P48449  LSS_HUMAN

Gene name: LSS   Description: Lanosterol synthase

Length: 732    GTS: 3.088e-06   GTS percentile: 0.914     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 12      BenignSAV: 10      gnomAD_SAV: 434      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTEGTCLRRRGGPYKTEPATDLGRWRLNCERGRQTWTYLQDERAGREQTGLEAYALGLDTKNYFKDLPKAHTAFEGALNGMTFYVGLQAEDGHWTGDYGG 100
PathogenicSAV:            D                                                                                        
BenignSAV:                                   K                                                                     
gnomAD_SAV:       S Y QLGV# C NKST    CR FS DKS H    VL  C  #K  V  T       N   M  # VR T Q ##SEI VFMR     ER  AH  V
Conservation:  2222323456575233263547255541311544151311121025244256432465221133113414154023415630331064434535324335
SS_PSIPRED:                            EEEE     EEEEE          HHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHH            
SS_SPIDER3:                           HEEEE      EEEE           HHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHH             
SS_PSSPRED:                                     EEE        HHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:  DDDDDD DDDD                                                                                         
DO_SPOTD:      DDDDDD                                                                                              
DO_IUPRED2A:     D    DDDDDD                          D                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PLFLLPGLLITCHVARIPLPAGYREEIVRYLRSVQLPDGGWGLHIEDKSTVFGTALNYVSLRILGVGPDDPDLVRARNILHKKGGAVAIPSWGKFWLAVL 200
PathogenicSAV:  V                                                                                                  
BenignSAV:                                                                               Q                         
gnomAD_SAV:    L    SC      MVCVL   R  G  MQ VW L    D     V A   M  IV YC F  M DI S N    Q W   Q#E D M        C  A 
Conservation:  2531247555345242325314242742964352862665575836315554755658446868834654453356831551489941445699599665
SS_PSIPRED:      HH HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH    EE  HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH       E        HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH   HEE   HHHHHHHH 
SS_PSSPRED:      E  HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH  EEE  HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NVYSWEGLNTLFPEMWLFPDWAPAHPSTLWCHCRQVYLPMSYCYAVRLSAAEDPLVQSLRQELYVEDFASIDWLAQRNNVAPDELYTPHSWLLRVVYALL 300
PathogenicSAV:         Y                                      P           P                                        
BenignSAV:                                                       V                 T                 M             
gnomAD_SAV:      HG  A TIVL DIR    RTL Y F H* Y Q   MTT  G TIQP  VDGLR    CR  *   VT T   V   SMVSNK HMS     H#I#V  
Conservation:  8685958464449856666162836842286669556754468541552514426636654876446611728363632732362547562661223233
SS_PSIPRED:                HHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH    HHH  HHHH      HHH    HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       E        HHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH     HH                   HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H           HHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NLYEHHHSAHLRQRAVQKLYEHIVADDRFTKSISIGPISKTINMLVRWYVDGPASTAFQEHVSRIPDYLWMGLDGMKMQGTNGSQIWDTAFAIQALLEAG 400
PathogenicSAV:                                          S                                                S         
BenignSAV:              R                                                                                          
gnomAD_SAV:      C P  R YRG*#SL   D  V VNN#L Q   MS# L  T#T A#C  YR PTSV    I   L *  LD    E R  SS*K C ATSTF T   V 
Conservation:  6468238420682363134336617882753255454736345684482357217145649534828669652565469646979597749669947664
SS_PSIPRED:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH HHHEEE     EEE      HHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH  HEEEE     EE      HHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHEEE     EEE       HHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                                             W             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GHHRPEFSSCLQKAHEFLRLSQVPDNPPDYQKYYRQMRKGGFSFSTLDCGWIVSDCTAEALKAVLLLQEKCPHVTEHIPRERLCDAVAVLLNMRNPDGGF 500
gnomAD_SAV:       SSD LC     R      E    T N RN  H  C   S   M   S  I   A  TFR#     KQ SQ  K N  KW  G           G VS
Conservation:  4420315014711861652268734434352557863387565674254593548676865653665531633421122034623674544355624484
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH                     HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH          EE      E   HHHHHHHHHHHHH H         HHHHHHHHHHHHH       E
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHH        HHH                    EE HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                  F                                                        
ACT_SITE:                                                            D                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATYETKRGGHLLELLNPSEVFGDIMIDYTYVECTSAVMQALKYFHKRFPEHRAAEIRETLTQGLEFCRRQQRADGSWEGSWGVCFTYGTWFGLEAFACMG 600
PathogenicSAV:                S                                                                R      S            
gnomAD_SAV:      C   HWE  M  VS#L F R TI           AV V     RC L  K#G  L N MRV Q#F#WR   N     #*     C#A  DP    YI 
Conservation:  5356225541343332534456335567377898765455711840049366206532472367268322832797959387698698469768656564
SS_PSIPRED:             HHHHH  HHHHH   EE    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:            HHHHHH   HHH   EE     HHHHHHHHHHHHHHHHH  HH  HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:      EE     HHHHH   HHH   EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                                       W                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QTYRDGTACAEVSRACDFLLSRQMADGGWGEDFESCEERRYLQSAQSQIHNTCWAMMGLMAVRHPDIEAQERGVRCLLEKQLPNGDWPQENIAGVFNKSC 700
PathogenicSAV:                             C                                                                       
BenignSAV:                  W       Q                   V                                             L            
gnomAD_SAV:       Q#A T#   FQ R    FG  TG  #  EL ##KGWH MH TR    D     #  T IQ    K RG   Q      F S NGLP DV    S  S
Conservation:  5161230440571368188623852597768376873342955510565536488656852444621033546530741373358556633235443555
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHH                  EE       HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH         HHH EEEE    
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHHHHHHH         HEE   EEE       H HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH          HEEEEEE EE
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH                   E
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30  
AA:            AISYTSYRNIFPIWALGRFSQLYPERALAGHP 732
PathogenicSAV:     K                           
gnomAD_SAV:    GV  AN G    LLV CC   Q RQTTF#   
Conservation:  33352254435543455442134401132211
SS_PSIPRED:    EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH    
SS_SPIDER3:    EE    HH HHHHHHHHHHHHH  HHH     
SS_PSSPRED:    EE     HHHHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                              DDDD
DO_SPOTD:                                DDDDDD
DO_IUPRED2A: