P49643  PRI2_HUMAN

Gene name: PRIM2   Description: DNA primase large subunit

Length: 509    GTS: 7.028e-07   GTS percentile: 0.105     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 87      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEFSGRKWRKLRLAGDQRNASYPHCLQFYLQPPSENISLIEFENLAIDRVKLLKSVENLGVSYVKGTEQYQSKLESELRKLKFSYRENLEDEYEPRRRDH 100
gnomAD_SAV:    V    K   M S  D * S  CT  F      T   L#   L    M  I   R L S R R   R  K*   V   PQ  RC      D ##       
Conservation:  5341222221021001020113222323311221221331332434334334531541255242612306105510432142332321113416278578
SS_PSIPRED:                                        EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHH
SS_SPIDER3:               EE           EEEEE       EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             EE              EEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ISHFILRLAYCQSEELRRWFIQQEMDLLRFRFSILPKDKIQDFLKDSQLQFEAISDEEKTLREQEIVASSPSLSGLKLGFESIYKIPFADALDLFRGRKV 200
BenignSAV:                                                                                     K                   
gnomAD_SAV:    V     Q     Y G  #  F   V   * #  V   GR RVV T            K I *   MLVLT   N        V  #SS NT    Q   F
Conservation:  4588888999887669577858774585544730501011216411135133231122700100361165112201021001577526357457472667
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH     EE  HHHHHHHHHHHHHH           EEEEE  HHHHHHHHH   E
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH             EEEEEHHHHHHHH   EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH            EEEE  HHHHHHHH   EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YLEDGFAYVPLKDIVAIILNEFRAKLSKALALTARSLPAVQSDERLQPLLNHLSHSYTGQDYSTQGNVGKISLDQIDLLSTKSFPPCMRQLHKALRENHH 300
BenignSAV:        G                                                      S     L                     Y             
gnomAD_SAV:          T I  #     M      R  #                                                                        
Conservation:  5410534235223322454424522566464422336614343442333334343543443421433285446436524523555574445633735355
SS_PSIPRED:    EE   EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH             EEEHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    EEE  EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH                  HHHHHHH      HHHHHHHHHH H   
SS_PSSPRED:    EEE  EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                    D  
METAL:                                                                                               C             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRHGGRMQYGLFLKGIGLTLEQALQFWKQEFIKGKMDPDKFDKGYSYNIRHSFGKEGKRTDYTPFSCLKIILSNPPSQGDYHGCPFRHSDPELLKQKLQS 400
Conservation:  4556756765564663675863543587256338336343635354534565667795634555587566745636436838968768353676655543
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH     HHHHH  EEEEEEEE        EE      HHHH                  HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH     HHHHH  EEEEEEEE         E  H HHHEE                   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH            EEEEEEEE              HHEHHH                  HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                    DDD                
METAL:                                                                           C                C                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YKISPGGISQILDLVKGTHYQVACQKYFEMIHNVDDCGFSLNHPNQFFCESQRILNGGKDIKKEPIQPETPQPKPSVQKTKDASSALASLNSSLEMDMEG 500
BenignSAV:                                                  H                  S                                   
Conservation:  4444426316343444524324644456242413352274637644451677336353351555110221230221001101222222122101112244
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH                            HHHHH    HHH HHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHH                            H HH           H 
SS_PSSPRED:    H   HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHH                             HHH     HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D    D          
METAL:                                C                                                                            
MODRES_P:                                                                           T                              

                       1
AA:            LEDYFSEDS 509
Conservation:  841251122
SS_PSIPRED:    HHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D   D