P48378  RFX2_HUMAN

Gene name: RFX2   Description: DNA-binding protein RFX2

Length: 723    GTS: 1.276e-06   GTS percentile: 0.344     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 317      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MQNSEGGADSPASVALRPSAAAPPVPASPQRVLVQAASSNPKGAQMQPISLPRVQQVPQQVQPVQHVYPAQVQYVEGGDAVYTNGAIRTAYTYNPEPQMY 100
BenignSAV:                                                                                          T              
gnomAD_SAV:    # HYKDRV L V MVPH LV VL LS           N     P #           S    LE  M HV MR M AANTI  SRTT*    C   T  H
Conservation:  1111222210111225121122332222234231321211352120313111110011111112122431232445323124223123335341244233
SS_PSIPRED:                                  EEEEE                                    EEEE     EE    EE            
SS_SPIDER3:                                  E                                        EEEEE   EEE    E             
SS_PSSPRED:                                  EEEE                                                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD    DD                DDD    DDDDDD  
MODRES_P:                                 S                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            APSSTASYFEAPGGAQVTVAASSPPAVPSHSMVGITMDVGGSPIVSSAGAYLIHGGMDSTRHSLAHTSRSSPATLEMAIENLQKSEGITSHKSGLLNSHL 200
gnomAD_SAV:    T  NM P  K   CVHAIM  L LSV L D    M VG ERNT I  TRSF   EV     R   Y CC    M   V     NNK VI # #S   C F
Conservation:  2333321444213123342233332323243545525332342233243243424122121111221232252553253434233443435531665654
SS_PSIPRED:                   EEE                        EEE     EEEE                  HHHHHHHHHHHH         HHHHHHH
SS_SPIDER3:                   EEE                         EE     EEE                   HHHHHHHHHHH            HHHHH
SS_PSSPRED:                    E                                EEE                     HHHHHHHHHH            HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_IUPRED2A:    DDDDD        D   DDDDDD   D DDDDD                           DDDDDDDDDD   DDD D DD D    DDD         
DNA_BIND:                                                                                                        HL

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QWLLDNYETAEGVSLPRSSLYNHYLRHCQEHKLDPVNAASFGKLIRSVFMGLRTRRLGTRGNSKYHYYGIRLKPDSPLNRLQEDTQYMAMRQQPMHQKPR 300
gnomAD_SAV:       V  C       I   #      QD    Q     T  L    H              S     H   CV L     Q    MRC# T#  R      
Conservation:  5643356637475353433532335253322265543553354455346565454556344534464464424414330320341233823334122114
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH          HHHH  EEE    EEEE      EEEEE  EE     HHH HHHHHHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHH EEE   E E HHHHHHHHHHHHH              EEEEEE   EEEE       EEE   EE       HHHH HHHHHHH         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH             EEEE                E  E             HHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                 D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DNA_BIND:      QWLLDNYETAEGVSLPRSSLYNHYLRHCQEHKLDPVNAASFGKLIRSVFMGLRTRRLGTRGNSKYHYYGIRLKP                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YRPAQKTDSLGDSGSHSGLHSTPEQTMAVQSQHHQQYIDVSHVFPEFPAPDLGSFLLQDGVTLHDVKALQLVYRRHCEATVDVVMNLQFHYIEKLWLSFW 400
gnomAD_SAV:      S   M  FR  SF  SV   LV  VSM           F I S   # N   V   NDI   NI T      W  K   N       Y MK V     
Conservation:  2342471331243010311122151333441443435451551443622332110133313011352255035628666347844586525562562497
SS_PSIPRED:                            HHHHH                      HHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                          HHHHHHH                        HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:                                  HHHH                            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                  
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NSKASSSDGPTSLPASDEDPEGAVLPKDKLISLCQCDPILRWMRSCDHILYQALVEILIPDVLRPVPSTLTQAIRNFAKSLEGWLTNAMSDFPQQVIQTK 500
gnomAD_SAV:    D  T   HSL  V   GK AK TI #R        FNS  K V     VF    MKT  RE   L     I  TC       D  AS I E       N 
Conservation:  2221211111223111230141114610173055323342173305551446265335334343524233443575546465364126411362134238
SS_PSIPRED:                              HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_SPIDER3:                           E  HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH
SS_PSSPRED:                              HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
DO_DISOPRED3:         DDDDDDDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:          DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                
DO_IUPRED2A:          DDDDDDDDDDDDD                                                                                
MODRES_P:                     S                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VGVVSAFAQTLRRYTSLNHLAQAARAVLQNTSQINQMLSDLNRVDFANVQEQASWVCQCEESVVQRLEQDFKLTLQQQSSLDQWASWLDSVVTQVLKQHA 600
gnomAD_SAV:    M I#   T M QH M  S  GH  QV    M  N  R        L  MRD  L     KQ    W               NE  RC    I HI     
Conservation:  4244444444675374436343545435354445356956766777364674668654425135335528642464353674456166424613474231
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH HH    HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GSPSFPKAARQFLLKWSFYSSMVIRDLTLRSAASFGSFHLIRLLYDEYMFYLVEHRVAEATGETPIAVMGEFNDLASLSLTLLDKDDMGDEQRGSEAGPD 700
BenignSAV:              Q                                                                                          
gnomAD_SAV:    D L     T      * L  AT     N   T   S     H   N  V      #I K  R M VT      N TT   MPI T GT NK H NKV  E
Conservation:  2222443495336433353654457575546443453434564666666666564745133522433333452322102121152420200011000000
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHH    HHHH                      
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      H         H                       
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHE  HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH       HHHH                     
DO_DISOPRED3:                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                           DDDDDDDDDDDD

                       10        20   
AA:            ARSLGEPLVKRERSDPNHSLQGI 723
gnomAD_SAV:    TL        Q HG  KYP RDT
Conservation:  11000210221220110112211
SS_PSIPRED:                           
SS_SPIDER3:                           
SS_PSSPRED:                           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDD  DDD DDDDD