P53609  PGTB1_HUMAN

Gene name: PGGT1B   Description: Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta

Length: 377    GTS: 1.8e-06   GTS percentile: 0.578     

gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    

      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 161      SnvSAV 


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAATEDERLAGSGEGERLDFLRDRHVRFFQRCLQVLPERYSSLETSRLTIAFFALSGLDMLDSLDVVNKDDIIEWIYSLQVLPTEDRSNLNRCGFRGSSY 100
gnomAD_SAV:    # S#AN GVG N  AK  N  P P     PG    #TG#CFLR ARK  V   TP RQ    C GE K   L    C     H  V TS  H   * C  
Conservation:  3333111111000103222222233122333122244121121210363435554574433235224361124554364533623325752369777965
SS_PSIPRED:          HHH            HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH                     
SS_SPIDER3:          H              HHHHHHHHHHH     HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH                      
SS_PSSPRED:                        HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                    
DO_IUPRED2A:      DDDD D                                                                                           


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LGIPFNPSKAPGTAHPYDSGHIAMTYTGLSCLVILGDDLSRVNKEACLAGLRALQLEDGSFCAVPEGSENDMRFVYCASCICYMLNNWSGMDMKKAITYI 200
BenignSAV:       V                                                                                                 
gnomAD_SAV:      V#LS   SSA PDT N   V VP        V      *       V     RVQ  # F     G    L  CR    S   SD    A    V C 
Conservation:  5946654363372296777676676776655766799795775725453976799639979355665769667969996777569669997633755299
SS_PSIPRED:                       HHHHHHHHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHH       EE         HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH
SS_SPIDER3:                        HHHHHHHHHHHHHHH   HH   HHHHHHHHHH E     E          HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH
SS_PSSPRED:                       HHHHHHHHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RRSMSYDNGLAQGAGLESHGGSTFCGIASLCLMGKLEEVFSEKELNRIKRWCIMRQQNGYHGRPNKPVDTCYSFWVGATLKLLKIFQYTNFEKNRNYILS 300
gnomAD_SAV:      N#CC  #V         #    S     YV    G   L        K  V       R   K    S CC   A       V#*    GRH I V P
Conservation:  6474676465676654767797979677675797793537534693756799569795657999769799979999777947734756663679967786
SS_PSIPRED:    HHH                HHHHHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHH HHHH  HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH                HHHHHHHHHHHHH   HHH   HHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHH      E HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH                 HHHHHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                                                             D C                             
REGION:                          HGG                                         RPNK     YSFW                         


                       10        20        30        40        50        60        70       
AA:            TQDRLVGGFAKWPDSHPDALHAYFGICGLSLMEESGICKVHPALNVSTRTSERLLDLHQSWKTKDSKQCSENVHIST 377
gnomAD_SAV:       C A      S  NS   #T            R   E     SL  W CGC    QE       QRF    #  I
Conservation:  76634677979997779635546654666485452343345758633144243331652241122101111101111
SS_PSIPRED:                      HHHHHHHHHHHHH           HH   HHHHHHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:    H                 HHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHH              E   
SS_PSSPRED:    H                HHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH                 
DO_DISOPRED3:                                                                  DDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                        DD  DD   DD
DO_IUPRED2A:                                                                                
METAL:                             H