P52209  6PGD_HUMAN

Gene name: PGD   Description: 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating

Length: 483    GTS: 2.643e-06   GTS percentile: 0.840     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 222      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAQADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLANEAKGTKVVGAQSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDTGDIIID 100
gnomAD_SAV:    K R# SS    G#  H * QSI YYR M  T   S  EA H V S      M A H      P#   AWQ FP        H  M N       C  VT 
Conservation:  8346756858556865445765468856544559546763376439668566586246364533483846756998982969465146474721799779
SS_PSIPRED:      HHHEEEEEEE  HHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHHHHH      EEE   HHHHHHH     EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHH     EEEE
SS_SPIDER3:         EEEEEEEH  HHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHHHH H    EEEE   HHHHHH     EEEEEEE   HHHHHHHHH HHH     EEEE
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHHHHHH     EEEE  HHHHHHHH    EEEEEEE    HHHHHHHHHHH     EEEE
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                GLAVMG                 NRT                                       VKA                       
MODRES_P:                                                              S                                           
MODRES_A:                                           K                    K                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARYGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICE 200
gnomAD_SAV:       C    #  W *#           RF   Q   #  SL  T         V  V      EA A  A S#   N      M VL   V     E    
Conservation:  9997774765663235115468667699799969984779999793449976652777468586547779767673656966776766676779979999
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHH   EEEE        HHHH         HHHHHHHHHHHHHH            EE        EE       HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          H HHHHHHHHHH   EEEEE E     H            HHHHHHHHHHHHHHH         E EE     EEEEE E   HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHH  EEEEE                    HHHHHHHHHHHHHHHHH                  EEE         HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:            D                        DDDDD DD                                                          
BINDING:         N                                                                                        Y        
REGION:                                    SGG                                                       HN            
ACT_SITE:                                                                                         K      E         
MODRES_P:                                  S                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AYHLMKDVLGMAQDEMAQAFEDWNKTELDSFLIEITANILKFQDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIGEAVFARCLSSLKDERIQA 300
BenignSAV:                                                                        S                                
gnomAD_SAV:        I  LV VG  K    L G S  G      QV  S F LR# ND    LR   GT# R  E CST  T Q SI I  V KT L W      YG V T
Conservation:  9769678462525136435711995697799977776458454524422776794959999797576766597572954856576578687787357215
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH EE       HHHHH         HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH   E     E HHHHHHH       HHHHHHHHHH   H HHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH       HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                       D                                               
BINDING:                                                                   K                          R            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKKLKGPQKFQFDGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVE 400
gnomAD_SAV:          HR #LL A  T      WEVVC# NSMPHT      K    K  CP S   V# I     V   L   RT   L Q LQ R   V #   TP  
Conservation:  5217078200150356126567754899688667868896954898156393688958868998899985496566538642322745768418831542
SS_PSIPRED:    HHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH    HHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH  HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH  EEEEHHHH HHHHHHHH        HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:              K                                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80   
AA:            NCQDSWRRAVSTGVQAGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPASLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGTVSSSSYNA 483
gnomAD_SAV:      #NFCWW I A       V Y  I    CER G        M        TY  Q F NS K    S ASL D##    D# 
Conservation:  25835883653365309565678549876669886236988858568888989886652298153966866486364655445
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH        HHHHHHHHH       EE     EEEEE           EEEE 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH  EEEEE      EEEE  EE   EEE  EEE 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH    EEE     EEEEEE       EEE EE  
DO_DISOPRED3:                                                                             DDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                         
DO_IUPRED2A:                                                                                      
NP_BIND:                                                                                    SSSY  
BINDING:                                                     R     H