P50416  CPT1A_HUMAN

Gene name: CPT1A   Description: Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform

Length: 773    GTS: 1.631e-06   GTS percentile: 0.506     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 20      BenignSAV: 10      gnomAD_SAV: 383      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAEAHQAVAFQFTVTPDGIDLRLSHEALRQIYLSGLHSWKKKFIRFKNGIITGVYPASPSSWLIVVVGVMTTMYAKIDPSLGIIAKINRTLETANCMSSQ 100
PathogenicSAV:                                                        L                                            
gnomAD_SAV:         E         L RT  Q  R   K VS  RR  S#   VIL #SLF# M L GL G  TM  VMV M *T  N L  V  R SQ   MVDRTTR 
Conservation:  5444334333122223241212231133233333331342323132422332342744424323422332230301253426340142103201111201
STMI:                                                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                           
SS_PSIPRED:           EEEE EE    EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH        HH
SS_SPIDER3:           E EEEEEE  EEEEE  HHHHHHHHH   HHHHH HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH       HH
SS_PSSPRED:     HHHHHHEEEEEEE    EEEE  HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH     H HHHHHHHHH       HH
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TKNVVSGVLFGTGLWVALIVTMRYSLKVLLSYHGWMFTEHGKMSRATKIWMGMVKIFSGRKPMLYSFQTSLPRLPVPAVKDTVNRYLQSVRPLMKEEDFK 200
PathogenicSAV:                       C                                                                             
BenignSAV:     M                                                                       H                           
gnomAD_SAV:    M KM N MP   S      I  CHF   P    #*   DY  V L I TC VVI V   Q  V      L  H Q S I      C    # FT *  LE
Conservation:  0212342244442462233222612861674464842115412400452620233333312624433423352344713124304552542353111240
STMI:            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH        HHHHHHHHHHHHH       HH            HHHHHHHHHHH      HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H H       H HHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHH      HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHH     HHHHH
DO_DISOPRED3:                                           D DDD  D                    DDDDDDDD                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RMTALAQDFAVGLGPRLQWYLKLKSWWATNYVSDWWEEYIYLRGRGPLMVNSNYYAMDLLYILPTHIQAARAGNAIHAILLYRRKLDREEIKPIRLLGST 300
BenignSAV:                                                                               T         Q  Q            
gnomAD_SAV:    W  EF E#  AV    F    *   C  I     R       QR*EL  L  S  VV        ## P   S V P V    SQ  WK N  #H  R#M
Conservation:  1210540262002522663481575443287555664344453582653457556247442205411534646423452435531614333161121000
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH        EE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH      EEEE    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EHE    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH       EE              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IPLCSAQWERMFNTSRIPGEETDTIQHMRDSKHIVVYHRGRYFKVWLYHDGRLLKPREMEQQMQRILDNTSEPQPGEARLAALTAGDRVPWARCRQAYFG 400
PathogenicSAV:    W         I G                          V             W  G                                        
BenignSAV:                         K                              Q                                                
gnomAD_SAV:         V   Q#   P     K  S *   G T #IM  * H VR #F RG QP   QK#K    K  G  L   SE  G VV  TAN I    YH    A
Conservation:  3424314122354435341111304141022234332315334241240122360633450643166231312122511314445417129422901341
SS_PSIPRED:        HHHHHHHH           EEEE     EEEEEE  EEEEEEEEE  EEE HHHHHHHHHHHHH            EEEE    HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      E HHHHHH             EEE      EEEEEE  EEEEEEEEE  EE  HHHHHHHHHHHHH          EEEEEE     HHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:        HHHHHHHH           EEE      EEEEEE  EEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHH           EEE      HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                        DDD                                      DDDDDDDDDD D  DDDD                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RGKNKQSLDAVEKAAFFVTLDETEEGYRSEDPDTSMDSYAKSLLHGRCYDRWFDKSFTFVVFKNGKMGLNAEHSWADAPIVAHLWEYVMSIDSLQLGYAE 500
PathogenicSAV:              V                                       GT         #             L    P             C  
gnomAD_SAV:    H I     N     V  MM            L       #  V  SQ  N   YT*CM  G R V L F #       L M      IVFTH     CT 
Conservation:  1816215832643554333541211220112110353044535535152456443233231424511624154445537422343413432603153711
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHH  EEEEE               HHHHHHHHH             EEEEE   EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHH  EEEEEE              HHHHHHHH             EEEEEEE  EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHEEEE               HHHHHHHH              EEEEE    EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                             DDDDDDD                                                                   
ACT_SITE:                                                                              H                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DGHCKGDINPNIPYPTRLQWDIPGECQEVIETSLNTANLLANDVDFHSFPFVAFGKGIIKKCRTSPDAFVQLALQLAHYKDMGKFCLTYEASMTRLFREG 600
BenignSAV:              L                                                                                          
gnomAD_SAV:    N     NFSL #L*      E L#*    T I         D  H R    IT   R    SCMN  SIL   F RSQC  T     IC   V Q L*QA
Conservation:  2666171121052071550724313311140044016106614453223160087621352132535465744687735433206587555456545456
SS_PSIPRED:                   EE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEE     HHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHH  
SS_SPIDER3:                   EE EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE   H HHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE      HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                                               Y           
REGION:                                                              GKGIIKKCRTSPD                                 
MODRES_P:                                                                                             T            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RTETVRSCTTESCDFVRAMVDPAQTVEQRLKLFKLASEKHQHMYRLAMTGSGIDRHLFCLYVVSKYLAVESPFLKEVLSEPWRLSTSQTPQQQVELFDLE 700
PathogenicSAV:                                                                                       R             
BenignSAV:                                         F                                                               
gnomAD_SAV:     M  MH G I T NLAWS  EL  MA  S      VF    NV L T I   T HD S F MM    T   LL     F   S  A    *   #     
Conservation:  3655634441452145133111001011320553173238714452533718478655474435444221656724524335144454341331153321
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH              EEEE       EEEEE   
SS_SPIDER3:      E EE   HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH     H HHHH    EEEEE      EEEEE   
SS_PSSPRED:       EE    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH       HHH    EEEE        HHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                               DDD     
BINDING:        T                                                                                                  
MODRES_P:         T                                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70   
AA:            NNPEYVSSGGGFGPVADDGYGVSYILVGENLINFHISSKFSCPETDSHRFGRHLKEAMTDIITLFGLSSNSKK 773
PathogenicSAV:         EE        D                                                      
BenignSAV:                             V                                                
gnomAD_SAV:      L  MPTRE#    VN SC    V  EQS  S  V  N  *  M  LH  #QV   V G     #F CS   
Conservation:  1361243277855742438344341224311324554331521142301330130143032014300001010
SS_PSIPRED:             EEEE       EEEEEEE   EEEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:             EEE E      EEEEEE    EEEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:              EEE       EEEEE     EEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                       DDDD
DO_SPOTD:                                                                          DDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                            
MODRES_P:                                              S     S