P54750  PDE1A_HUMAN

Gene name: PDE1A   Description: Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A

Length: 535    GTS: 1.742e-06   GTS percentile: 0.556     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 243      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGILRCLVKQLERGDVNVVDLKKNIEYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLAST 100
gnomAD_SAV:    V   T QM D G IA   V E    R C L  RT  Y A    K  I#IIN R     VT M #V  VH      G      G R #  S   QY  S  
Conservation:  2220000000222000022220001102211003450253444122322033523341443443335244252245246472343362582484477627
SS_PSIPRED:         HHHHHHH   HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH        HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          HHHHHH  HHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH          HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:            HHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH         HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                    D DDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                  DDDDDDDDDDDDDDDD            
DO_IUPRED2A:    DDDD                                                                                               
REGION:                               TEKMWQRLKGILRCLVKQLER                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCL 200
gnomAD_SAV:      Q# R I   R Q T  #   N          L *EA LTI     VT  II Q#I   P N  P  G  R     CI        YVLSC   S    
Conservation:  8644211113424555355564454545554463555443233425522520256147272677828424523547444435543452523465562215
SS_PSIPRED:    HHHH                HHHHHH                     HHHHHHHH        HHHHHHHH    HHHHHHHHHHH  HHHH    HHHH
SS_SPIDER3:                        HHHHHH           E         HHHHHHHH        HHHHHHHH    HHHHHHHHHHH  HHHH    HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH               HHHHHHH    HHH             HHHHHHHH        HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH
DO_DISOPRED3:        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_SPOTD:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                           
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLM 300
gnomAD_SAV:         #V       Q         V I  S P V  P  T# CV D     V    T N  # AR        AT H       G    H  MR TDQFI
Conservation:  2152236619624425466532653554553623353674453544764572344437776465635535433558317447886766866757546356
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHHH         HHHH    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH    HHHHHHHHHHHHH           HHH    HHHHH       HHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHH H HHHH  HHHHHHHHHHHHHHH         EEE    HHHHHH       HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                               H                                   HD                                        
ACT_SITE:                        H                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEEEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGL 400
gnomAD_SAV:         S V H    Y S  W IMT  I    L S   L   M*D S  AK T K  PTF       LG      Q   Q  VTP               P
Conservation:  4343395616743545254625553455464743652544146216332222362433444554665457460704723470246565335655833668
SS_PSIPRED:          HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH   
SS_SPIDER3:                HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH      H HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH   
SS_PSSPRED:    H           HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                 D                                                     
METAL:                                                                          D                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSF 500
gnomAD_SAV:    L  T   W   T P *    V# L     F      K SL    G #LESK YFS TN LANT E #VTET  PPS    T N   F E T    GM  L
Conservation:  3487898844635846856755565374435635335433163225121210220102311212220103113101011101221111112512352125
SS_PSIPRED:                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHH                      HHHH
SS_SPIDER3:                  H HH HHHHHHHHHHHHHHHH  H  HHHHHHHHHHH                HHHHHH                           
SS_PSSPRED:                HHHHHHHH   EE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHH                      HHHH
DO_DISOPRED3:                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D        
DO_SPOTD:                                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         
DO_IUPRED2A:                                                                                 D                     

                       10        20        30     
AA:            KNNLVDIIQQNKERWKELAAQEARTSSQKCEFIHQ 535
gnomAD_SAV:    Q    G  R   K   Q D  GVS  LPN     H
Conservation:  50242114017423662111222220000022222
SS_PSIPRED:    H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H HHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDB
DO_SPOTD:                          DDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                    DDDD