P51160  PDE6C_HUMAN

Gene name: PDE6C   Description: Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha'

Length: 858    GTS: 1.546e-06   GTS percentile: 0.469     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 17      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 395      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGEINQVAVEKYLEENPQFAKEYFDRKLRVEVLGEIFKNSQVPVQSSMSFSELTQVEESALCLELLWTVQEEGGTPEQGVHRALQRLAHLLQADRCSMFL 100
PathogenicSAV:                             W                                                      P                
BenignSAV:                                                                        I                                
gnomAD_SAV:          A MGN*   H RL E       Q    EK    N M F  II     IR      Y  V RIM * #V# Q  I# T   Q Y # VEC#   P
Conservation:  8223212252167216306510761123122111012120000011000211311137303225440033212012611342263343034055437472
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHH HHHHHHHH     HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHH HHHHHHH      HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHH HHHHHHHH     HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                                  
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                DDD                    
BINDING:                                                                                                       S   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CRSRNGIPEVASRLLDVTPTSKFEDNLVGPDKEVVFPLDIGIVGWAAHTKKTHNVPDVKKNSHFSDFMDKQTGYVTKNLLATPIVVGKEVLAVIMAVNKV 200
PathogenicSAV:    W                                                           L                                  E 
BenignSAV:                                                             E                                           
gnomAD_SAV:     G WHSTS    #  Y NL#  LD S  # A G   QSGT TAA T  M  I KDSE  NDTY   LTEQ SR       V L MLS   V#  IG  TI
Conservation:  1927773585561674711240341546052174648373855724512651166154042128524481253417244641844045734683444781
SS_PSIPRED:    EE     EEEEEEEE                  EEEE    HHHHHH    EEE           HHHHH    EEEEEEEEEEE   EEEEEEEEEE  
SS_SPIDER3:    EE     EEEEEEEE                 EEE E    HEHHHEHH   EE           HHHHH H     EEEEEEEEE  EEEEEEEEE   
SS_PSSPRED:    E      HHHEHHHH                 EEEEE     HHHHH    EE            HHHHHHH  HHHEEEEE      EEEEEEEHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                          D                                            
NP_BIND:                                                                           DKQT                            
BINDING:                      D                                                           T                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NASEFSKQDEEVFSKYLNFVSIILRLHHTSYMYNIESRRSQILMWSANKVFEELTDVERQFHKALYTVRSYLNCERYSIGLLDMTKEKEFYDEWPIKLGE 300
PathogenicSAV:           D                                                                   T                     
BenignSAV:                                                                          T                              
gnomAD_SAV:                  R  KC       Y   C# D   *SG   VGP S  L  PIVI *    VV M  L   # Q FT    T       NG  #N   
Conservation:  2320741074134057314334133135225734483774856345679568668956888885596681562466555588855636565528433566
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE       HH        
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE     EEEEE E     
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE     HHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VEPYKGPKTPDGREVNFYKIIDYILHGKEEIKVIPTPPADHWTLISGLPTYVAENGFICNMMNAPADEYFTFQKGPVDETGWVIKNVLSLPIVNKKEDIV 400
PathogenicSAV:                       N                                                                   L         
gnomAD_SAV:     G#SE#      WDIT  T     SR  A V   LM #        V      K *      S# EV   ILR  S# KI C V   S  HVI Q     
Conservation:  2545166368686751766446535343845464439416993825568355554537764453225526179234482486253578658665535455
SS_PSIPRED:                 EEEEEEEEEEHH     EE     HHHHHHHH     HH     EEE                      EEEEEEEEEEE     EE
SS_SPIDER3:           E     EEEEEEEEEEEE    EEE     HHHHHHHH  HHHHHHHH    E           H    E     EEEEEEEEEEE     EE
SS_PSSPRED:                  E EHHHHHHHH             HHH HHHH   HHEHHH  EE                       EEEEEEEE        EE
DO_DISOPRED3:   DD     D                                                                                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GVATFYNRKDGKPFDEHDEYITETLTQFLGWSLLNTDTYDKMNKLENRKDIAQEMLMNQTKATPEEIKSILKFQEKLNVDVIDDCEEKQLVAILKEDLPD 500
PathogenicSAV:                 R                                     V                                             
gnomAD_SAV:            R  Q  N R   VA S    I # H SSGA NE Y  *D RGV EDI VSKI   L     V   RGT K     NR DN P T        
Conservation:  6655656937567754255153646766899736647557446444337464354544434731254216933331321223047442450057011571
SS_PSIPRED:    EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                       DD             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                   D                                      D                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PRSAELYEFRFSDFPLTEHGLIKCGIRLFFEINVVEKFKVPVEVLTRWMYTVRKGYRAVTYHNWRHGFNVGQTMFTLLMTGRLKKYYTDLEAFAMLAAAF 600
PathogenicSAV:                              S R     S                                                              
gnomAD_SAV:    SH E M*K H    ##  RR L Y #*    MK A     S    I LK I   W Q I   S Q   #M     N PI E   N  I  KG  T V   
Conservation:  2011473283858311551286348634755545727746735595654464366592644558455555655544673761542544576346555676
SS_PSIPRED:        EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHH   HHH    HHHHHHHHHHHH           HH HHHHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     E       EE      HHHHHHHHHHHHHH     EE   HHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHH    HH   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:            EEE        HHHHHHHHHHHHHH EEEEE  HHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                                                          H                                  
ACT_SITE:                                                                   H                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CHDIDHRGTNNLYQMKSTSPLARLHGSSILERHHLEYSKTLLQDESLNIFQNLNKRQFETVIHLFEVAIIATDLALYFKKRTMFQKIVDACEQMQTEEEA 700
PathogenicSAV:  L                                              T                                                   
BenignSAV:                                                                                                       A 
gnomAD_SAV:     R     S SS H    A       D  V KK  P C  I  K #      KP  Q  AR V  LK TM   Y       S T   M  VY  V MQ A 
Conservation:  6886886964795736823567566656458868843653662451578434544281414345355496778979567684575767633204230132
SS_PSIPRED:    H          HHHHH   HHHHH    HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH   HHHH
SS_SPIDER3:               HHHH    HHHH     HHHH HHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH
SS_PSSPRED:    H             HHH  HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:          HD                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IKYVTVDPTKKEIIMAMMMTACDLSAITKPWEVQSQVALMVANEFWEQGDLERTVLQQQPIPMMDRNKRDELPKLQVGFIDFVCTFVYKEFSRFHKEITP 800
PathogenicSAV:                                                                                          K          
gnomAD_SAV:             N D N   # M Y    V NL       V TA    S         W  E V    KK G K   R  A TY    SA     W  R    
Conservation:  4154315366887669779857756644797565446433583869468696324634288548691423698869799959995766674545604438
SS_PSIPRED:    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH
SS_SPIDER3:    HHH    HHHHHHHHHHHHHH  HH     HHHHHHHHHHHHHHH H   HHHHHH            H   HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH
SS_PSSPRED:    HHH     HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                           DDDDDDDD DDD                                
METAL:                               D                                                                             

                       10        20        30        40        50        
AA:            MLSGLQNNRVEWKSLADEYDAKMKVIEEEAKKQEGGAEKAAEDSGGGDDKKSKTCLML 858
BenignSAV:                          N           G                        
gnomAD_SAV:      #   SDK ##      HVGN# ITD K    GR  KEPTK AV   N    I  T 
Conservation:  5235412841483144324433121122111112110000222222220111022012
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HH                  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH                   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                         
DO_DISOPRED3:                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                            DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD      
PROPEP:                                                               LML
LIPID:                                                               C