P49642  PRI1_HUMAN

Gene name: PRIM1   Description: DNA primase small subunit

Length: 420    GTS: 1.565e-06   GTS percentile: 0.476     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 125      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            METFDPTELPELLKLYYRRLFPYSQYYRWLNYGGVIKNYFQHREFSFTLKDDIYIRYQSFNNQSDLEKEMQKMNPYKIDIGAVYSHRPNQHNTVKLGAFQ 100
BenignSAV:         A                                                                                               
gnomAD_SAV:    VKA AL                 CHCC     S                E    V  H  D     Q K    S H   #         E  # R AVLL
Conservation:  4103231022223332443324121122441322425455335986543566573764882332566465432393346776444346443434436285
SS_PSIPRED:         HHH HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH             EEEE     EEEEE    HHHHHHHHHHH   EEEEEEEE                
SS_SPIDER3:         H HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH        HHHH EEEEE    EEEEEE    HHHHHHHHHHH   EEEEEEEEE              E
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH      HHH   EEEEE     EEEE     HHHHHHHHHHH    EEEE                 HH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ACT_SITE:                                                 E                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AQEKELVFDIDMTDYDDVRRCCSSADICPKCWTLMTMAIRIIDRALKEDFGFKHRLWVYSGRRGVHCWVCDESVRKLSSAVRSGIVEYLSLVKGGQDVKK 200
gnomAD_SAV:    V G        V EC N     GCV V R   I   TVVC         S C  CV  C     I Y    * F       C V    F  L S   I  
Conservation:  6469777997765869648186423479269625433443654736133643232454565766369647943494662328454479866558713228
SS_PSIPRED:        HHH                HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE    EEEEEE HHHH   HHHHHHHHHHHHHH       E
SS_SPIDER3:    EEEEEHEE E       H     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE   EEEEEE  HHHH   HHHHHHHHHHH  H      EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE    EEEEEE HHHHH  HHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                             CCSSADICPKC                                                                     
ACT_SITE:              D D                                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KVHLSEKIHPFIRKSINIIKKYFEEYALVNQDILENKESWDKILALVPETIHDELQQSFQKSHNSLQRWEHLKKVASRYQNNIKNDKYGPWLEWEIMLQY 300
gnomAD_SAV:    E   N     SMG       R        S                       K E N    DS   C   W         SVR            VP  
Conservation:  5727123489462264034214711546136554223222346524365224207200522032712681052102010102023120012131867665
SS_PSIPRED:    EEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    E         HHHHH HHHHHH HHHHHHH      HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CFPRLDINVSKGINHLLKSPFSVHPKTGRISVPIDLQKVDQFDPFTVPTISFICRELDAISTNEEEKEENEAESDVKHRTRDYKKTSLAPYVKVFEHFLE 400
gnomAD_SAV:       Q   S     S         L E           I NR     L  VN   C#     A KKK *G  V A I   A G    # V F  A   #F 
Conservation:  5795863665553598986675686568675764432154074742764341592994121002121100212021235273334639435541641763
SS_PSIPRED:    H           HHHHH           EEEEEE HHHHHH        HHHHHHHHHHH   HHHHHH                  HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H           HHHHHE   EE     EEEEE  HHHH          HHHHHHHHHH     HHHHHHHH                HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H           HHHHHH           EEEE  HHH          HHHHHHHHHHHH                           HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                DDDDDDDDDDDDDDDD                      
DO_SPOTD:                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                
DO_IUPRED2A:                                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDD                    

                       10        20
AA:            NLDKSRKGELLKKSDLQKDF 420
gnomAD_SAV:    K    *    R         
Conservation:  14313244223213311212
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHH HHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:          DDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:            DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: