P54219  VMAT1_HUMAN

Gene name: SLC18A1   Description: Chromaffin granule amine transporter

Length: 525    GTS: 3.874e-06   GTS percentile: 0.973     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 13      gnomAD_SAV: 432      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLRTILDAPQRLLKEGRASRQLVLVVVFVALLLDNMLFTVVVPIVPTFLYDMEFKEVNSSLHLGHAGSSPHALASPAFSTIFSFFNNNTVAVEESVPSGI 100
BenignSAV:        P      Q                                                              V       C S             T  
gnomAD_SAV:    K QP# EV *Q   *R V Q      L I#FVPA V   M  SVATI #H    I#A  F   S VV  L D V SV   VC L #H  M L  RITT  
Conservation:  2222222220023002213114251243334334323333336346456412221010020000011010000012210112534331310200002222
STMI:                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                          
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH   HHHHH    HHHHH         EE                   EE      EE         
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH      EEEEE   HHHH                               E      EEEE       E
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH EEEHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE   HHHHH                                                 
DO_DISOPRED3:  DDDDD                                                        DDDDDDDDDDDDDD                       DD
DO_SPOTD:                                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                               N                            N             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AWMNDTASTIPPPATEAISAHKNNCLQGTGFLEEEITRVGVLFASKAVMQLLVNPFVGPLTNRIGYHIPMFAGFVIMFLSTVMFAFSGTYTLLFVARTLQ 200
BenignSAV:     P                                  T   R                       M                                    
gnomAD_SAV:    P     T S TS  S T LS E  G *DP  #D KT WIR  ST  G VPFR #T LDR  KSME NTSV V LL T  T  #LT PES # RL VQ   
Conservation:  0001120001011110000022116111111912973369488689724883388248356865974496928835463844455651451445344454
STMI:                                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMM
SS_PSIPRED:                                       HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     E                           E   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                          
DO_SPOTD:            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                DDD  DDDDDD D   D          
DO_IUPRED2A:                D                                                                                      
CARBOHYD:         N                                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GIGSSFSSVAGLGMLASVYTDDHERGRAMGTALGGLALGLLVGAPFGSVMYEFVGKSAPFLILAFLALLDGALQLCILQPSKVSPESAKGTPLFMLLKDP 300
BenignSAV:      T                                              I                                                   
gnomAD_SAV:     T P L#FIE     G   A ER KEG T S   A TF    V#  EGIRHK AE Y #  L  LRE  V PF    V*TT I L#RDEW A SV  #E 
Conservation:  3455445535876765446248166827694666746576548778865482635424996498364546845854473855327432254541174478
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    M
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHH  H
SS_SPIDER3:    H  HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH HHHHHEEE               HHHHH  H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHH H
DO_DISOPRED3:                                                                                            DDD       
DO_SPOTD:                                                                                         DDDDDD           
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YILVAAGSICFANMGVAILEPTLPIWMMQTMCSPKWQLGLAFLPASVSYLIGTNLFGVLANKMGRWLCSLIGMLVVGTSLLCVPLAHNIFGLIGPNAGLG 400
BenignSAV:                                                                                                V        
gnomAD_SAV:    *   V  AV  VSL L  VQSIVR *TL ATFCSR  R#   FR  MF#FVSSKF # MGKNIS#*     R   L       SPT S LVFTDSTERRS
Conservation:  7764688466558564646644886864466743364794564755468847754851653649776756495234725454674814636864833646
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH HH   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LAIGMVDSSMMPIMGHLVDLRHTSVYGSVYAIADVAFCMGFAIGPSTGGAIVKAIGFPWLMVITGVINIVYAPLCYYLRSPPAKEEKLAILSQDCPMETR 500
gnomAD_SAV:     SV# LY  I#TM#   M  HQNLA#    TVT M  RI SVK TP SCV GND V H* #D I#FSHFDCT  Y HPWR LT  * #GV R*A*SVKIW
Conservation:  4548878585574565899769386865569859587949785557246344126965246424624552659552254452323553433212333222
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20     
AA:            MYATQKPTKEFPLGEDSDEEPDHEE 525
gnomAD_SAV:    TCE  M M  I  RQ #GD#  #* 
Conservation:  2412221011322131222112222
SS_PSIPRED:                             
SS_SPIDER3:                             
SS_PSSPRED:                             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDB
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:          DDDDDDDDDDDDDDDDDD