P58418  CLRN1_HUMAN

Gene name: CLRN1   Description: Clarin-1

Length: 232    GTS: 2.837e-06   GTS percentile: 0.877     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 15      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 146      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPSQQKKIIFCMAGVFSFACALGVVTALGTPLWIKATVLCKTGALLVNASGQELDKFMGEMQYGLFHGEGVRQCGLGARPFRFSFFPDLLKAIPVSIHVN 100
PathogenicSAV: #                    H        L        G  V    K                                                    
BenignSAV:           I                                                                                             
gnomAD_SAV:     SN KNI    I       S   I  GW #R  M  A  G MRP   S# # DVE  IDKIR*R   RDC SR  M*E  LQL    H HQT  GTT ID
Conservation:  7321234223223332342422123223323193051234255535546422671462813156552824362677616112523772531244245842
STMI:                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                        
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHEEEEEE     EEE    HHH  EEEEEEE EE EEEEE             HHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE     EEE      EEEEEEEEE EEEEE   E     E   H HHHHHH    HHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEE     EE        EEEEEEEEEEEE  EEEE             HHHHH      HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                            
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                     N                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VILFSAILIVLTMVGTAFFMYNAFGKPFETLHGPLGLYLLSFISGSCGCLVMILFASEVKIHHLSEKIANYKEGTYVYKTQSEKYTTSFWVIFFCFFVHF 200
PathogenicSAV:     P  P           K  D                      Y   P   W             N                                
gnomAD_SAV:      PVC  F L N  #   ST  D E #S  VR S EV    LS AF D  A  W   GLN #Y   R#TSF    *I# MK  TCA  L #T  S   # 
Conservation:  5546312531453543675459434294334296185565525463332643349367542438753768639117152422706307794352433353
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                              MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH     EEEE   HH  HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH      EEEEEE EE    HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH     EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30  
AA:            LNGLLIRLAGFQFPFAKSKDAETTNVAADLMY 232
gnomAD_SAV:     K   TQ   S LS T  E TVIIS  TG I 
Conservation:  34235543514258413171223224426666
STMI:          MMMMMM                          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH                  HHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH                  HHHE 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH                HHHHH  
DO_DISOPRED3:                  DDDDDDDDDDDDDD  
DO_SPOTD:                    DDDDDDDDDDDDDDD   
DO_IUPRED2A: