P49590  SYHM_HUMAN

Gene name: HARS2   Description: Histidine--tRNA ligase, mitochondrial

Length: 506    GTS: 2.27e-06   GTS percentile: 0.743     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 9      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 267      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPLLGLLPRRAWASLLSQLLRPPCASCTGAVRCQSQVAEAVLTSQLKAHQEKPNFIIKTPKGTRDLSPQHMVVREKILDLVISCFKRHGAKGMDTPAFEL 100
PathogenicSAV:                                              Q           E                            C             
BenignSAV:                                                       #                                                 
gnomAD_SAV:    I#V RVFLGSVR    R PMGQS  L P#    * R  D #*    NT HGT     N  ES #E   RRV   G     FS    C  SRRKE  V Q 
Conservation:  1111110001001111000100000000001000021122111222110113012225175543422424235333351162135223431023343234
STMI:          TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT                                                                   
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHH       EE           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     E   HHHH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH
DO_DISOPRED3:  BBBDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                      
DO_SPOTD:      DDDDD             DD DDDDDD                                                                         
DO_IUPRED2A:                                                            DDDD                                       
MODRES_P:                                                                        S                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KETLTEKYGEDSGLMYDLKDQGGELLSLRYDLTVPFARYLAMNKVKKMKRYHVGKVWRRESPTIVQGRYREFCQCDFDIAGQFDPMIPDAECLKIMCEIL 200
PathogenicSAV:                                      H                                                             V
gnomAD_SAV:      N    *  Y E #C# RGE  A FP L#  IF  VC   T     V H   AN #L*G   V ECCCSDV  F      H   V    KW   T    
Conservation:  3525133333011545563437442368755676966866654433236586474969773834258656664646595681452636847443432547
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH     EEEEEE     EEEEE   HHHHHHHHHH      EEEEEEEEE                   EEEE        HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH     EEEE       EEEE     HHHHHHHH       EE EE E                E EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH       EEEE      EHHH      HHHHHHHHH     EE  EEEEE              E    EEEE        HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                R               Q   D                      
REGION:                                      DLT                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SGLQLGDFLIKVNDRRIVDGMFAVCGVPESKFRAICSSIDKLDKMAWKDVRHEMVVKKGLAPEVADRIGDYVQCHGGVSLVEQMFQDPRLSQNKQALEGL 300
PathogenicSAV:              G                                                                                      
BenignSAV:                                     H                                                                   
gnomAD_SAV:    C     N F    GWQ      G S IA    C#   CV  PAQIV   G      R V VA AS QT NC R  RV# V KHI H S  CH   #    
Conservation:  2073473714666664543834345756323420344446665713522671655133462343542531642125402443081232143452230276
SS_PSIPRED:    HH     EEEEE  HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH  HHHH  HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH     EEEE    HHHHHHHHH    HHH EHEEEHE       HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHH   HH   HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH     EEEEE   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHE   HHHHHHHHH HHHH  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDLKLLFEYLTLFGIADKISFDLSLARGLDYYTGVIYEAVLLQTPTQAGEEPLNVGSVAAGGRYDGLVGMFDPKGHKVPCVGLSIGVERIFYIVEQRMKT 400
PathogenicSAV:                           Q                                        L                                
gnomAD_SAV:    EEP       N   T G*T   F   W#  C    MCK  PP  AIHSE  L  MD A    #C   LR  GSED RLL  RF   # Q   V  RK   
Conservation:  0443344145035331344146566666646758453642411001011020112445545687637431533323146645376765655234523131
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH      EEEE HHH         EEEEEE             EEEEE                    EEEEEE HHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH      EEEE  H         EEEEEEEE           EE EE        HHHHE     E E EEEE  HHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH     EEEE            EEEEEEE              EEE                     EEEEEE HHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                       D                                               
BINDING:                                 R                                                                         
REGION:                                      YY                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGEKVRTTETQVFVATPQKNFLQERLKLIAELWDSGIKAEMLYKNNPKLLTQLHYCESTGIPLVVIIGEQELKEGVIKIRSVASREEVAIKRENFVAEIQ 500
PathogenicSAV:                                                                                H                    
BenignSAV:                                                                              G     L                    
gnomAD_SAV:    E    Q  D  M    AH   VK W  VTG       Q K     SRR   H QH    #V     VA     G#IVR C   TT    V WD #     
Conservation:  2022534335465844342144124444333882356565423323243435715642246843564943742343545515234352131201220432
SS_PSIPRED:              EEEEE     HHHHHHHHHHHHHH     EEE      HHHHHHHHHHH   EEEEE HHHHH   EEEEE      EEEEHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:              EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE      HHHHHHHHHH    EEEEE HHHHH  EEEEEE     EEEEEHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE     HHHHHHHHHHH   EEEEE HHHHH   EEEEE     HHH  HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                                                 K                                                        

                     
AA:            KRLSES 506
BenignSAV:         D 
gnomAD_SAV:     Q  DF
Conservation:  220000
SS_PSIPRED:    HHHH  
SS_SPIDER3:    HH    
SS_PSSPRED:    HHHHH 
DO_DISOPRED3:       D
DO_SPOTD:          DD
DO_IUPRED2A: