P48547  KCNC1_HUMAN

Gene name: KCNC1   Description: Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1

Length: 511    GTS: 4.472e-07   GTS percentile: 0.031     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 6      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 104      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGQGDESERIVINVGGTRHQTYRSTLRTLPGTRLAWLAEPDAHSHFDYDPRADEFFFDRHPGVFAHILNYYRTGKLHCPADVCGPLYEEELAFWGIDETD 100
gnomAD_SAV:        E   P          R  L              G  N  NY    QH                          G T     F              
Conservation:  1111111220222213212110110111111001111110010100101100012223212111100211000210011000112111111120213011
SS_PSIPRED:            EEEEEE   EEEE HHHHH      HH                         HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH   HHH
SS_SPIDER3:            EEEEE   EEEEEEHHHH H                   E     EEEE    HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH   HHH
SS_PSSPRED:            EEEEEE  EEEEE HHHHHH                           EE    HHHHHHHHHHHH  EE      HHHHHHHHHHH   HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDD                                                                                              
DO_IUPRED2A:   D      D DD                                                                                         
MODRES_P:                                                 S                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VEPCCWMTYRQHRDAEEALDSFGGAPLDNSADDADADGPGDSGDGEDELEMTKRLALSDSPDGRPGGFWRRWQPRIWALFEDPYSSRYARYVAFASLFFI 200
gnomAD_SAV:                       N          ##   T   DYL  R    A          L#  L  C HP   C         A         T  L  
Conservation:  0111101000100101011000111111011111111111111111111100101000001101111011111101011101000000002494255575
STMI:                                                                                                    MMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             
DO_SPOTD:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    
DO_IUPRED2A:                         D     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                           
MODRES_P:                                   S           S               S S                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LVSITTFCLETHERFNPIVNKTEIENVRNGTQVRYYREAETEAFLTYIEGVCVVWFTFEFLMRVIFCPNKVEFIKNSLNIIDFVAILPFYLEVGLSGLSS 300
PathogenicSAV:                               A                                                                     
BenignSAV:                              I L                                                                        
gnomAD_SAV:     G  I        C   V       I H   # H  Q #K     N V  I          TH V   S       W                  NS   
Conservation:  5458535666767262110314200011404001000424611183288548848855865496246624138336267589558656868534934335
STMI:          MMMMMMMMM                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMM     
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH HHH        EE      EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH H           E      EEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                            DDDDDDDD                                                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                         N        N                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KAAKDVLGFLRVVRFVRILRIFKLTRHFVGLRVLGHTLRASTNEFLLLIIFLALGVLIFATMIYYAERIGAQPNDPSASEHTHFKNIPIGFWWAVVTMTT 400
PathogenicSAV:                    H                                                                                
gnomAD_SAV:         L  V C    M               Q           K        V                    S H T    Q                 
Conservation:  3342446549564344578566443843483556565666544564565756446556979667967645313163222126084676669979456667
STMI:                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                  
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHEEHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                              DDDDDDDD                    
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                                                            T

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGYGDMYPQTWSGMLVGALCALAGVLTIAMPVPVIVNNFGMYYSLAMAKQKLPKKKKKHIPRPPQLGSPNYCKSVVNSPHHSTQSDTCPLAQEEILEINR 500
PathogenicSAV:                     V   M      #                                                                    
BenignSAV:                                                                                        R                
gnomAD_SAV:               F                                            R  VLW L  R  S     I       RN  GL G  A   M  
Conservation:  5666653625238445554856344434455665654554566564463764644454524221222641313200122211111101211111022110
STMI:                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH                                HHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHH                                       HHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                               HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                         DDDDDDD DD      DD    D     DD  D             
MOTIF:         LGYGD                                                                                               
MODRES_P:                                                                               S        T                 

                       10 
AA:            AGRKPLRGMSI 511
gnomAD_SAV:    PV I V  K  
Conservation:  21100011111
SS_PSIPRED:               
SS_SPIDER3:               
SS_PSSPRED:               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:           D