P51800  CLCKA_HUMAN

Gene name: CLCNKA   Description: Chloride channel protein ClC-Ka

Length: 687    GTS: 2.398e-06   GTS percentile: 0.780     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 15      gnomAD_SAV: 423      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEELVGLREGFSGDPVTLQELWGPCPHIRRAIQGGLEWLKQKVFRLGEDWYFLMTLGVLMALVSYAMNFAIGCVVRAHQWLYREIGDSHLLRYLSWTVYP 100
PathogenicSAV:                                                                                C                    
BenignSAV:            H                                    H                     I               G                 
gnomAD_SAV:      A L  H  S  #  S *   S Y L C*# # S QG NK M CRV      I  RLF#    CTVD G R AIQV  G  G T  IQ FQ   CI   
Conservation:  5322120112112112220114252411410212140133015223232843412593246346423522413312551665014232048575794488
STMI:                                                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            
SS_PSIPRED:     HHHHHH          HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHH H         HHHHH   HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE    HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH      EEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BBBBDDDDDDD                                                                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD                                                                                      
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VALVSFSSGFSQSITPSSGGSGIPELKTMLAGVILEDYLDIKNFGAKVVGLSCTLATGSTLFLGKVGPFVHLSVMIAAYLGRVRTTTIGEPENKSKQNEM 200
BenignSAV:        I                                                                                                
gnomAD_SAV:       I    DS    M    V   L   IL E MV  E  GV  S    L      V S N     M SS#R  LKMTV*  G     FR AGSNTEP KV
Conservation:  4352335633344433243778454453442732532764324434733843636447443866868756854253535643422121412342121035
STMI:                                                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH             EE            HHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH                EEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH  HE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH                HHHHHHH  E      HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                 DD       
DO_IUPRED2A:                                                                                            DD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LVAAAAVGVATVFAAPFSGVLFSIEVMSSHFSVRDYWRGFFAATCGAFIFRLLAVFNSEQETITSLYKTSFRVDVPFDLPEIFFFVALGGICGVLSCAYL 300
BenignSAV:                                                                                           V             
gnomAD_SAV:     # #T     I VS#H ##L  I K # #    WYC SV  # SSR  MLWH E  DG HD  N FS  I # NI  NM     S V  A YSI N  # 
Conservation:  5344342434344338335544456443246433373436554254532434534332323653346363422337524373437326624783345265
STMI:           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH        HH HHHH     HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH  HHHE       EEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHE EEE       EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                                                   E E                D  E                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FCQRTFLSFIKTNRYSSKLLATSKPVYSALATLLLASITYPPGVGHFLASRLSMKQHLDSLFDNHSWALMTQNSSPPWPEELDPQHLWWEWYHPRFTIFG 400
BenignSAV:                   F                                         Q                                           
gnomAD_SAV:      **  R  L ITGFNY  V AT     T   WR T V  L A DR    W   *ER E  LNSY CV TI  P  L  VKFY H# C*DR  SQ   Y 
Conservation:  2347124032323123233424352335323333342333323153233532452455055532136101123241114013221133248135114331
STMI:          MM                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                              MMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH  HHHHHH      HHH         HHH  HHHHHHH    HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH   HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH     HHHHHHHH      H                 HHHHHH      HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH HHHHHHHHH                     HHHHHHHH     HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLAFFLVMKFWMLILATTIPMPAGYFMPIFILGAAIGRLLGEALAVAFPEGIVTGGVTNPIMPGGYALAGAAAFSGAVTHTISTALLAFELTGQIVHALP 500
BenignSAV:                                                   T                           L                         
gnomAD_SAV:     #SY    TL*L    SAV   TR  T L ##  STRHF   V#TIS SKDL A  INS    RRCT S#P D AV MA    MV    Q SS T YV T
Conservation:  1624642452453445242426654528244255436542552241234151032111023275365445456446445555764455494675226236
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHH      EEEHHHHHHHHH  HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH     E  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH  HH HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     E           HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH  HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLMAVLAANAIAQSCQPSFYDGTIIVKKLPYLPRILGRNIGSHHVRVEHFMNHSITTLAKDTPLEEVVKVVTSTDVTEYPLVESTESQILVGIVQRAQLV 600
BenignSAV:                                      W   C                                                              
gnomAD_SAV:    MP  A   ST   G  L      V    P   LWV  HS SP R S    T  GFAAM   M#      FMIY  MAK  VMD#       AM HK   L
Conservation:  3334563573437414586643235374965874523312122131312541111126242222145203523310124445451431364713142151
STMI:          MMMMMM                                                                                              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH                   EEHHHH     EEE     HHHHHHHHH        EEEE    EEEEEEEHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH                    EHHHH     EEE    EHHHHHHHHH        EEEE    EEEEEEEHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH       EEEEE                   EHHHH     EEE     HHHHHHHHHH        E      EEEEEE HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80       
AA:            QALQAEPPSRAPGHQQCLQDILARGCPTEPVTLTLFSETTLHQAQNLFKLLNLQSLFVTSRGRAVGCVSWVEMKKAISNLTNPPAPK 687
PathogenicSAV:                                                              V                         
BenignSAV:                                                   F             Q                     L    
gnomAD_SAV:    RSFRP #L T A        V TS   M   I R      SQK   FSE S FH  #M LPC VA  M # KK     T   L    
Conservation:  025110111101111101121312141213212242312432543243132113133461073327134312331233121133222
SS_PSIPRED:    HHHH          HH HHHHHH                 HHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEEEEHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHH               HHEE                  HHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEEEEHHHHHHHHHH H      
SS_PSSPRED:    HHHHH        HHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHH   EEEEE   EEEEE  HHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                   DDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                       DDDDDD
DO_IUPRED2A:       DD   D                                                                      DDDDDDD