P48506  GSH1_HUMAN

Gene name: GCLC   Description: Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit

Length: 637    GTS: 1.085e-06   GTS percentile: 0.261     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 207      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGLLSQGSPLSWEETKRHADHVRRHGILQFLHIYHAVKDRHKDVLKWGDEVEYMLVSFDHENKKVRLVLSGEKVLETLQEKGERTNPNHPTLWRPEYGSY 100
BenignSAV:                                                           S                                             
gnomAD_SAV:        F      C       N   QY FI I RV D A NGY  A       Q I LY E   #  Q A F         KN   A     A      E  
Conservation:  7534225131132122213221101221212122113222121221153499979534541247746292622462497149943997999999999669
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEE   EEEEEEEEE    EEEEEE HHHHHHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:               HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH       E E   EEEEEEEEE    EEEEE  HHHHHHHHH                 H HH
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           EEEEEEEEE      EEEE  HHHHHHHHHHH                   
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                DDDD                                                           DDDDDDDDDDDDDDD D DDD D 
MODRES_P:          S  S                                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MIEGTPGQPYGGTMSEFNTVEANMRKRRKEATSILEENQALCTITSFPRLGCPGFTLPEVKPNPVEGGASKSLFFPDEAINKHPRFSTLTRNIRHRRGEK 200
PathogenicSAV:                           C                              L             T                            
gnomAD_SAV:    #         RR   K  I  G  Q CQ     M         V    G A LR    KIRLH E E       V   T  R           *      
Conservation:  9977799799996977999974972399397454701224555674799797679909320927261667797999977970799966799996699999
SS_PSIPRED:                 HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH   EEEEEE                               HHHH   HHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HEE          HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH   EEEEEE                                HHHH    HHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE                                HHH      HHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      DDD DD DDDDDDDDDDDDDD   DDDD D                        D  DDD    DD                DDDDDD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VVINVPIFKDKNTPSPFIETFTEDDEASRASKPDHIYMDAMGFGMGNCCLQVTFQACSISEARYLYDQLATICPIVMALSAASPFYRGYVSDIDCRWGVI 300
gnomAD_SAV:      VSI RINNEK S ALV   IKE        L  VHLV V                GV            M  V   S T     P #   V    R  
Conservation:  7499496749327439739093142544244356679796999997997979779997719976999999659776797765675999477769997777
SS_PSIPRED:     EEE                    HHHHH      EEEE           EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HH         HHHH
SS_SPIDER3:     EEE              H       H        EEEE            EEEE   HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH   HHHH E       HHHH
SS_PSSPRED:     EEE                    HHHH       EEE          EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     E  EEE    HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                     DDDDDDD   D  D                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SASVDDRTREERGLEPLKNNNYRISKSRYDSIDSYLSKCGEKYNDIDLTIDKEIYEQLLQEGIDHLLAQHVAHLFIRDPLTLFEEKIHLDDANESDHFEN 400
PathogenicSAV:                                                                      L                              
BenignSAV:                                                   N                                                     
gnomAD_SAV:            L  Q V R     CK N  L   T N  F Y KEC  VN MT    CK     A VN VG* A       S  #  G     Y       D 
Conservation:  9997999929997926563527693999997979999096579997477552373049403779479799599999999737649674479477799997
SS_PSIPRED:    HHH     HHHH                    HHHHHH             HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HH   EE           HH
SS_SPIDER3:    H  H    HHH               E    HHHHHHH             HHHHHHHHH    HHHHHHHHHH      HH HHHH          HHH
SS_PSSPRED:    HHH     HHHH                      HHH              HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH       HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:            DDDD DDDD                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IQSTNWQTMRFKPPPPNSDIGWRVEFRPMEVQLTDFENSAYVVFVVLLTRVILSYKLDFLIPLSKVDENMKVAQKRDAVLQGMFYFRKDICKGGNAVVDG 500
BenignSAV:                                                                  S                                      
gnomAD_SAV:                S  S   V      *S         SATS     Q       *R   P S       I I   I V  K  L    G  E SSS   D
Conservation:  7999999799997777677997677776579999999979799979999997997666777997797676649949769226499969843844323263
SS_PSIPRED:    HH     EEEE           EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE HHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEE              
SS_SPIDER3:    H     EEEEE          EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE  HHHHHHHHHHHHHHHH    EE              
SS_PSSPRED:    HH                    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH HHHH   EEE             
DO_DISOPRED3:                                                                                               DDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                   DDDDDDD
DO_IUPRED2A:           DD                                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CGKAQNSTELAAEEYTLMSIDTIINGKEGVFPGLIPILNSYLENMEVDVDTRCSILNYLKLIKKRASGELMTVARWMREFIANHPDYKQDSVITDEMNYS 600
gnomAD_SAV:    YV #  IM  T    I V V  V S  Q                     H   TV K   Q       G      R    MT       NNAVNGAI   
Conservation:  1202224021105553685475845868749699696796996689989589968686869977886634563646663664187296498556637866
SS_PSIPRED:               HHHHH   HHHHH         HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH HHHH      HHHHHH
SS_SPIDER3:                    E  HHHHH       H HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH  HHH       HHHHHH
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH H         HHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDD                                                                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDD                                                                                        
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30       
AA:            LILKCNQIANELCECPELLGSAFRKVKYSGSKTDSSN 637
gnomAD_SAV:        YKR     Y     P *V K   * E  A P D
Conservation:  6304863841412189484802145021332321320
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH      HHH                   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH      HHH    E              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH     HHHH HHH              
DO_DISOPRED3:                           DDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                               DDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                       D