P51795  CLCN5_HUMAN

Gene name: CLCN5   Description: H(+)/Cl(-) exchange transporter 5

Length: 746    GTS: 1.835e-06   GTS percentile: 0.593     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 38      BenignSAV: 9      gnomAD_SAV: 182      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDRDRHREITNKSKESTWALIHSVSDAFSGWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGICTGGFWFNHEH 100
PathogenicSAV:                                                         V                                           
gnomAD_SAV:     A     V                   Q Q       SR Q         M     S    F T F          L  R                 RV 
Conservation:  5967655667697767779777976996777667773355549325752554759976656754693696797499745697696969594055965695
STMI:                                                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        
SS_PSIPRED:                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HH HHH
SS_SPIDER3:                      E  HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   E    HH  EE
SS_PSSPRED:                        HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        EE HHH
DO_DISOPRED3:  BBB                                                                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDD                                                                                              
DO_IUPRED2A:                                   DDD                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CCWNSEHVTFEERDKCPEWNSWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLVIKTITLVL 200
PathogenicSAV:                                                                               D                    R
BenignSAV:                   R                          I                                                          
gnomAD_SAV:         KP I   # R         RT RR       #    I I    P V  DIF #   V                     S   E    V  V    
Conservation:  9972613237236539549359677325012542364356457527762966979379749979797979679997999999999999999569969999
STMI:                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        IIIIIIII        MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    H                    HHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              EEE     HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEE                E HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEH  E               EEEE    HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH                   HHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HEE  EE         EEE  EEE     HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                           GSGIP                             
BINDING:                                                                          S                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNILCHCFNKYRKNEAKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGN 300
PathogenicSAV:   L        A      R R   P                  L               V      A  # CL    F P                    
BenignSAV:                                           C                                                             
gnomAD_SAV:      L   N    S  L M S        G  R  N    C             LG    V         I          H      A     C # AS  
Conservation:  9999999999999979979997977994749775797977776566465665759777799999999999999999979999999999797997999997
STMI:          MMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           IIIIIIIIIIIII   IIIIIIIII           MMMMMMMMMMMMMMMMMMM    
SS_PSIPRED:    HHH          HHHHHHHHHHHHHHH  HH   HHHHHHHHHHHHH   HHH       EEEEEEHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHH    H HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH    HHH     EEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH  EEEE      EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  D D  D D                                                                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                 GKEGP                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SRLVLFYVEFHTPWHLFELVPFILLGIFGGLWGALFIRTNIAWCRKRKTTQLGKYPVIEVLVVTAITAILAFPNEYTRMSTSELISELFNDCGLLDSSKL 400
PathogenicSAV:                                        K                                                       H    
BenignSAV:                                          H      #                                                       
gnomAD_SAV:     C    F D Y  *     M  V    I         H      L   A     C  #  VIM          S   #   G             A    
Conservation:  9699999999949976499499649979997995599559759963975727957763974367539755779737964967479999999965795979
STMI:                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            
SS_PSIPRED:      EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHH   HHH    HHHHHHHH       HHHH
SS_SPIDER3:      EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH    HHHH   HHHHHHHH           
SS_PSSPRED:      EEEEEEEE    EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH    EEEHHHHHHHHHHHH  HHHH    HHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CDYENRFNTSKGGELPDRPAGVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRLLGVGMEQLAYYHQEWTVFNSWCSQGADCITPG 500
PathogenicSAV:                                                              D   V  P                               
gnomAD_SAV:        DCL    A    V L  MEAC      P          V                            RT H      K  FL   R E        
Conservation:  9491310313234274595750363293967496746933397599979677979799576779477766445676633553205525764443455676
STMI:                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                           I
SS_PSIPRED:                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH           
SS_SPIDER3:                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          E HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH         E HH
SS_PSSPRED:                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                             GLFIP                                           
BINDING:                                                             F                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPFLEAKEEFAHKTLAMDVMKPRRNDPLLTVLTQ 600
PathogenicSAV:      E     R#  W   P   K  D I               N##                                                     
BenignSAV:                                        M           M                                                    
gnomAD_SAV:            V                          M   T       M  V  Q     D VH    A        #R     A   TWK   F      
Conservation:  6445466546599699997979999999999999999997949999777995797799799979999999949996255677597957653743743567
STMI:          IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH   EEEEEEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH         HHH     HHHH         EEEEE 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH     EEEEEEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH       HHHH     HHHH        EEEEEE 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH   EEEEEEEEEEEEE     EHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH        HHH    HHHHH         EEEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                Y                                     T    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQRLVGFVLRRDLIISIENARKKQDGVVSTSIIYFTEHSPPLPPYTPPTLKLRNILDLSPFTVTDLTPMEIVV 700
PathogenicSAV:                                    F                                                                
gnomAD_SAV:    GG    E  S V         #   Q    PM  F    PV  V   Q    A   S  V  MAY     S    I   #   N G        A   I 
Conservation:  5463645572462393799795555239699797567997479576674497979649172967417225213751749636599797779759675756
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHH       EEEE    EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH       EEEE                 HHHH             HHHHH
SS_SPIDER3:       EHHHHHHHHH        EEEE    EEEEEEEHHHHHHHHHHH           EEE                  HHHE    E       HHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHH      EEEE     EEEEE  HHHHHHHHHHHHH        EEEEE                HHHH      E      HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                          D     DD                                    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                       YSG                                                                                 

                       10        20        30        40      
AA:            DIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDVLKHIAQMANQDPDSILFN 746
gnomAD_SAV:       Q    Q        Q R  V   V    V   V  G  F  Y 
Conservation:  9999999979676556657777677776777577569579497554
SS_PSIPRED:    HHHHH    EEEEEE  EEEEEEEHHHHHHHHHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHH    EEEEEE  EEEEEEEHHHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:    HHHHHH   EEEEEE  EEEEEEEHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                       DDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                          DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                 
NP_BIND:                              TKKD