P53611  PGTB2_HUMAN

Gene name: RABGGTB   Description: Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta

Length: 331    GTS: 1.673e-06   GTS percentile: 0.525     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 125      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGTPQKDVIIKSDAPDTLLLEKHADYIASYGSKKDDYEYCMSEYLRMSGIYWGLTVMDLMGQLHRMNREEILAFIKSCQHECGGISASIGHDPHLLYTLS 100
gnomAD_SAV:     V  RN  V#E N#L ISF    #NHVSFC# R G   *         VVF DP# T       C #K      M P   D V LN  TR   Q   # G
Conservation:  3664276826315560174345932993467267665994579799579799999767654371663239730953577555973557349979797997
SS_PSIPRED:                       HHHHHHHHHHH      HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH              HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                       HHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH                HHHHHH
SS_PSSPRED:           EE       HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDD                                                                                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:        T                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVQILTLYDSINVIDVNKVVEYVKGLQKEDGSFAGDIWGEIDTRFSFCAVATLALLGKLDAINVEKAIEFVLSCMNFDGGFGCRPGSESHAGQIYCCTGF 200
gnomAD_SAV:       M M  G MI  AI  A     C    V      V     A     V E              N VK         S      DA  QT   C  P  
Conservation:  9796935864323454476637744693699994992797567664546244545574752544347536664759799769626446976674558344
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH HHH  HHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH  HH   HHHHHHHHHH E     E       H HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                                                                                 HAG        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LAITSQLHQVNSDLLGWWLCERQLPSGGLNGRPEKLPDVCYSWWVLASLKIIGRLHWIDREKLRNFILACQDEETGGFADRPGDMVDPFHTLFGIAGLSL 300
gnomAD_SAV:         K  RID N   C    *  #  R S  L*  S      *F      #     TA DE C   VT R  K  *  HS E K  #        V * 
Conservation:  6333323324336447957738453676797777766665767676544435354377632693097947663333653795463445669577567655
SS_PSIPRED:    HHH   HHH  HHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH  HHH  HHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH       E         HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                   D                   
METAL:                                              D C                                                 H          
REGION:                                       RPEKLPDVCYSWW                                                        

                       10        20        30 
AA:            LGEEQIKPVNPVFCMPEEVLQRVNVQPELVS 331
gnomAD_SAV:     #G    R   I  I          *  VM 
Conservation:  5331044453733645222316215132320
SS_PSIPRED:               HH   HHHHHHH   HHH  
SS_SPIDER3:            E       HHHHHH    HHH  
SS_PSSPRED:                    HHHHHHH   HHH  
DO_DISOPRED3:                                 
DO_SPOTD:                                   DD
DO_IUPRED2A: