P51793  CLCN4_HUMAN

Gene name: CLCN4   Description: H(+)/Cl(-) exchange transporter 4

Length: 760    GTS: 6.363e-07   GTS percentile: 0.082     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 17      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 113      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDFHTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEFIKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDLAVDWMTDLKE 100
PathogenicSAV: V                                                                            S                      
gnomAD_SAV:    I SS V       IV F  L    R               #        I   Q                                I        M    
Conservation:  3322211532246574747427444597775777547777777597555214477913422457475795545473574357264426533544426345
STMI:                                                                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                            EE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                 HHH                 HHHHH HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:                                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDBD                                                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GVCLSAFWYSHEQCCWTSNETTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYILNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLG 200
gnomAD_SAV:     F                                  K               N      V           CA S    D  L                 
Conservation:  4473024434336735171216412432532733342522301373539546624551669174447927745477555545974752355577595999
STMI:          MMMMM                                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        IIIIIIII         M
SS_PSIPRED:     HHHHHHHH HHH                     HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHEE          
SS_SPIDER3:       HHHHHH   H                HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH       EEEEEE  EEE   H 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHEEE  EE      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                                        GSGIP                
BINDING:                                                                                       S                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KWTLLIKTVTLVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSSLFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALV 300
PathogenicSAV:            G        #                                              LD     M                         
gnomAD_SAV:            A    L   S                     GI           W                                           T   
Conservation:  5674577455779773374349737557977575753552555777599795775543433347977977797977779459999999799997799999
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           IIIIIIIIIIIII   IIIIIIIII           MMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHH      EEEEEHHHH     HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH      HH  HHHHHHHHHHHHH H   HH  HHH HHHH H HH  EE         EEEEHEH      HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   EEEE     EEEEEEEHHH    HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                              GKEGP                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMAELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRRKTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYTRQSTSELISE 400
gnomAD_SAV:       M                         #             W   #  C   T    H             T   TV    V S    SR S      
Conservation:  9995977999999799979999779999455427435495795579559754965777395251595595799516545763265977777157757747
STMI:          MMMMMMMMM                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH       EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH        EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH             HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH       EEEEEEEE    EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH     EEEHHHHHHHHHHHH           HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFNDCGALESSQLCDYINDPNMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALIFKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRMVGIGVEQLAYHHHDWIIF 500
PathogenicSAV:                                                                   S                     K           
BenignSAV:                                                           I                                             
gnomAD_SAV:             P       S       AE    W  S S  MTL       N  V I                  S  T T     V MQ   C        
Conservation:  9977764743626727241272521213133233307771746692776276534779777574757777775557545797575479757749799559
STMI:                                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:    HH          HHH                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH
SS_SPIDER3:    H             H                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHEE
SS_PSSPRED:    HHH        HHHH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                           GLFIP                             
BINDING:                                                                           F                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RNWCRPGADCVTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEGIYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVM 600
PathogenicSAV:                                  L M       RD                                                       
gnomAD_SAV:       R     R                                                                                          
Conservation:  4399479779799999999999777977977444774747597577955957745345979779995545777577399779599355995949573599
STMI:                       IIIIIIIIIIIIIII   IIIIIIIIIIIIIIIIMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                  
SS_PSIPRED:                  HHHHHHHHHHH HHHHEEEEEEEEEHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH                 HHHH 
SS_SPIDER3:    E         E HHHHHHHHHHH    EEEEEEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH                EHHHH 
SS_PSSPRED:                  HHHHHHHHHHH   EEEEEEEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH               HHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                   DD  
BINDING:                                                                              Y                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETDYNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHPLKLRRILNLS 700
PathogenicSAV:                                                                                    L                
BenignSAV:           S                                                                     M                       
gnomAD_SAV:    # #W  S  L    H        M   Q        L        T        VV  N   H  D       VH M  S   L  CTYS   Q#     
Conservation:  7942232595575742477373713723955999995575597995975597555455226442437432273337575252334214223433345445
SS_PSIPRED:            EEEE    EEHHHHHHHHHH      EEEEE    EEEEEEEHHHHHHHHHHHHH         EEE                  HHH    
SS_SPIDER3:            EEEE     EHHHHHHHHH        EEEE    EEEEEEEHHHHHHHHHHHHH         EEE                E HHHEE  
SS_PSSPRED:            EEEE      HHHHHHHHHH       EEE      EEHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          HHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                 DDD                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D    DDD DDDDD                                                                DDDD DDDDDD           
NP_BIND:                                     YNG                                                                   
BINDING:                S                                                                                          

                       10        20        30        40        50        60
AA:            PFTVTDHTPMETVVDIFRKLGLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMANQDPESIMFN 760
PathogenicSAV:                  W            R                             
gnomAD_SAV:    S       L        Q                                    D     
Conservation:  475545574775797577597577977744714775575754755442121324355225
SS_PSIPRED:      EE     HHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH HHHH   
SS_SPIDER3:      E      HHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEEEEHHHHHHHHHHHHH   H     
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHH   EEEEE   EEEEEEEHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                      DDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                        DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                  D     D   D  
NP_BIND:                                            TKKD