Q00341  VIGLN_HUMAN

Gene name: HDLBP   Description: Vigilin

Length: 1268    GTS: 8.508e-07   GTS percentile: 0.159     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 453      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSSVAVLTQESFAEHRSGLVPQQIKVATLNSEEESDPPTYKDAFPPLPEKAACLESAQEPSGAWGNKIRPIKASVITQVFHVPLEERKYKDMNQFGEGEQ 100
BenignSAV:                                A                                A                                       
gnomAD_SAV:       IEI             IL     DAPK KG GNL  CR T             V     SSE E Q V                             
Conservation:  9253486435331354533011112353020124222624245435554411115111531244234533312424644424645443565124635834
SS_PSIPRED:                                           HHHH       HHH                      EEEEEEEEHHHHHH  HH    HHH
SS_SPIDER3:        H   HHHHHHH                         HHH         HHHH                    EEEEE  HHHH      H  HHHH
SS_PSSPRED:                HHH                                                             EEEEEEEHHHHHHH      HHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:                         DDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDD    DDD DD        D                         DDD       
MODRES_P:             T  S                   S   S                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKICLEIMQRTGAHLELSLAKDQGLSIMVSGKLDAVMKARKDIVARLQTQASATVAIPKEHHRFVIGKNGEKLQDLELKTATKIQIPRPDDPSNQIKITG 200
gnomAD_SAV:     E  I  L      M             A    N  T     V  G K   L S  V R R         #              M HL  S D      
Conservation:  5645456544667467654376689563849424363363323333443343333257555558555335583546574456545353634142163316
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH  EEEEE      EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHH HH       HHHHHHHH  EEEE         EEEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH  EEEE        EEEEEE HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE EHHHHHEHE     EHHHHHHHH  EEEE        EEEEE 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH  EEEEE      EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE  HHHHHHH     HHHHHHHHHH  EEE         EEEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TKEGIEKARHEVLLISAEQDKRAVERLEVEKAFHPFIAGPYNRLVGEIMQETGTRINIPPPSVNRTEIVFTGEKEQLAQAVARIKKIYEEKKKKTTTIAV 300
BenignSAV:                                 I                     D                                                 
gnomAD_SAV:         K  C  IS #     RH M    L  #   I T        DV  D  A#  V LSGM #A VI   D    V    H       N N   AV  
Conservation:  4332236424554446445563766542469456955346435122420444434543364832424543254642733413135222325222544614
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE  HHH HHH     HHHHHHHHHH  EEE         EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEE   HHH HHH     HHHHHHHHHH  EEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE  HHH         HHHHHHHHHH  EEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DD                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                           DD 
MODRES_P:                                                                                                    TT    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EVKKSQHKYVIGPKGNSLQEILERTGVSVEIPPSDSISETVILRGEPEKLGQALTEVYAKANSFTVSSVAAPSWLHRFIIGKKGQNLAKITQQMPKVHIE 400
gnomAD_SAV:        C         A            CI V     N      * KA N  H     C   S   IC  T#A          R     TV  KLSEG   
Conservation:  3477785574566535275877726679574745550873445545754774555664265443252241566869656686474454456232569365
SS_PSIPRED:    EE HHH  EEE      HHHHHHHH  EEE         EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE  HHHHH       HHHHHHHHH    EEE
SS_SPIDER3:    E  HHH  EEE     EHHHHHHHH  EEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE HHHHHH        HHHHHHH   EEEE
SS_PSSPRED:    EE HHH           HHHHHHHH  EEE         EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE  HHHHHH     HHHHHHHHHH   EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                         D              DD  DD                                                         
MODRES_P:                      S                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FTEGEDKITLEGPTEDVNVAQEQIEGMVKDLINRMDYVEINIDHKFHRHLIGKSGANINRIKDQYKVSVRIPPDSEKSNLIRIEGDPQGVQQAKRELLEL 500
BenignSAV:                      S                                                                                  
gnomAD_SAV:         #R      A YIH V    D #L        C  #T      G            VE ECR      T     K  CV   L  M  S Q     
Conservation:  9836463634656436511540445144168216556265147244454646324224756572479574737726252378688662863265669376
SS_PSIPRED:    E      EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE  HHHHHHH     HHHHHHHHHH  EEE          EEEE  HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    E     EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE  HHHHHHH       HHHHHHHH  EEE          EEEE  HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE  HHHHHHHH    HHHHHHHHHH  EEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:     DDDD D DDDDDDDD DDD                                               D       DDDDDDDDDD       DDDD   
MODRES_P:                                          Y                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASRMENERTKDLIIEQRFHRTIIGQKGERIREIRDKFPEVIINFPDPAQKSDIVQLRGPKNEVEKCTKYMQKMVADLVENSYSISVPIFKQFHKNIIGKG 600
gnomAD_SAV:      # G  H   IS     YH M      W H  # #V             G N     S             # V    S      L      RS T   
Conservation:  7255642224655666446557796977475767479977363896523977677667774757673275153426538545645557485686668688
SS_PSIPRED:    HHHHH    EEEEE HHHHHHH     HHHHHHHHH   EEE    HH    EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE HHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHH            HHHHHHH      HHHHHHHH  EEEEE          EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHH        HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH   EEE          EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE  HHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                      DDDD                                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D         D                                        DDDDDD                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GANIKKIREESNTKIDLPAENSNSETIIITGKRANCEAARSRILSIQKDLANIAEVEVSIPAKLHNSLIGTKGRLIRSIMEECGGVHIHFPVEGSGSDTV 700
gnomAD_SAV:     TK                 K S      R  Q S    #           SV K  I  T  V    T N S#  CT T   S I     M   E   I
Conservation:  5366646444538584874565686386758551586395146734854533114133134326532533233342264345975544686023553324
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHH  EEE         EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHH     HHHHHHHHHH  EEEE         EE
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHH  EE          EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHH      HHHHHHHHH  EEEEE        EE
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHH   EE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHH    HHHHHHHHHHH  EEEE         EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:     D    D  DDDDDDDD                                                                                  
MODRES_P:                                                  S                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VIRGPSSDVEKAKKQLLHLAEEKQTKSFTVDIRAKPEYHKFLIGKGGGKIRKVRDSTGARVIFPAAEDKDQDLITIIGKEDAVREAQKELEALIQNLDNV 800
BenignSAV:                                     H                                                                   
gnomAD_SAV:    IM   FL   N TQ     VGKR        MCT  G     VS R V  # LH  S  HAF  V   T       T    TIQ        SVR   D 
Conservation:  2437521243474236717754454464521534764984865676835544655198555387113516443586394535512543385075258455
SS_PSIPRED:    EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHH     HHHHHHHHHH  EEE          EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE  HHHHHHHH    HHHHHHHHH   EEE          EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE  HHHHHHH    HHHHHHHHHHH  EEE          EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D DDD       DDD                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VEDSMLVDPKHHRHFVIRRGQVLREIAEEYGGVMVSFPRSGTQSDKVTLKGAKDCVEAAKKRIQEIIEDLEAQVTLECAIPQKFHRSVMGPKGSRIQQIT 900
gnomAD_SAV:    ADNF    R  RHR I  K H  Q   KDC   I N     RHRNT I   # G    G  LV   T E   *    YTV R      L LR     *  
Conservation:  7780616415465594277966852346669843657755422413527694549665436443542239234522451424235433665240444354
SS_PSIPRED:    EEEEEE  HHH        HHHHHHHHHHH  EEEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEE  HHHHHH      HHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEEE  HHH          HHHHHHHH   EEEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH H EEEEEE  HHHHHH        HHHHH
SS_PSSPRED:    EEEEEE  HHH        HHHHHHHHHHH  EEEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEE  HHH          HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                        D     D   D                                          DD        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RDFSVQIKFPDREENAVHSTEPVVQENGDEAGEGREAKDCDPGSPRRCDIIIISGRKEKCEAAKEALEALVPVTIEVEVPFDLHRYVIGQKGSGIRKMMD 1000
gnomAD_SAV:    Q  N   R      DT RT #     H  K A  G  Q  ES   WKY   F F W Q  AS  KV  TF    T  K A GF #CIV     R C   E
Conservation:  6721946888443302210131012545310020220211330233649481638628486181259145795623526635673668644724555563
SS_PSIPRED:    HH   EEE   HH                                    EEEEE  HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE  HHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH  EEE               E                          EEEE  HHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHH     HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H    EEE                                         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE HHHHHHH     HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                     
DO_SPOTD:                     DDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                        
DO_IUPRED2A:              D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                           
MODRES_A:                                                                                                K         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EFEVNIHVPAPELQSDIIAITGLAANLDRAKAGLLERVKELQAEQEDRALRSFKLSVTVDPKYHPKIIGRKGAVITQIRLEHDVNIQFPDKDDGNQPQDQ 1100
gnomAD_SAV:    D       #T   L    T M  TT S W R   M C    R K QE#V          GA       R      S  #          N    K S   
Conservation:  4668432453452354252659623343584035224321842422465675656232647655699795596464364035354545944334064752
SS_PSIPRED:    HH  EEE          EEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE HHH   HH    HHHHHHHHHH  EEE            E
SS_SPIDER3:    HH  EEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH   EEEEEE  HHH HHHE     EHHHHHHHH  EEE            E
SS_PSSPRED:    HH EEEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE HHH         HHHHHHHHHH  EEE            E
DO_DISOPRED3:                                          DDDD                                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:        D                                                                               DDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ITITGYEKNTEAARDAILRIVGELEQMVSEDVPLDHRVHARIIGARGKAIRKIMDEFKVDIRFPQSGAPDPNCVTVTGLPENVEEAIDHILNLEEEYLAD 1200
gnomAD_SAV:          K    V G   PKF  K  E    EIL H  I  HV  V#    # TL KLR   HL   ED     IPGM        T N   H      TH
Conservation:  6153633253227315821461356467633516525665678936684646495475763566525513552646594860832766846589755622
SS_PSIPRED:    EEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH    HHHHHHHHHHH  EEE          EEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH H H     HHHHHHHHHH  EEEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH   HHHHHHHHHHH  EEEE         EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD                                                      D  D  D DDDDDDDDDDD                    

                       10        20        30        40        50        60        
AA:            VVDSEALQVYMKPPAHEEAKAPSRGFVVRDAPWTASSSEKAPDMSSSEEFPSFGAQVAPKTLPWGPKR 1268
BenignSAV:                                                                    L    
gnomAD_SAV:    M  #QS      L VYK G         #     T  N     VN       V VH     V    RQ
Conservation:  32236222132531013101125475224448613112242432353435513112212123286642
SS_PSIPRED:           EE                EEE                                        
SS_SPIDER3:           E E    HH HH      EEE   EEE                                  
SS_PSSPRED:        HHH        HHHH       EE                  HHH                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                          DDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:            D DDDD    DDDDD DD  D DDDD DDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD  D  DDDDD
MODRES_P:                                                    S    S