P48380  RFX3_HUMAN

Gene name: RFX3   Description: Transcription factor RFX3

Length: 749    GTS: 3.66e-07   GTS percentile: 0.018     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 225      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MQTSETGSDTGSTVTLQTSVASQAAVPTQVVQQVPVQQQVQQVQTVQQVQHVYPAQVQYVEGSDTVYTNGAIRTTTYPYTETQMYSQNTGGNYFDTQGSS 100
gnomAD_SAV:        KSEL    A NV       V A MHM   IR      R PP R       P   C   RNS     S#   M     A I #    A    A    
Conservation:  1111222210111225121122322123423132103113001111112122431232445323124223124333534244233233332144421311
SS_PSIPRED:                               EEEEEE      EEEEE             EEE     EE                                 
SS_SPIDER3:                                 EE                           E      EE                          E      
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                   DDDD   DDDDDD    DDDDDDDDD    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AQVTTVVSSHSMVGTGGIQMGVTGGQLISSSGGTYLIGNSMENSGHSVTHTTRASPATIEMAIETLQKSDGLSTHRSSLLNSHLQWLLDNYETAEGVSLP 200
gnomAD_SAV:    S  A#MA  YCL CA    L II   #S I   S   S  V   RQ #  #SQ#F VS   V      #        C   N      G           
Conservation:  2334223324354111552533234222324323434341221211112212322525532534342334434355316656545643356637475353
SS_PSIPRED:                              EE     EEEE                    HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:                               E      E E                     HHHHHHHHH           H  HHEEEEEEHEEEE  EE E
SS_PSSPRED:                                                             HHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      
DO_IUPRED2A:       DDD                               DDDDDDDDDDDDDDDDD   DDD           DD                          
DNA_BIND:                                                                                        HLQWLLDNYETAEGVSLP

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RSTLYNHYLRHCQEHKLDPVNAASFGKLIRSIFMGLRTRRLGTRGNSKYHYYGIRVKPDSPLNRLQEDMQYMAMRQQPMQQKQRYKPMQKVDGVADGFTG 300
gnomAD_SAV:      S   L         V                #  *                L    G    #    #   T    TT  Q   NAL  A  F HR   
Conservation:  4335323352533222655435533544553465654545563445344644644244143303203412338233341221142342471331243010
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH     EEEE            EE      HH HHHHHHHHHH  HHHH                   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH       HHHH   EEEEEE   EEEE  E      E   EE      HHHHHHHHHHHHH              E          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHH    EEE                      HHHHHHHHHHHHHH H HHHHH                
DO_DISOPRED3:                                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                   DDDDDDDDDD DDDDD DDDDDD        DDDDD
DNA_BIND:      RSTLYNHYLRHCQEHKLDPVNAASFGKLIRSIFMGLRTRRLGTRGNSKYHYYGIRVKP                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGQQTGTSVEQTVIAQSQHHQQFLDASRALPEFGEVEISSLPDGTTFEDIKSLQSLYREHCEAILDVVVNLQFSLIEKLWQTFWRYSPSTPTDGTTITES 400
BenignSAV:                                                                                                    I    
gnomAD_SAV:     S #KA  A  I     #Q     G   V             GA                      I     L                 AI  SIN  P
Conservation:  3121122215133344144343545155144362233211013130113522550356286663478445865255625624972221211111223111
SS_PSIPRED:                       HHHH  HHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH               
SS_SPIDER3:                        HHH                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH                
SS_PSSPRED:                     HHHHHH HHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                  DDDD   DD
DO_IUPRED2A:   DDD  DDDDDDDD                                                                                DDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SNLSEIESRLPKAKLITLCKHESILKWMCNCDHGMYQALVEILIPDVLRPIPSALTQAIRNFAKSLEGWLSNAMNNIPQRMIQTKVAAVSAFAQTLRRYT 500
gnomAD_SAV:         V  Q       S                 T ET            V  V          R   G  S          #    T            
Conservation:  2301411114610173055323342173305551446265335334343524233443575546465364126411362134238424444444467537
SS_PSIPRED:       HHHHHH  HHHHHHHH  HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHH    EEEEH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DD D   D                                                                                            
DO_SPOTD:      D                                                                                                   
DO_IUPRED2A:   DD                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLNHLAQAARAVLQNTSQINQMLSDLNRVDFANVQEQASWVCQCDDNMVQRLETDFKMTLQQQSTLEQWAAWLDNVMMQALKPYEGRPSFPKAARQFLLK 600
gnomAD_SAV:    W                              S     TC       TV   V  G RV    H       V I   V    R F   S  # V       
Conservation:  4436343545435354445356956766777364674668654425135335528642464353674456166424613474231222244349533643
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH      HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH      HHHHH H     HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WSFYSSMVIRDLTLRSAASFGSFHLIRLLYDEYMFYLVEHRVAQATGETPIAVMGEFGDLNAVSPGNLDKDEGSEVESEMDEELDDSSEPQAKREKTELS 700
gnomAD_SAV:       H  V                   C    K         L      # V  I    #   A S    Q  V  LQ KIGQ  G#P       #   P 
Conservation:  3353654457575546443453434564666666666564745133522433333452322102121152420200000000011000210221220110
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH                                     HHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                     H          H   H  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH                                        HHH    
DO_DISOPRED3:                                               D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        5
AA:            QAFPVGCMQPVLETGVQPSLLNPIHSEHIVTSTQTIRQCSATGNTYTAV 749
gnomAD_SAV:     #  ACYV     PSM S F SLT  K VIA   S  R NT   A A  
Conservation:  1122111111111111121111011111111111111111111111111
SS_PSIPRED:              HH                       EE            
SS_SPIDER3:               H                 E              EEE  
SS_PSSPRED:                                                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                    DD   DDD DD   DDDDDD   DD