HHHHH  HHH      E   HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHH    E               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CIAFYYFFSSMTHVLPWAYCNNPWNTHDCAGVLDASNLTNGSRPAALPSNLSHLLNHSLQRTSPSEEYWRLYVLKLSDDIGNFGEVRLPLLGCLGVSWLV 300
BenignSAV:                                   S              T                                                      
gnomAD_SAV:        CFY#L  MRM      KKT  MR  TS   # K  S  WS T SRK P      VK S   D      M R   N R # KGL  F    SI S  
Conservation:  7676656828532368653636266312524622010011120210110234112516249569646584235813836593563353444486266927
STMI:          MMMMMMMM                                                                             MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH                                          HH         HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH                  H H                   HHHH         HHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH                                                     HHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VFLCLIRGVKSSGKVVYFTATFPYVVLTILFVRGVTLEGAFDGIMYYLTPQWDKILEAKVWGDAASQIFYSLGCAWGGLITMASYNKFHNNCYRDSVIIS 400
gnomAD_SAV:    I     Q LN     G  M M   M   V L CR   K G    V   SL*  N       V            V V F  V   #       QN I L 
Conservation:  9779944777365496977999795999799579679697329737777979247625797657574656577445456457676766477747977796
STMI:          MMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    
SS_PSIPRED:    HHHHHHH HH    HHHHH HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH         HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH     H    EEEEHH    HHHHHHHH           EEEEEE   HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH      EEEEEEEHHHHHHHHHHHHH      HHH HEEEE   HHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ITNCATSVYAGFVIFSILGFMANHLGVDVSRVADHGPGLAFVAYPEALTLLPISPLWSLLFFFMLILLGLGTQFCLLETLVTAIVDEVGNEWILQKKTYV 500
PathogenicSAV:       G                                                                                             
gnomAD_SAV:    # TG   FCV  IV FV S   S#  MA  #        TSM   K F  I   LM     L L               M       A  KR     ICM
Conservation:  4777679457775997779467144454661776669996767999799999779697599996979679977979997977667776444582327237
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH    EEEE HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH   EEEEEE HHHHH     HHHHHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H  HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH   EEEEE HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLGVAVAGFLLGIPLTSQAGIYWLLLMDNYAASFSLVVISCIMCVAIMYIYGHRNYFQDIQMMLGFPPPLFFQICWRFVSPAIIFFILVFTVIQYQPITY 600
gnomAD_SAV:    NF M M A     A         M      V C   M   SNT   VTC  R Q#    F LVQ  LTS L RVF CC  ST  L         FKLTI 
Conservation:  7446653766576665576946666957566865696656756954566577312542533458655872454445533782443445554534434524
STMI:               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH    EEHEEEHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NHYQYPGWAVAIGFLMALSSVLCIPLYAMFRLCRTDGDTLLQRLKNATKPSRDWGPALLEHRTGRYAPTIAPSPEDGFEVQPLHPDKAQIPIVGSNGSSR 700
BenignSAV:                                                   V                             S                       
gnomAD_SAV:     R E     MVL    #V  IV N  #T  WF HI VN I  H   V    G C#      WR HHT   V Y   VLKIH  QL#EG   TMDI    H
Conservation:  5243361434238526546863548245232211235244154451423521164734033314344211122120033133423521213104323210
STMI:                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                      
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH        HHHHHH                                       
SS_SPIDER3:      E   HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH      HHHHHHHH        HHHH                    E            E       
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH          HHHH                                       
DO_DISOPRED3:                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                   D            DD     
MODRES_P:                                                                              S                        S  

                     
AA:            LQDSRI 706
gnomAD_SAV:     *VAG 
Conservation:  211313
SS_PSIPRED:          
SS_SPIDER3:          
SS_PSSPRED:          
DO_DISOPRED3:  DDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDD
DO_IUPRED2A:      DDD