P98194  AT2C1_HUMAN

Gene name: ATP2C1   Description: Calcium-transporting ATPase type 2C member 1

Length: 919    GTS: 1.025e-06   GTS percentile: 0.235     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 22      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 268      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKVARFQKIPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVASILQADLQNGLNKCEVSHRRAFHGWNEFDISEDEPLWKKYISQFKNPLIMLLLASAVISVLMHQF 100
gnomAD_SAV:      L #    S      TMLIF  E G  SA    V  VRT PH    TY     Q YR C             RC F    S               Y  
Conservation:  3000311011002230417343442742321336411516642078320371477117686661332268494664186559876668444458545344
STMI:                                                                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         
SS_PSIPRED:                             HH   HHHHHHHH         HHHHHHHHHHH            HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH  H
SS_SPIDER3:                             HHH  HHHHHHHH    H    HHHHHHHHHHH   E        HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH   H
SS_PSSPRED:                          HHHHH   HHHHHHHH         HHHHHHHHHHH            HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DDAVSITVAILIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLEHTLARDLVPGDTVCLSVGDRVPADLRLFEAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTA 200
gnomAD_SAV:       A        I         H   YPK        K R LC   W R   G#       F    G      C    M PCL  CG  R       G  
Conservation:  5864866444345584463554564454334333355243748482535255869888846344254748656563442463568646769446729221
STMI:              MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                             
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEE  EEEEEEHHH     EEEE    EE   EEEEEEE  EEEHHH             
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHH     EEEEEE  EEEEEEHHH     EEEEE   E    EEEEEEEEEEEEEE     EE EEE  E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHEEE  HHHHHHHHHHH    EEEEEE  EEEEE HHH    EEEEE     E   EEEEEE   EEEE               
DO_DISOPRED3:                                                                                        DDDDDDDDD DDD 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                              DDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PQPAATNGDLASRSNIAFMGTLVRCGKAKGVVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLVGWLLGKDILEMFTISVS 300
PathogenicSAV: L                  E                                                                                
BenignSAV:                L                  I                             N                                       
gnomAD_SAV:    SH    D #  LGG          W  V  L   I  I         T T   S  S   N              M      I             VGI 
Conservation:  3412224443445185667779643957596856586397999766797477579999977971995676437626784433259339513434484445
STMI:                                                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMM
SS_PSIPRED:              HH   EEE    EEE EEEEEEE      HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             HHH   EEE   EEEEEEEEEEEEE     HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                  EEEE   EEEE  EEEEEE      HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDD                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCCNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGLHAEVTGVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNPA 400
PathogenicSAV:    T    #        P                      P  Y                                                        
gnomAD_SAV:        S   V  V    M     T            SV  S  #F            ED   IAR      Q V    I C KS      V   RACC   
Conservation:  5877677977777758865765455534557777794656666635396477997969698764536765236465949753091703233353343324
STMI:          MMMMMMMMMMMM                                                                                        
SS_PSIPRED:    HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHH     EEEE         EEEEEEEEE    EEEEEE       EEEE  EE      HH
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E       E   EEEEEE     EE  EEEEEEEEE    EEEEEEEEE     EEE  EEE     HH
SS_PSSPRED:    HHHHH      EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE     EEEE          EEEEEEEE    EEEEEE EE    EEEE  EE      HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:           VA I E                                                                                            
ACT_SITE:                                                       D                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQQDYIRKAEYPFSSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYQSKGQTL 500
PathogenicSAV:           R                                                                              F          
BenignSAV:                                                      T                                                  
gnomAD_SAV:      #   V      T   SIIVL     ES M        #  R G M  T H        T L    *  K   K F T SV KKI     I RG     
Conservation:  5355667445587525321254856665565484466562234317372292786847878664621312532234465888574842493163236134
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH    EEE  EE   HHHHHHHHHHHH   HHHHHH  EEEEE       EEEEEEEE       EEEEE   HHHHHHH  EEEE  EEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH   EEEE  EEEE HHHHHHHHHHHH    HHHH   E EEEE      EEEEEEEE       EEEEE   HHHHHH   EEEE  EEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH   EEE  EE    HHHHHHHHHHHH  HHHHHH          HHHHHHEEEEE        EEEEEE  HHHHHHHHHHEE    EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLTQQQRDVYQQEKARMGSAGLRVLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRTGVKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEID 600
PathogenicSAV:                                                                      I         V   P    R           
BenignSAV:                                             F                                                           
gnomAD_SAV:      N    H C K  GH   VA    SV     M     V FM M  L  S E Q      T  I VIT     R     V  C    CRAF        V
Conservation:  3434643303144211562397686446583445274779757547867176345511711474254656785445625462255521212143784654
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE      EEEEEEEE        HHHHHHHHHH   EEEEEE   HHHHHHHHHHH        EEEHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHHE       EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHH   EEEEEE   HHHHHHHHHH            HHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE       HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH   EEEE   HHHHHHHHHHHH           HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      D                                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAVALKAADIGVAMGQTGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIK 700
PathogenicSAV:                                         R   R                                                       
gnomAD_SAV:    E    H    IAN            V    L    #       E      V    #      H   G  R   N   MN   R VI          S   
Conservation:  0331118301412534657466565555566881044685777797796677756677666535956866999376765756235316567757653553
STMI:                                                                                                             M
SS_PSIPRED:    H  HHHHHHH    EEEEEE HHHHHHHHHHHHH   EEEEE      HHHHHH           HHHHHHHHHEEEE   HHHHHHHHHH  HHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHH  EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HH HHHHH   EEEH     HHHHHHH  EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H  HHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHH  EEEE    HHHHHHHHH   EEE      HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                                    D   D                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRD 800
PathogenicSAV:         M                     D      S   Y R                                            R           
gnomAD_SAV:    S I     M V           V L   V                       S  E ASH                IR VI  VN  F   #   # V* 
Conservation:  7654677766767747556764456737667999997776777797946645765244323565322436745354365634623642964655865342
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH   HHHHH         HH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH HHHHHH       HH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                              N   D                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNRMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVER 900
gnomAD_SAV:        S    V               C       C     G     S      V       LSL         P     F      L   LL         
Conservation:  3235895888689587588787854575425361437454643643556553485556452656534455323131443361325532322353230142
STMI:                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        EE      HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:            EEEHHHHHHHHHHHHHH       EEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        2
AA:            SREKIQKHVSSTSSSFLEV 919
gnomAD_SAV:    N  MM M   L   FS  I
Conservation:  1131010001103002342
SS_PSIPRED:    HHHHHH             
SS_SPIDER3:     HHHH              
SS_PSSPRED:    HHHH               
DO_DISOPRED3:    DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:        DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: