P49589  SYCC_HUMAN

Gene name: CARS1   Description: Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic

Length: 748    GTS: 1.596e-06   GTS percentile: 0.489     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 374      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MADSSGQQGKGRRVQPQWSPPAGTQPCRLHLYNSLTRNKEVFIPQDGKKVTWYCCGPTVYDASHMGHARSYISFDILRRVLKDYFKFDVFYCMNITDIDD 100
gnomAD_SAV:    T   # R# QDQC EL C SSSE   *IFQ   RF   R         Q MC     AI ETT T  T    C  T   L   C E      VS      
Conservation:  1111111113111111110010110000202110110011010200000312223221111123322133343874548442125313432433555434
SS_PSIPRED:                                EEEEE      EEEEE    EEEEEE    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE       H
SS_SPIDER3:                                 EEEE    E EEEEE    EEEEEE    HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE      H
SS_PSSPRED:                                EEEEE               EEEEE              HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE     HH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD D                                                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD                                                                                      
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                
METAL:                                                               C                                             
MOTIF:                                                                 PTVYDASHMGH                                 
MODRES_P:                        S                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KIIKRARQNHLFEQYREKRPEAAQLLEDVQAALKPFSVKLNETTDPDKKQMLERIQHAVQLATEPLEKAVQSRLTGEEVNSCVEVLLEEAKDLLSDWLDS 200
BenignSAV:                                                              S                                         C
gnomAD_SAV:     N RS#W YQRLKR W R LAV   V YI DTV          M HN   V KQ   TLR     VQ  LP I A    II  A W KK  H F    NC
Conservation:  5442431211111111111111111212211221111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH    HHHHHH HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH    HHHHHH  HHHHHHHHHHHH   EEEE        HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH   HHHHHH   HHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLGCDVTDNSIFSKLPKFWEGDFHRDMEALNVLPPDVLTRVSEYVPEIVNFVQKIVDNGYGYVSNGSVYFDTAKFASSEKHSYGKLVPEAVGDQKALQEG 300
BenignSAV:      F                                                        S                                         
gnomAD_SAV:    #F    NESCV    S L  AG R G      FLS    P   C S   D     A KD S   S C     V Y  GK   CE     VI# # V   R
Conservation:  1111111111111111113623652851393524523335544243254155226513436711173756441111030111662521101011031101
SS_PSIPRED:    HH  HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH       EE      HHHHHHHHHHHHH   EEE    EEEEHHHHH                HHHHHHH 
SS_SPIDER3:    H  HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEE     HHHHHHHHHHHHH   EEEE  EEEE HHHHH                 HHHHH  
SS_PSSPRED:    H          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEE      HHHHHHHHHHHHH  EEE   EEEEEHHHH               HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                 DDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                      DDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                    D  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EGDLSISADRLSEKRSPNDFALWKASKPGEPSWPCPWGKGRPGWHIECSAMAGTLLGASMDIHGGGFDLRFPHHDNELAQSEAYFENDCWVRYFLHTGHL 400
PathogenicSAV:                                         H                 L                                        Q
gnomAD_SAV:     S       HP  NC  K  S   #P SR A RL R#E  HL      P T  N    L    R    F   Y  S  S*#   I  N     V  I   
Conservation:  1111111111112622117657761543254251476618777765563424413561147585993783895545626545644231255366594958
SS_PSIPRED:            HHH                                HHHHHHHHHHHHH   EEEE             HHHHHHHHH     HHHEEE   E
SS_SPIDER3:           H H         EEEEE                   HHHHHHHHHHHH      EE   E          HHHHH       EEEEEEE  EE
SS_PSSPRED:                                                HHHHHHHHHHHH    EEE            HHHHHHHHH     EEEEEEEE  E
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_IUPRED2A:         DDD            D                                                                              
METAL:                                                        C                        H   E                       
MODRES_P:          S S                                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TIAGCKMSKSLKNFITIKDALKKHSARQLRLAFLMHSWKDTLDYSSNTMESALQYEKFLNEFFLNVKDILRAPVDITGQFEKWGEEEAELNKNFYDKKTA 500
BenignSAV:                                                                            T                            
gnomAD_SAV:     V  RE         ANE     P VQ  W     DL   I      AVQTV PC RL       M HNF#TSI F   S  CE  A   S      N  
Conservation:  3328175666635443433330213322462334322333332131223014211501222411141111111112152114611122141111102301
SS_PSIPRED:    EE  EE          HHHHHHH  HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EE  EE    HH  HEHHHHHH   HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         H    HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHH HHHHHHHH  HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                   D                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:               K                                                                                           
MOTIF:              KMSKS                                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IHKALCDNVDTRTVMEEMRALVSQCNLYMAARKAVRKRPNQALLENIALYLTHMLKIFGAVEEDSSLGFPVGGPGTSLSLEATVMPYLQVLSEFREGVRK 600
gnomAD_SAV:       D S S   C IT  TQ V  H H CVT W  M  W##R     M#   IR V T AVLKD#    YL R L I  C K   # CVE     *KR # 
Conservation:  4122332233222421322173114422121111120143214323221442135123221021201111011010011412331311113214511551
SS_PSIPRED:    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDD                   
DO_SPOTD:                                                                             DDDDDD                       
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:        K                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IAREQKVPEILQLSDALRDNILPELGVRFEDHEGLPTVVKLVDRNTLLKEREEKRRVEEEKRKKKEEAARRKQEQEAAKLAKMKIPPSEMFLSETDKYSK 700
gnomAD_SAV:    FS*G      MRH  T W D RRQ   W   #K       V  K      KV   LI D       KP Q  #        QKRTSH  T W   N#   
Conservation:  2321111111112100111111110100011111212322111410211441112111111111432333123124211320331111111111123111
SS_PSIPRED:    HHHH   HHHHHH HHHHH  HHHH EEEE      EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH          
SS_SPIDER3:    HHHH   HHHHHHHHHHHHH HHHH  EEEE    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH    H    
SS_PSSPRED:    HHHHH  HHHHHHHHHHHHH      EEEE      EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH           
DO_DISOPRED3:                                                           DDDDDDDDDDDDDDDDD                          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D           DDD DD

                       10        20        30        40        
AA:            FDENGLPTHDMEGKELSKGQAKKLKKLFEAQEKLYKEYLQMAQNGSFQ 748
gnomAD_SAV:    LY S       VS D  R      RQ  # *  F#  C K  ##   R
Conservation:  111111111111311111120111231010102000111111111111
SS_PSIPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:          E E     E  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                        D                   DDDDDD
DO_SPOTD:                                                 DDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD                      D  
MODRES_P:                                                   S