P56524  HDAC4_HUMAN

Gene name: HDAC4   Description: Histone deacetylase 4

Length: 1084    GTS: 1.187e-06   GTS percentile: 0.305     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 15      gnomAD_SAV: 500      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLPVAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQL 100
gnomAD_SAV:     N     G  P Q   M      #   V  M  M SG       L# R#  C       RMTDA#MQ E     I T    RH   RF  T  E   K  
Conservation:  1111111111110211121311110011111122211010110101131131111111121123112432742462231233131212222111223212
SS_PSIPRED:                    HHH  HHH                                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                    HHH  HHHH                                      HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDD    DD      DDD  DDD DDDD    D DD   D                 D   DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SRQHEAQLHEHIKQQQEMLAMKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHRNLNHCISSDPR 200
gnomAD_SAV:     Q   V I      KK    T QRE    RKW     C  #    # W             E   #          K I     # TRQ       GN H
Conservation:  0321243433542222211212221111223321122220221202121113113213232221535321542332424324212121112411122113
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H          HHHHHHHHHHHH HHHHHHH            
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              D     DDD      DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDDFPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSAPGSGP 300
PathogenicSAV:                                                L                                                    
BenignSAV:                        R                                                                      T         
gnomAD_SAV:    CC R         G    RR L  CK # P  HNTE                #        K Q    ICSE RT   V   HL  D   T   #   R 
Conservation:  2411211212322213312211222113255202124314765434453553425253232253345537624312223233622312212431222133
SS_PSIPRED:                                                       HHHH  HHHHH    HHH                               
SS_SPIDER3:                                              E            HHHHHHH                                      
SS_PSSPRED:                                                              HHHHH                                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:               S                                   S                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSPNNSSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPATGPSAGTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTS 400
BenignSAV:                       T#                                            V        K               S          
gnomAD_SAV:       K  PRNI T KD TSVI   LT M     VATQ AP T  S   L      A S #  SL V MVS   TK  S  S#  G     S  VP     L
Conservation:  2342220122223131212022211311324221003222223112113213234223431321111221132201012211212242222222111211
SS_PSIPRED:                             HHHHHHHHH                                   HHHHHH    HHHH                 
SS_SPIDER3:                            HHHHHHHHH                                    HHHHHH   H H                   
SS_PSSPRED:                            HHHHHHHHHH                                                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDD    DDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD            DDDDDD
MOTIF:                                                         PSLPNI                                              
MODRES_P:                                                       S                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PLERDGGAAHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQQQ 500
BenignSAV:                                         S                                                               
gnomAD_SAV:    S  W RE T  A    VL    LQ  TTVI D  TVS #EP  I # WLFS V  VW  HA R  HL   SE T              L D         
Conservation:  1111122215232244333322212222323122113121222111112332012211222321224342211211211111222211222112133132
SS_PSIPRED:               HHHHHHH                                                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                 HHHHH                                H H                    HHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D  D   DDDDD       DD DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD DDDDDDDDDD DD
MODRES_P:                                                                        S                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPYLDRLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQ 600
PathogenicSAV:                      L                                                                              
gnomAD_SAV:      RLS    R    VW     L  M    HG  S   KHCRHQ LWP AVDS  SM      T NN  VG   W  #LD CH G E  H  E        
Conservation:  2122112122213123221144363443211212001011101111101010101200111114012121110001111011101010230113021121
SS_PSIPRED:    HHHH                  HHHHHHHHHHHHH            HHHHHH                              HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH                      HHHHHH HHH            HHHHHH                              HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH                   HHHHHHHHHH                                                  HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         
MODRES_P:                                                                      S                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCEC 700
gnomAD_SAV:       R         TT  AM CCS    C    L   T   M L  SS Q   M A M            R   C    SR              W     
Conservation:  1112010111211111111111121131322313121111011110111102135343312543636163222134543544244435523264232431
SS_PSIPRED:    HHHHHHH    HHH                                       EEEE  HHHHHHH             HHHHHHHHHHHH      EEE
SS_SPIDER3:    HHHHHH      H                                        E E   HHHHH E              HHHHHHHHHHH       EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHH                                                EE  HHHHHH               HHHHHHHHHHHH      EE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          D                                      
DO_IUPRED2A:        DDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D D DDD            DD   D                          
METAL:                                                                           C C     H                         
MODRES_P:                                     SS                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLASVFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPP 800
BenignSAV:                                                          I                               T              
gnomAD_SAV:    NC C  I    RM  L   S         W   #C    D  T MLIW   S I     ST S G  T # C     M       TI             
Conservation:  3253453233532443304222345243223323211232211211315233535451443624223333242425433444136312243453324224
SS_PSIPRED:           HHHHHHHH HHHHHHH      HHH   HHHHH HHHHHHH            EE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE   
SS_SPIDER3:       E   HHHHH    HHHHHHH      HHH    HH   H  HEEE            E      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE   
SS_PSSPRED:           HHHHHHH  HHHHHHH      HHHH HHHHH   HHHHHH            EEE HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH      EEEE   
DO_DISOPRED3:                                   DDDDDDDDDDDDDDDD                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                   DDD 
METAL:                                                           C                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDP 900
PathogenicSAV:                                                                       L                             
BenignSAV:                                   M                         I                                           
gnomAD_SAV:          NM         L         K  MR S  M   M        T C#NL I  #      #          E   SE#SM   I V  #SS   
Conservation:  4345214232245335343342335323222123444564446445552464154134434385654525545251222351105164344345365415
SS_PSIPRED:                    HHHHHHHHHHHH    EEEEEE        HHHHH     EEEEEEEE                        EEE         
SS_SPIDER3:               E    HHHHHHHHHHHH    EEEEEE        HHHHHH    EEEEEEEE     E       HH      E EEEE         
SS_PSSPRED:               EEEHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEEE     HHHH        EEEEEEEE                        EEEE        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D                                                                          D                        
ACT_SITE:        H                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPL 1000
BenignSAV:                                                                         A                               
gnomAD_SAV:    #  ETD  V   M  I MTNK T           TM   L      I  TK  R MME  L    SQ I       E  T   T         R KPN P
Conservation:  4335345324331442854034274355587664323762338888145336531532373154273235376685453446345439523565023221
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE    HH             HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHH H HHHHHH   EEEEE   HH          EEE HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE              EEE HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                      D

                       10        20        30        40        50        60        70        80    
AA:            PEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKPAEKRPDEEPMEEEPPL 1084
BenignSAV:               T                                                                         
gnomAD_SAV:    L #I HEK  TKT C   T # FL  H HY HH A IV C  #K  ##            L  L L  TQ   GK     ALH 
Conservation:  311121225401410342243224222202220020011012012111303222321223232211111111111100210211
SS_PSIPRED:     HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH         HHHHHH    HHHHHHHHHH                       
SS_SPIDER3:     HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH HHH          HHHHH      HHHHHHH H                       
SS_PSSPRED:     HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHH                       
DO_DISOPRED3:                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBBBBBBBB
DO_SPOTD:                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDD DD   D                        DDDDDDDDD   DDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:                                                           EEAETVTAMASLSVGVKPAEKRPDEEPMEEEPPL