P48668  K2C6C_HUMAN

Gene name: KRT6C   Description: Keratin, type II cytoskeletal 6C

Length: 564    GTS: 2.272e-06   GTS percentile: 0.743     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 378      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGF 100
gnomAD_SAV:    I  #  N KN CN CWA# #D  S S L CP SG V M HPSD      E ERV  R C V A  DC  N  A #    R S D   RD  A     N I
Conservation:  1111111000001000111213201110010001000101101002101011111121121111101111001100010002011113011211110112
SS_PSIPRED:       EEEEEEE        EEEEEE         EEEEEE                      EE      EEEE                           
SS_SPIDER3:         EEEE         EE EEE        EEEEEEE                     EE       EEE                            
SS_PSSPRED:       EEEEEE            EE           EEE                                 EE                            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       D
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD DD DDDD             D                                                                
MODRES_P:                                                                 S                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GFGGGAGIGFGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQE 200
BenignSAV:                                                                                      Q                  
gnomAD_SAV:    S RD TS   A    T     L V   A   TR   K  IK IF I    *M LTNPW WTK HD   NIS N      QGQ# K* D   E  # V   
Conservation:  0011111111112011111001111221101123432623323691542435551431451373565519754863754685577875659389717963
SS_PSIPRED:                                        EEEE HHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                      EEEEE  HH           HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                       EEEEE             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                           DDDDD                             D 
DO_SPOTD:       D     D                                                                                            
DO_IUPRED2A:                                                                 D                                     
REGION:                                                                                                          QE

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA 300
BenignSAV:                               N                                                                         
gnomAD_SAV:    E   IA#E  #L LK# VSK W  P NVLR*QDS YLK   L GMA #VE  H  DM  CK S  #SM  *        S A  R NTG    DT L   
Conservation:  3221111033323671751154113302014402522731123314443515853742442127447514775582353142472332214035329330
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EE     HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EHE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                      D   D                                                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:    D                                                     D                                            
REGION:        QGTKTVRQNLEPLFEQY                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKK 400
gnomAD_SAV:     C#   Y*#PS    I M V V I G  APHN VTKFN#H#K  SRK PS  GF*    HK P I VD Q #N # N    D  IC#FL    DMH   T
Conservation:  5533951533113355477847765707963366266624862552356165512630542354123112231442450562533514255223431232
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH   EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH     EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH    EEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                   D                                                 DDDDD    DD                       
REGION:                 QTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSI                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QCASLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNVSVVQSTISSGYGGA 500
PathogenicSAV:                                                                        K                            
BenignSAV:                                                                                     I                   
gnomAD_SAV:    * VR #  M  ## L D#VF   TSR KR DY#  * RE MDW  N*    T     QG  VT  C*   D A  V  K I    FPA HY V     SV
Conservation:  5211441242445335314447610621344154233724442453569453436329648856933676466162113101132312121101010011
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH       EEEEEEE          
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   HHH        EEEEEEE          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE           
DO_DISOPRED3:                                         DDDDDDD   DDDDD              DDDBBB B              DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                  DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                       DDD                                                                             

                       10        20        30        40        50        60    
AA:            SGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGIGGGFSSSSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH 564
BenignSAV:                   S                                                 
gnomAD_SAV:     R DG SDPD    SA V    V D  NF CS  TR A  C# SS   #MC    C #  RNQP
Conservation:  1110011102111111111101111111010001111211111110000000000100000111
SS_PSIPRED:                                                   EEEEEE           
SS_SPIDER3:                                      E             EEEEE           
SS_PSSPRED:                                                   EEEEEE           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                    DD DDDD   DDDDD