P51570  GALK1_HUMAN

Gene name: GALK1   Description: Galactokinase

Length: 392    GTS: 2.797e-06   GTS percentile: 0.870     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 15      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 223      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAALRQPQVAELLAEARRAFREEFGAEPELAVSAPGRVNLIGEHTDYNQGLVLPMALELMTVLVGSPRKDGLVSLLTTSEGADEPQRLQFPLPTAQRSLE 100
PathogenicSAV: L                          T   M   R       Y                       C                                
gnomAD_SAV:             VV    SG D Q   E  T#  A VLS  T  RG MNDSR      S   T   M   H      F I     GQH*W HLA S # SLP 
Conservation:  1220100120112012110201011101011111222122121221221232121554625434832204304542635115644315271451000370
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE                   EEEEE EEEEEEEEE     EEEEE        EEEEEE         
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE    EEEE   E     EE EEE EE EEEEEEE     EEEEEE       EEEEEE         
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE     EE                    EEEEEEE    EEEEEE         EEEE          
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDD                                                                                              
DO_IUPRED2A:                                                                            DDDDDD    D DDDDDDDDDD     
REGION:                                                  EHTD                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PGTPRWANYVKGVIQYYPAAPLPGFSAVVVSSVPLGGGLSSSASLEVATYTFLQQLCPDSGTIAARAQVCQQAEHSFAGMPCGIMDQFISLMGQKGHALL 200
PathogenicSAV:                                     D                                                            V  
BenignSAV:                                                                                        M                
gnomAD_SAV:    T  LW   C E M PC  G #F D N MM T M     P  LTY  ATM        L#L A   H R **# AQ  TE L  M       L RR# V  
Conservation:  5617165464576334736245467376435468686989686788463648778754933112345239948864562688889984644464444888
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH     EEE
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH     EEEE
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHH      EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH     EEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                        PLGGGLSSSAS                                                        
REGION:                                                                                          GIMD              
ACT_SITE:                                                                                           D              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IDCRSLETSLVPLSDPKLAVLITNSNVRHSLASSEYPVRRRQCEEVARALGKESLREVQLEELEAARDLVSKEGFRRARHVVGEIRRTAQAAAALRRGDY 300
PathogenicSAV:                                       Q                W                               M            
BenignSAV:                                                                              D           Q              
gnomAD_SAV:      # CWD R LR L LR TMF  D   H F    K*  QWCK KDGTWV      WK    GPV     M E D WQ Q M  DMPHMV TV T  #V C
Conservation:  6898665414566155263587669654839346674265238426712754158854221263332113223123653585344287235623621334
SS_PSIPRED:    EE     EEEE      EEEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H
SS_SPIDER3:    EE    EEEEEE     EEEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H
SS_PSSPRED:    E      EEE       EEEEEE             HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH  HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                          Y                                                                
MODRES_P:                                   S                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90  
AA:            RAFGRLMVESHRSLRDDYEVSCPELDQLVEAALAVPGVYGSRMTGGGFGGCTVTLLEASAAPHAMRHIQEHYGGTATFYLSQAADGAKVLCL 392
PathogenicSAV:                                            M S  S                                  P        
BenignSAV:                #                         A                                                      
gnomAD_SAV:    *V  C   DG HL   N        EP             GCVMVSC S  MMA     SV QT W V K  SR TN  PC*VPE TR  YS
Conservation:  11452242254158854646781655277224544374565555555465454454241231142133233314124322413324211301
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH     EE          EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE      EE   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH H    HHHHHHHHHH      EEE E E     EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE     EE   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH    EEE           EEE HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE     EEE  
DO_DISOPRED3:                                                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                  
DO_IUPRED2A: