P54136  SYRC_HUMAN

Gene name: RARS1   Description: Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic

Length: 660    GTS: 2.561e-06   GTS percentile: 0.821     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 7      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 325      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDVLVSECSARLLQQEEEIKSLTAEIDRLKNCGCLGASPNLEQLQEENLKLKYRLNILRKSLQAERNKPTKNMINIISRLQEVFGHAIKAAYPDLENPPL 100
PathogenicSAV: #G                                                                                                  
BenignSAV:       I                                                                                                 
gnomAD_SAV:    RGLP FVFFV#      A  #     EW      S SY    LF Q KF FE Q  V Q      G  LIE #V  V C  DI    V  V        P
Conservation:  2101000001120038258339248740865110220521742836992797995557374533542201326396512662592085236372423685
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:  DDDDDD D                                                                                            
DO_SPOTD:      DD                                                                DD                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LVTPSQQAKFGDYQCNSAMGISQMLKTKEQKVNPREIAENITKHLPDNECIEKVEIAGPGFINVHLRKDFVSEQLTSLLVNGVQLPALGENKKVIVDFSS 200
BenignSAV:                                       G                                                                 
gnomAD_SAV:    PM S H     Y H    #SVF  P   #  IYSG V   V  R   S #           T AP  R   L *   RVMD    ST #G   I#LE   
Conservation:  2655655566788999687553643724327348657731623376154244435797657665462403452243248348634624102467547675
SS_PSIPRED:     EEE         HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH       EEE EEE   EEEEEE HHHHHHHHHHHHH            EEEEE   
SS_SPIDER3:    EEEE     HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH       EEEEEEE    EEEEE HHHHHHHHHHHHH            EEEEE   
SS_PSSPRED:     EE         HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH      EEEEEEE   EEEEEE HHHHHHHHHHHHHH           EEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                            D   D DDD DDDDD                                                            
REGION:                                                                                                           S

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PNIAKEMHVGHLRSTIIGESISRLFEFAGYDVLRLNHVGDWGTQFGMLIAHLQDKFPDYLTVSPPIGDLQVFYKESKKRFDTEEEFKKRAYQCVVLLQGK 300
gnomAD_SAV:     I      I PV  A# A  K HF#      M K  L   #   V I FT VR RY YC KI SSTWH  I       K    KD T *T *YA  P  E
Conservation:  7747777777797657997734565672324668489599998989696558563966542356765886289678847782765996695366829955
SS_PSIPRED:       HH      HHHHHHHHHHHHHHHH    EEE        HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:      HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEE EE   H HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE        HHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                 H                                                                                         
MOTIF:         PNIAKEMHVGHL                                                                                        
REGION:        PN                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NPDITKAWKLICDVSRQELNKIYDALDVSLIERGESFYQDRMNDIVKEFEDRGFVQVDDGRKIVFVPGCSIPLTIVKSDGGYTYDTSDLAAIKQRLFEEK 400
BenignSAV:                                I                                               E                    Y   
gnomAD_SAV:     LESI  #   Y  ACR    MC    IY   S    C #   N I   QHT     NH  T    L  F   #T#  V   SC      S  E  YK# 
Conservation:  2436367934994769157376623926143668894543250156345623932436497665834533598674898986696878787644950385
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE  HHH HHHHHHHHHHHHH   EEEE   EEEE       EEEE         HHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE   H  H HHHHHHHHHHH   EEEE  EEEEE       EEEEE       HHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE    HHHHHHHHHHHHHHHH  EEE    EEEE       EEEEE        HHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                                          Y   D            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ADMIIYVVDNGQSVHFQTIFAAAQMIGWYDPKVTRVFHAGFGVVLGEDKKKFKTRSGETVRLMDLLGEGLKRSMDKLKEKERDKVLTAEELNAAQTSVAY 500
PathogenicSAV:                                                        L                                            
gnomAD_SAV:    VGTFFC A S   AL         V  * VRIII# LRD   # V   N M  IHL  R C  Y       Q VN          V TK#  V R  I# 
Conservation:  5515688695894296534625533386354234351535886869685668578565585826853675566556836646653662566035615766
SS_PSIPRED:      EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEEE  EE                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHH         EEEEEEEEEE      E E     EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH        EEEEE                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                  Q                                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GCIKYADLSHNRLNDYIFSFDKMLDDRGNTAAYLLYAFTRIRSIARLANIDEEMLQKAARETKILLDHEKEWKLGRCILRFPEILQKILDDLFLHTLCDY 600
PathogenicSAV:            #                                                                                        
gnomAD_SAV:    R M    I  SW DG        P        CM    IT   V C# S V   P    *      H   D    W#  P A  P* T GV     R  D
Conservation:  7767767756482667574795667657576577665446866638474544118435714215364855673854464686856573365846628666
SS_PSIPRED:     HHH HHH       EE  HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH  HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH        E   HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH     E   HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH            HHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                    NTAAYLLYAFTRIRS                                                         

                       10        20        30        40        50        60
AA:            IYELATAFTEFYDSCYCVEKDRQTGKILKVNMWRMLLCEAVAAVMAKGFDILGIKPVQRM 660
gnomAD_SAV:    M   PS     C  Y W K  SHA  MV MKL HLR SKT      E  N  E I     
Conservation:  465864578599658667664536816254653646676434366432733544245155
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH  HH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH  EE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                              
DO_SPOTD:                                                                DD
DO_IUPRED2A: